More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_1441 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_2407  MotA/TolQ/ExbB proton channel  100 
 
 
238 aa  482  1e-135  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.18242  normal  0.658816 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1441  MotA/TolQ/ExbB proton channel  100 
 
 
238 aa  482  1e-135  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3312  MotA/TolQ/ExbB proton channel  90.76 
 
 
238 aa  444  1.0000000000000001e-124  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3075  MotA/TolQ/ExbB proton channel  84.45 
 
 
239 aa  417  1e-116  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00179933  normal  0.181057 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4623  MotA/TolQ/ExbB proton channel  81.59 
 
 
240 aa  403  1e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.89868  hitchhiker  0.000034158 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1806  MotA/TolQ/ExbB proton channel  78.99 
 
 
238 aa  388  1e-107  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.388089  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3052  MotA/TolQ/ExbB proton channel  79.75 
 
 
238 aa  380  1e-105  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2569  MotA/TolQ/ExbB proton channel  70.25 
 
 
242 aa  345  3e-94  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0695018  hitchhiker  0.0010528 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2278  MotA/TolQ/ExbB proton channel  69.09 
 
 
243 aa  314  8e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.314419  normal  0.0287229 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2236  MotA/TolQ/ExbB proton channel  67.73 
 
 
242 aa  310  1e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.787404  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1946  MotA/TolQ/ExbB proton channel  65.49 
 
 
243 aa  307  9e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.979192  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1793  MotA/TolQ/ExbB proton channel  66.22 
 
 
242 aa  303  1.0000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.418463 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2117  MotA/TolQ/ExbB proton channel  66.22 
 
 
242 aa  303  1.0000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.065084  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3141  biopolymer transport transmembrane protein, MotA/TolQ/ExbB like  64.6 
 
 
242 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.346915  normal  0.0492826 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5528  MotA/TolQ/ExbB proton channel  64.63 
 
 
243 aa  300  9e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2117  MotA/TolQ/ExbB proton channel  63.76 
 
 
243 aa  300  1e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1408  MotA/TolQ/ExbB proton channel  64.16 
 
 
243 aa  300  1e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.108659 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2238  MotA/TolQ/ExbB proton channel  63.76 
 
 
243 aa  300  1e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0618  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  62.88 
 
 
242 aa  299  2e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.948348  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1077  MotA/TolQ/ExbB proton channel  63.76 
 
 
243 aa  299  2e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0521  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  62.88 
 
 
242 aa  299  3e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.154816  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2224  MotA/TolQ/ExbB proton channel  63.76 
 
 
244 aa  298  5e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283867  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2199  MotA/TolQ/ExbB proton channel  63.76 
 
 
244 aa  298  5e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5878  MotA/TolQ/ExbB proton channel  63.76 
 
 
244 aa  298  5e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2063  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  62.45 
 
 
242 aa  296  2e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.692674  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1802  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  62.45 
 
 
242 aa  296  2e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1091  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  62.45 
 
 
242 aa  296  2e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0799  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  62.45 
 
 
242 aa  296  2e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2025  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  63.01 
 
 
233 aa  293  2e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.371376  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1931  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  62.73 
 
 
234 aa  291  6e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.908791  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1964  biopolymer transport transmembrane protein  64.41 
 
 
243 aa  281  7.000000000000001e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.368694  normal  0.425469 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6110  MotA/TolQ/ExbB proton channel  56.11 
 
 
246 aa  263  2e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2476  bipolymer transport protein MotA/TolQ/ExbB family  56.49 
 
 
262 aa  262  4e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.127088  normal  0.824305 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1053  MotA/TolQ/ExbB proton channel  52.4 
 
 
250 aa  256  2e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1142  MotA/TolQ/ExbB proton channel  48.67 
 
 
230 aa  234  1.0000000000000001e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1148  MotA/TolQ/ExbB proton channel  50.68 
 
 
246 aa  226  4e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0814  MotA/TolQ/ExbB proton channel  49.55 
 
 
265 aa  223  1e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3519  MotA/TolQ/ExbB proton channel  51.26 
 
 
253 aa  219  3e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.874446  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5007  MotA/TolQ/ExbB proton channel  48.02 
 
 
304 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.119067 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4695  MotA/TolQ/ExbB proton channel  49.77 
 
 
303 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7325  MotA/TolQ/ExbB proton channel  48.42 
 
 
311 aa  212  3.9999999999999995e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.983112 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1755  biopolymer transport ExbB protein  46.67 
 
