32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1782 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_1782  prevent-host-death family protein  100 
 
 
78 aa  153  6e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1056  hypothetical protein  43.59 
 
 
105 aa  69.7  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.809655  normal  0.691667 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1315  prevent-host-death family protein  41.03 
 
 
78 aa  55.1  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.147155  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0061  prevent-host-death family protein  36.9 
 
 
93 aa  51.2  0.000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.933415  normal  0.536193 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2596  prevent-host-death family protein  37.5 
 
 
80 aa  50.1  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2983  prevent-host-death family protein  37.5 
 
 
80 aa  50.1  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.413921  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2762  prevent-host-death family protein  35.44 
 
 
82 aa  49.3  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.954217  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3784  hypothetical protein  56.76 
 
 
79 aa  44.3  0.0005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.640007  decreased coverage  0.000191951 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00630  Prevent-host-death protein  33.9 
 
 
76 aa  43.9  0.0007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000263999  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3369  prevent-host-death family protein  34.85 
 
 
86 aa  43.5  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0934085  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1204  prevent-host-death protein  39.66 
 
 
104 aa  43.1  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.760052  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1597  prevent-host-death family protein  40.43 
 
 
73 aa  42.4  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.356401  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4124  prevent-host-death family protein  36.49 
 
 
82 aa  42.4  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.167501  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1066  prevent-host-death family protein  52.5 
 
 
78 aa  42.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3011  prevent-host-death family protein  45 
 
 
92 aa  42.4  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2929  prevent-host-death family protein  43.75 
 
 
80 aa  42.4  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.106644 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2469  prevent-host-death family protein  51.28 
 
 
96 aa  42  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.117875  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2456  prevent-host-death family protein  37.66 
 
 
79 aa  42  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4551  prevent-host-death family protein  35.37 
 
 
80 aa  42  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3054  prevent-host-death family protein  50 
 
 
91 aa  41.6  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.326995  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2038  prevent-host-death family protein  45.24 
 
 
85 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1455  prevent-host-death family protein  43.18 
 
 
76 aa  41.2  0.005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11991  hypothetical protein  31.58 
 
 
90 aa  40.8  0.006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1901  prevent-host-death family protein  32.89 
 
 
78 aa  40.8  0.007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00389172  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0266  prevent-host-death family protein  42.86 
 
 
78 aa  40.4  0.007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000350638  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2397  prevent-host-death family protein  41.86 
 
 
83 aa  40.8  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3716  prevent-host-death family protein  44.68 
 
 
81 aa  40.8  0.007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0326037 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3172  prevent-host-death family protein  43.9 
 
 
53 aa  40.4  0.008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0729417  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0212  prevent-host-death family protein  35.71 
 
 
89 aa  40.4  0.009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.655671  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3368  prevent-host-death family protein  43.18 
 
 
79 aa  40  0.01  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0130004 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1406  prevent-host-death family protein  35.44 
 
 
79 aa  40  0.01  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.190407  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3504  hypothetical protein  37.29 
 
 
93 aa  40  0.01  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00000315772  normal  0.856807 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>