More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_849 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET0976  adenylosuccinate synthetase  96.22 
 
 		 423 aa  835    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000393074  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_849  adenylosuccinate synthase  100 
 
 		 432 aa  885    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000104861  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0867  adenylosuccinate synthetase  96.3 
 
 		 432 aa  858    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000883365  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1841  Adenylosuccinate synthase  53.07 
 
 		 430 aa  479  1e-134  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.842522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4594  adenylosuccinate synthase  50 
 
 		 428 aa  459  9.999999999999999e-129  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1818  adenylosuccinate synthetase  48.81 
 
 		 430 aa  455  1e-127  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0200825  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1913  adenylosuccinate synthetase  48.57 
 
 		 430 aa  452  1.0000000000000001e-126  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4214  adenylosuccinate synthase  50.47 
 
 		 430 aa  451  1e-125  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.855707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0444  adenylosuccinate synthase  50.24 
 
 		 430 aa  450  1e-125  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.774885  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2354  adenylosuccinate synthetase  50.59 
 
 		 426 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0316685  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0010  adenylosuccinate synthetase  49.17 
 
 		 427 aa  444  1e-123  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000465701  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2207  adenylosuccinate synthetase  49.64 
 
 		 430 aa  442  1e-123  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1068  adenylosuccinate synthetase  49.88 
 
 		 428 aa  441  9.999999999999999e-123  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0706  adenylosuccinate synthetase  48.93 
 
 		 447 aa  437  1e-121  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3300  adenylosuccinate synthetase  47.98 
 
 		 428 aa  435  1e-121  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000123723  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0735  adenylosuccinate synthetase  48.93 
 
 		 447 aa  437  1e-121  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.772152 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4927  Adenylosuccinate synthase  47.04 
 
 		 427 aa  432  1e-120  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000089661  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0069  adenylosuccinate synthetase  49.41 
 
 		 432 aa  434  1e-120  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000215485  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0691  adenylosuccinate synthetase  47.84 
 
 		 439 aa  432  1e-120  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2309  adenylosuccinate synthetase  48.93 
 
 		 427 aa  434  1e-120  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0139427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4007  adenylosuccinate synthetase  46.67 
 
 		 429 aa  434  1e-120  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000037837  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3524  adenylosuccinate synthetase  47.51 
 
 		 444 aa  431  1e-119  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2053  adenylosuccinate synthetase  47.27 
 
 		 447 aa  428  1e-119  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3093  adenylosuccinate synthetase  47.74 
 
 		 424 aa  429  1e-119  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000909449  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3282  adenylosuccinate synthetase  47.74 
 
 		 437 aa  428  1e-119  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00809393  normal  0.019729 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0390  adenylosuccinate synthetase  48.22 
 
 		 429 aa  431  1e-119  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000168216  decreased coverage  0.00000000000000193534 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2132  adenylosuccinate synthetase  50.47 
 
 		 427 aa  430  1e-119  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000468413  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5577  adenylosuccinate synthetase  47.38 
 
 		 429 aa  428  1e-118  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.85689e-26 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5320  adenylosuccinate synthetase  47.38 
 
 		 429 aa  428  1e-118  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000159422  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5148  adenylosuccinate synthetase  47.38 
 
 		 429 aa  428  1e-118  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.87247e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5716  adenylosuccinate synthetase  47.38 
 
 		 429 aa  428  1e-118  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000188586  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4740  adenylosuccinate synthetase  47.74 
 
 		 449 aa  427  1e-118  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.947935 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0133  adenylosuccinate synthase  48.34 
 
 		 807 aa  426  1e-118  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.279104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1347  adenylosuccinate synthetase  45.84 
 
 		 428 aa  426  1e-118  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2536  adenylosuccinate synthetase  46.9 
 
 		 427 aa  422  1e-117  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0228  adenylosuccinate synthetase  46.7 
 
 		 431 aa  424  1e-117  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.043517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0017  adenylosuccinate synthetase  47.14 
 
 		 427 aa  422  1e-117  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000177457  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3012  adenylosuccinate synthetase  47.03 
 
 		 427 aa  423  1e-117  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0951897  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0139  adenylosuccinate synthetase  47.63 
 
 		 429 aa  423  1e-117  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000561019 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0504  adenylosuccinate synthetase  46.46 
 
 		 431 aa  422  1e-117  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0515  adenylosuccinate synthetase  46.46 
 
 		 431 aa  422  1e-117  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0017  adenylosuccinate synthetase  47.14 
 
 		 427 aa  422  1e-117  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10362  adenylosuccinate synthetase  46.23 
 
 		 432 aa  422  1e-117  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.698825  normal  0.94506 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3539  adenylosuccinate synthetase  45.71 
 
 		 428 aa  422  1e-117  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0526  adenylosuccinate synthetase  46.46 
 
 		 431 aa  422  1e-117  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0115  adenylosuccinate synthase  44.6 
 
 		 433 aa  419  1e-116  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1839  adenylosuccinate synthetase  47.51 
 
 		 437 aa  421  1e-116  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05641  adenylosuccinate synthetase  47.51 
 
 		 437 aa  421  1e-116  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.622975 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3410  adenylosuccinate synthetase  45.71 
 
 		 428 aa  419  1e-116  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07421  adenylosuccinate synthetase  46.15 
 
 		 439 aa  420  1e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2958  adenylosuccinate synthetase  49.17 
 
