47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_787 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_787  hypothetical protein  100 
 
 		 302 aa  632  1e-180  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0800  hypothetical protein  91.39 
 
 		 302 aa  590  1e-167  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0916  hypothetical protein  86.75 
 
 		 302 aa  565  1e-160  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.470991  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0525  hypothetical protein  36.44 
 
 		 276 aa  167  1e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.902286  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0501  hypothetical protein  36.44 
 
 		 276 aa  167  2e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.686369  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_466  hypothetical protein  36.03 
 
 		 276 aa  166  4e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.841701  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1565  3-isopropylmalate dehydratase  28.57 
 
 		 256 aa  89.4  7e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1398  hypothetical protein  28.98 
 
 		 261 aa  89  9e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.139952  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2882  protein of unknown function DUF75  27.35 
 
 		 251 aa  87.4  3e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.728218 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1007  protein of unknown function DUF75  25.62 
 
 		 250 aa  85.5  9e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2792  protein of unknown function DUF75  26.83 
 
 		 250 aa  83.2  0.000000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.147305  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1150  protein of unknown function DUF75  27.13 
 
 		 251 aa  77.4  0.0000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.13291  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1950  hypothetical protein  25.82 
 
 		 252 aa  68.6  0.0000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.622804 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5826  protein of unknown function DUF75  24.02 
 
 		 297 aa  67.8  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.22756  normal  0.126375 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1797  hypothetical protein  23.14 
 
 		 250 aa  64.7  0.000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0226  hypothetical protein  22.46 
 
 		 255 aa  64.3  0.000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0414  hypothetical protein  26.51 
 
 		 255 aa  62.8  0.000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.270771  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0959  protein of unknown function DUF75  26.44 
 
 		 256 aa  62.8  0.000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.405373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0859  hypothetical protein  23.14 
 
 		 250 aa  62.4  0.000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.776803  hitchhiker  0.00442614 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2052  hypothetical protein  24.19 
 
 		 248 aa  62  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1058  hypothetical protein  22.73 
 
 		 250 aa  60.8  0.00000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1077  hypothetical protein  19.75 
 
 		 299 aa  60.1  0.00000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.370003  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1126  hypothetical protein  24.89 
 
 		 251 aa  58.5  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0921  hypothetical protein  22.73 
 
 		 251 aa  57.8  0.0000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22220  uncharacterized protein (ATP-grasp superfamily)  21.26 
 
 		 290 aa  57.8  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.165906  normal  0.737687 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0888  protein of unknown function DUF75  23.78 
 
 		 311 aa  56.6  0.0000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0868  protein of unknown function DUF75  26.75 
 
 		 258 aa  56.2  0.0000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0725  hypothetical protein  24 
 
 		 226 aa  55.1  0.000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1826  hypothetical protein  22.68 
 
 		 281 aa  53.9  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0638514  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2504  protein of unknown function DUF75  27.06 
 
 		 255 aa  52.8  0.000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.496594  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2444  protein of unknown function DUF75  23.53 
 
 		 288 aa  51.6  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2210  protein of unknown function DUF75  22.71 
 
 		 298 aa  50.8  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1480  protein of unknown function DUF75  20.76 
 
 		 283 aa  50.4  0.00004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0007  hypothetical protein  21.72 
 
 		 236 aa  49.7  0.00006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.121063  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0198  hypothetical protein  22.61 
 
 		 257 aa  47.4  0.0003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5919  hypothetical protein  20.92 
 
 		 284 aa  46.6  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.239178  normal  0.0316841 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0721  hypothetical protein  23.62 
 
 		 235 aa  46.6  0.0005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.538394  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1741  hypothetical protein  23.12 
 
 		 235 aa  46.2  0.0006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.300848  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3475  hypothetical protein  22.3 
 
 		 296 aa  45.4  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1855  hypothetical protein  20.61 
 
 		 284 aa  45.4  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.982924 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1196  protein of unknown function DUF75  21.09 
 
 		 296 aa  44.7  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00179103  normal  0.0638399 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2246  protein of unknown function DUF75  22.99 
 
 		 283 aa  44.7  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.640776  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2630  hypothetical protein  21.78 
 
 		 282 aa  44.3  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0465  hypothetical protein  23.11 
 
 		 245 aa  43.5  0.004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0485311  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2290  protein of unknown function DUF75  21.14 
 
 		 286 aa  42.7  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00121228  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1297  hypothetical protein  24.89 
 
 		 252 aa  42.4  0.009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.607867 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1086  3-isopropylmalate dehydratase  22.13 
 
 		 248 aa  42.4  0.01  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>