More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2896 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_2896  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  100 
 
 		 171 aa  345  1e-94  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.386622  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3745  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  73.33 
 
 		 172 aa  246  1e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000214698  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3616  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  71.78 
 
 		 164 aa  226  1e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000178252  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0503  acetolactate synthase, small subunit  57.59 
 
 		 170 aa  188  2.9999999999999997e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.723319  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0224  acetolactate synthase, small subunit  55.28 
 
 		 164 aa  187  4e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.708645  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1071  acetolactate synthase, small subunit  55.83 
 
 		 167 aa  184  6e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00570032  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0111  acetolactate synthase, small subunit  53.01 
 
 		 165 aa  183  1.0000000000000001e-45  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.849988  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0709  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  55.28 
 
 		 161 aa  181  3e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0219  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  56.25 
 
 		 161 aa  180  8.000000000000001e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.680597  normal  0.0364419 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2517  acetolactate synthase, small subunit  54.76 
 
 		 170 aa  178  2.9999999999999997e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000223689  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3436  acetolactate synthase, small subunit  51.79 
 
 		 169 aa  176  2e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00183335  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0591  acetolactate synthase, small subunit  54.66 
 
 		 166 aa  174  6e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000221035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1188  acetolactate synthase, small subunit  53.16 
 
 		 161 aa  172  9.999999999999999e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2400  acetolactate synthase, small subunit  55.7 
 
 		 161 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2145  acetolactate synthase, small subunit  54.78 
 
 		 160 aa  172  1.9999999999999998e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.168594  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10840  acetolactate synthase, small subunit  55.97 
 
 		 168 aa  172  2.9999999999999996e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0282  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  53.8 
 
 		 170 aa  169  1e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1467  acetolactate synthase, small subunit  51.25 
 
 		 170 aa  170  1e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000490839  normal  0.0250967 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08880  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  53.85 
 
 		 168 aa  168  3e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0606  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  53.7 
 
 		 167 aa  168  3e-41  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.211278 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0707  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  52.15 
 
 		 174 aa  167  5e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0953  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  48.15 
 
 		 169 aa  167  9e-41  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1675  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  47.53 
 
 		 169 aa  166  1e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1542  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  47.53 
 
 		 169 aa  166  1e-40  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0238  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  47.53 
 
 		 169 aa  166  1e-40  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2980  acetolactate synthase, small subunit  51.9 
 
 		 172 aa  166  1e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0119022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3022  acetolactate synthase, small subunit  51.9 
 
 		 172 aa  166  1e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0809645  normal  0.107141 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2257  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  53.16 
 
 		 172 aa  166  2e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1043  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  51.25 
 
 		 184 aa  166  2e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.678602  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4072  acetolactate synthase, small subunit  49.39 
 
 		 175 aa  165  2e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.896436  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2820  acetolactate synthase small subunit  50 
 
 		 174 aa  165  2.9999999999999998e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1234  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  51.83 
 
 		 169 aa  164  4e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.354058 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2983  acetolactate synthase, small subunit  51.92 
 
 		 166 aa  165  4e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00470165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3025  acetolactate synthase, small subunit  51.92 
 
 		 166 aa  165  4e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.897404  normal  0.20881 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1444  acetolactate synthase, small subunit  49.37 
 
 		 167 aa  164  5e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.336176  hitchhiker  0.00470003 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1241  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  51.92 
 
 		 167 aa  164  5e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0418826 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6020  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  51.25 
 
 		 168 aa  164  5e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.103742  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3579  acetolactate synthase, small subunit  49.68 
 
 		 185 aa  163  9e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00517433  normal  0.401314 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3553  acetolactate synthase, small subunit  50.92 
 
 		 174 aa  163  1.0000000000000001e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.177769  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3639  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  52.76 
 
 		 174 aa  163  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1091  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  52.15 
 
 		 174 aa  162  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7781  acetolactate synthase, small subunit  49.7 
 
 		 207 aa  163  1.0000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.460716 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1124  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  51.22 
 
 		 171 aa  161  3e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.539849  hitchhiker  0.0000778154 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0353  acetolactate synthase, small subunit  50 
 
 		 165 aa  161  4.0000000000000004e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.648118  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1887  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  50.32 
 
 		 172 aa  160  6e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00850496  normal  0.0767808 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1907  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  50.32 
 
 		 172 aa  160  6e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.348754  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1953  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  50.32 
 
 		 172 aa  160  6e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.146423  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1910  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  49.69 
 
 		 163 aa  160  8.000000000000001e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.370159  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2502  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  49.69 
 
 		 163 aa  159  1e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000850238  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1261  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  49.08 
 