 		 428 aa  419  1e-116  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2641  adenylosuccinate synthetase  49.17 
 
 		 428 aa  419  1e-116  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.536345  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2909  Adenylosuccinate synthetase  45.95 
 
 		 429 aa  416  9.999999999999999e-116  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000270112  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0046  adenylosuccinate synthetase  50.24 
 
 		 426 aa  415  9.999999999999999e-116  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.268676  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0677  adenylosuccinate synthetase  45.28 
 
 		 431 aa  416  9.999999999999999e-116  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1667  adenylosuccinate synthetase  46.88 
 
 		 439 aa  417  9.999999999999999e-116  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3260  adenylosuccinate synthetase  47.99 
 
 		 430 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0574684  hitchhiker  0.00000000000114461 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05631  adenylosuccinate synthetase  46.32 
 
 		 436 aa  417  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2419  adenylosuccinate synthetase  47.98 
 
 		 424 aa  417  9.999999999999999e-116  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000351382  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05331  adenylosuccinate synthetase  46.08 
 
 		 436 aa  416  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11510  Adenylosuccinate synthetase  46.24 
 
 		 434 aa  416  9.999999999999999e-116  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.616964  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38190  adenylosuccinate synthetase  47.41 
 
 		 428 aa  415  9.999999999999999e-116  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5617  adenylosuccinate synthetase  46.9 
 
 		 429 aa  412  1e-114  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000421439  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5164  adenylosuccinate synthetase  47.14 
 
 		 429 aa  414  1e-114  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000038286  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5341  adenylosuccinate synthetase  46.9 
 
 		 429 aa  412  1e-114  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000698384  hitchhiker  0.0000000000916292 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05701  adenylosuccinate synthetase  46.08 
 
 		 436 aa  412  1e-114  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0507  adenylosuccinate synthetase  45.84 
 
 		 436 aa  413  1e-114  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2409  adenylosuccinate synthetase  46.08 
 
 		 444 aa  412  1e-114  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0382051  normal  0.0691331 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0367  adenylosuccinate synthetase  46.23 
 
 		 428 aa  412  1e-114  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5260  adenylosuccinate synthetase  46.9 
 
 		 429 aa  413  1e-114  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000740199  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05071  adenylosuccinate synthetase  45.61 
 
 		 437 aa  413  1e-114  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.22054  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5655  adenylosuccinate synthetase  47.14 
 
 		 429 aa  415  1e-114  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000753015  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0389  Adenylosuccinate synthase  47.03 
 
 		 427 aa  414  1e-114  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.899335  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0517  adenylosuccinate synthetase  44.1 
 
 		 428 aa  413  1e-114  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5594  adenylosuccinate synthetase  46.67 
 
 		 429 aa  410  1e-113  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000767866  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4368  adenylosuccinate synthetase  46.79 
 
 		 427 aa  410  1e-113  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.335736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0203  adenylosuccinate synthetase  47.03 
 
 		 427 aa  411  1e-113  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2209  adenylosuccinate synthase  47.63 
 
 		 430 aa  410  1e-113  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000023884  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0211  adenylosuccinate synthetase  46.32 
 
 		 427 aa  407  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.398163 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0330  adenylosuccinate synthetase  45.82 
 
 		 428 aa  407  1.0000000000000001e-112  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08920  adenylosuccinate synthetase  45.13 
 
 		 432 aa  407  1.0000000000000001e-112  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2533  adenylosuccinate synthase  46.68 
 
 		 426 aa  407  1.0000000000000001e-112  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000265596  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1280  adenylosuccinate synthetase  50.12 
 
 		 427 aa  407  1.0000000000000001e-112  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6908  adenylosuccinate synthetase  44.34 
 
 		 429 aa  403  1e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3308  adenylosuccinate synthetase  46.1 
 
 		 433 aa  404  1e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00120298  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0662  adenylosuccinate synthetase  46.1 
 
 		 431 aa  403  1e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.681047  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0025  adenylosuccinate synthetase  46.08 
 
 		 426 aa  402  1e-111  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.993316  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0271  adenylosuccinate synthetase  44.18 
 
 		 427 aa  403  1e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0492  adenylosuccinate synthetase  47.73 
 
 		 428 aa  402  1e-111  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0176  adenylosuccinate synthetase  47.03 
 
 		 427 aa  404  1e-111  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.386224  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27840  Adenylosuccinate synthetase  46.08 
 
 		 438 aa  399  9.999999999999999e-111  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0203  adenylosuccinate synthetase  46.34 
 
 		 431 aa  400  9.999999999999999e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.773480000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2149  adenylosuccinate synthetase  46.68 
 
 		 425 aa  401  9.999999999999999e-111  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.755328  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1452  adenylosuccinate synthetase  45.99 
 
 		 433 aa  401  9.999999999999999e-111  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.719728  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3138  adenylosuccinate synthetase  43.23 
 
 		 430 aa  400  9.999999999999999e-111  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.32892  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35160  Adenylosuccinate synthetase  43.97 
 
 		 429 aa  397  1e-109  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5137  adenylosuccinate synthetase  46.21 
 
 		 433 aa  397  1e-109  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5915  adenylosuccinate synthetase  46.57 
 
 		 439 aa  398  1e-109  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1460  adenylosuccinate synthetase  44.82 
 
 		 427 aa  397  1e-109  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.57165  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2126  adenylosuccinate synthetase  44.31 
 
 		 428 aa  395  1e-109  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>