 
307 aa  211  9e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.449833 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1731  MotA/TolQ/ExbB proton channel  47.53 
 
 
301 aa  210  1e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.471993  normal  0.437872 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0382  putative MotA/TolQ/ExbB proton channel  47.35 
 
 
309 aa  210  1e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0926632 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1716  MotA/TolQ/ExbB proton channel  47.53 
 
 
303 aa  210  2e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6362  MotA/TolQ/ExbB proton channel  47.53 
 
 
303 aa  210  2e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.413769  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1938  MotA/TolQ/ExbB proton channel  48.42 
 
 
263 aa  209  4e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.251082 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1441  MotA/TolQ/ExbB proton channel  47.03 
 
 
301 aa  207  1e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4355  MotA/TolQ/ExbB proton channel  47.87 
 
 
262 aa  204  1e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0574  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.89 
 
 
237 aa  203  1e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0890694  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2999  biopolymer transport transmembrane protein, ExbB/TolQ  46.98 
 
 
301 aa  202  3e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2088  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.84 
 
 
355 aa  202  4e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0210896  normal  0.899093 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3174  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.83 
 
 
301 aa  202  4e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.876301  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0996  MotA/TolQ/ExbB proton channel  47.47 
 
 
299 aa  200  1.9999999999999998e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.970363 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0688  MotA/TolQ/ExbB proton channel  46.92 
 
 
307 aa  199  3e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1120  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.44 
 
 
286 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4497  MotA/TolQ/ExbB proton channel  46.43 
 
 
242 aa  192  4e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0752  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.95 
 
 
201 aa  191  1e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.50819  normal  0.699142 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1115  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.59 
 
 
247 aa  190  2e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.955363  normal  0.19888 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3719  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  43.04 
 
 
247 aa  186  3e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.561641  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0712  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  45.33 
 
 
250 aa  185  5e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0154333 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0877  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.55 
 
 
249 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0394331  normal  0.0815705 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1021  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.55 
 
 
249 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00477503  normal  0.0346927 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1048  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.13 
 
 
254 aa  182  3e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3234  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.29 
 
 
278 aa  181  6e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0010  biopolymer transport ExbB protein  43.66 
 
 
254 aa  181  1e-44  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0118  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.37 
 
 
241 aa  180  2e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.604603  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0010  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.19 
 
 
254 aa  179  4e-44  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.686858  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03475  biopolymer transport ExbB protein  44.91 
 
 
253 aa  173  1.9999999999999998e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0911  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  47.93 
 
 
253 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1531  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.91 
 
 
300 aa  171  9e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1572  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.56 
 
 
266 aa  168  5e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.36409 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3382  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.3 
 
 
238 aa  165  5e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000129068 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2734  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.54 
 
 
222 aa  164  9e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2590  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.44 
 
 
250 aa  164  9e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000318132 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0009  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.4 
 
 
253 aa  162  4.0000000000000004e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00486785 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0547  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.54 
 
 
222 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.232514  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0573  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.54 
 
 
222 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.250468 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3738  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.13 
 
 
222 aa  159  3e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.219229 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4552  MotA/TolQ/ExbB proton channel  46.01 
 
 
222 aa  159  3e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0574  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  43.5 
 
 
236 aa  159  3e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0477  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.36 
 
 
233 aa  159  4e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0652  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.07 
 
 
222 aa  159  5e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.274251  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0169  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.07 
 
 
222 aa  159  5e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0619  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.07 
 
 
222 aa  158  7e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.701482  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0862  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.34 
 
 
240 aa  157  1e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.286551  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0756  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.67 
 
 
217 aa  157  1e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0016  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.33 
 
 
249 aa  155  6e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3269  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.81 
 
 
222 aa  153  2.9999999999999998e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1209  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  44.59 
 
 
235 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.484595  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3921  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.81 
 
 
219 aa  152  2.9999999999999998e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2455  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  44.2 
 
 
235 aa  152  4e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3454  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  44.2 
 
 
235 aa  152  4e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2642  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  44.2 
 
 
235 aa  152  4e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0372  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  44.2 
 
 
235 aa  152  4e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1231  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  44.2 
 
 
235 aa  152  4e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3452  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  44.2 
 
 
235 aa  152  4e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.203481  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3788  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.75 
 
 
237 aa  150  1e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0280  transport protein ExbB  41.74 
 
 
239 aa  150  2e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3417  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  43.75 
 
 
235 aa  150  2e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>