 		 163 aa  160  1e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.105007  hitchhiker  0.000000415778 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0751  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  47.77 
 
 		 178 aa  158  3e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0683  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  46.58 
 
 		 169 aa  158  4e-38  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3229  acetolactate synthase, small subunit  49.06 
 
 		 167 aa  158  4e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1409  acetolactate synthase, small subunit  49.08 
 
 		 174 aa  157  6e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.678038 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1876  acetolactate synthase, small subunit  49.04 
 
 		 161 aa  157  7e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000339514 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08840  acetolactate synthase, small subunit  51.59 
 
 		 162 aa  157  8e-38  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.20928  normal  0.22405 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3719  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  47.85 
 
 		 163 aa  157  8e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.512898  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2038  acetolactate synthase, small subunit  50 
 
 		 166 aa  157  1e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.153751  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3021  acetolactate synthase, small subunit  49.38 
 
 		 166 aa  155  2e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000136695  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08540  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  46.01 
 
 		 169 aa  155  2e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.097945  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2863  acetolactate synthase, small subunit  50.94 
 
 		 167 aa  156  2e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18800  acetolactate synthase, small subunit  49.38 
 
 		 171 aa  155  3e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.425298  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0899  acetolactate synthase, small subunit  48.17 
 
 		 167 aa  155  3e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13017  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  49.68 
 
 		 168 aa  154  4e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0018972  normal  0.150654 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8058  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  47.85 
 
 		 174 aa  154  4e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.654374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4355  acetolactate synthase small subunit  49.06 
 
 		 172 aa  154  6e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00134295  normal  0.112952 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3391  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  50.96 
 
 		 184 aa  154  7e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.523212  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4238  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  48.41 
 
 		 166 aa  153  9e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.502745  normal  0.140358 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0012  acetolactate synthase, small subunit  45.68 
 
 		 167 aa  153  1e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.046385  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1909  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  47.5 
 
 		 168 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2557  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  47.83 
 
 		 163 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0881819  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2483  acetolactate synthase, small subunit  49.04 
 
 		 159 aa  151  4e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000111374  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2123  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  48.41 
 
 		 166 aa  150  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.160669  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1591  acetolactate synthase, small subunit  49.38 
 
 		 166 aa  150  7e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0719  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  48.41 
 
 		 172 aa  149  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1709  acetolactate synthase, small subunit  52.76 
 
 		 175 aa  149  2e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.529781 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1850  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  47.77 
 
 		 172 aa  149  2e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0190646  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1496  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  46.01 
 
 		 163 aa  149  2e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.440871 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01980  acetolactate synthase, small subunit  47.24 
 
 		 161 aa  148  3e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000298092  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1192  acetolactate synthase, small subunit  46.5 
 
 		 202 aa  148  4e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08471  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  47.17 
 
 		 176 aa  148  4e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3481  acetolactate synthase, small subunit  45.86 
 
 		 156 aa  147  5e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.171656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2434  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  48.41 
 
 		 172 aa  147  7e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.312888  normal  0.272193 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12301  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  46.84 
 
 		 176 aa  147  7e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0783462 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1556  acetolactate synthase, small subunit  44.59 
 
 		 180 aa  147  7e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1457  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  47.13 
 
 		 175 aa  146  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2745  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  44.79 
 
 		 163 aa  146  2.0000000000000003e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3652  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  46.5 
 
 		 172 aa  146  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000715125  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1781  acetolactate synthase, small subunit  43.67 
 
 		 164 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0752076 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4448  acetolactate synthase, small subunit  44.94 
 
 		 173 aa  146  2.0000000000000003e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0187  acetolactate synthase, small subunit  45.81 
 
 		 174 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2457  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  46.5 
 
 		 172 aa  146  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0832  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  48.41 
 
 		 178 aa  145  3e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.199975  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2519  acetolactate synthase small subunit  44.94 
 
 		 164 aa  145  3e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1967  acetolactate synthase, small subunit  43.31 
 
 		 180 aa  145  3e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0478269 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1164  acetolactate synthase, small subunit  52.15 
 
 		 174 aa  145  4.0000000000000006e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.686831  normal  0.036198 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_736  acetolactate synthase, small subunit  48.41 
 
 		 178 aa  144  4.0000000000000006e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.118552  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1908  acetolactate synthase small subunit  44.17 
 
 		 169 aa  144  8.000000000000001e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00435991  hitchhiker  0.0000119915 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3237  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  42.68 
 
 		 165 aa  144  9e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.761628  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2035  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  45.22 
 
 		 182 aa  143  1e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.403996 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>