21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0904 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_0904  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  100 
 
 		 514 aa  1072    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000734912  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2228  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  56.6 
 
 		 526 aa  591  1e-167  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0314397  hitchhiker  0.0000846728 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0197  Eco57I restriction endonuclease  48.35 
 
 		 562 aa  493  9.999999999999999e-139  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0747  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  48.02 
 
 		 530 aa  482  1e-135  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.141575 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2422  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  48.37 
 
 		 531 aa  480  1e-134  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0501515  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0926  Eco57I restriction endonuclease  57.38 
 
 		 321 aa  345  1e-93  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.419584  normal  0.538577 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1454  Eco57I restriction endonuclease  29.33 
 
 		 1359 aa  206  6e-52  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1453  Eco57I restriction endonuclease  32.75 
 
 		 348 aa  187  4e-46  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1330  superfamily II DNA/RNA helicase  35.4 
 
 		 1462 aa  181  4e-44  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1697  type II restriction endonuclease, putative  33.33 
 
 		 1324 aa  147  4.0000000000000006e-34  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.431885 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1589  Eco57I restriction endonuclease  28.42 
 
 		 351 aa  124  3e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0924  type III restriction system endonuclease, putative  39.26 
 
 		 139 aa  102  1e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0708184  normal  0.517067 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0750  Eco57I restriction endonuclease  30.67 
 
 		 1364 aa  89  2e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000117598 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0513  Eco57I restriction endonuclease  25.21 
 
 		 341 aa  85.1  0.000000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.611279  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1676  Eco57I restriction endonuclease  26.1 
 
 		 665 aa  82.4  0.00000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0514  hypothetical protein  40.43 
 
 		 1108 aa  73.6  0.000000000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1677  type III restriction protein res subunit  32 
 
 		 1110 aa  62.4  0.00000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1588  type III restriction enzyme, res subunit  28.71 
 
 		 1094 aa  58.5  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0645  hypothetical protein  45.1 
 
 		 164 aa  55.5  0.000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.881182  normal  0.484596 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3141  N-6 DNA methylase  27.17 
 
 		 746 aa  49.7  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1469  type I restriction-modification system, M subunit, putative  25.27 
 
 		 1002 aa  46.2  0.002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>