92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_0058 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_0058  spore germination protein  100 
 
 
370 aa  721    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.962325  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2279  spore germination protein  27.87 
 
 
361 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.594661  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1460  spore germination protein  28.57 
 
 
363 aa  114  3e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2041  spore germination protein  28.1 
 
 
365 aa  106  7e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3011  spore germination protein  25.56 
 
 
368 aa  95.9  1e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3283  spore germination protein  26.71 
 
 
368 aa  87.8  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00764242  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0802  spore germination protein  24.3 
 
 
369 aa  84  0.000000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.116042  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2711  spore germination protein  25 
 
 
356 aa  83.2  0.000000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.13872 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1955  spore germination protein  26.14 
 
 
368 aa  80.5  0.00000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.226978  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1970  spore germination protein  26.14 
 
 
370 aa  79.7  0.00000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0135  spore germination protein KB  27.85 
 
 
363 aa  79.7  0.00000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0786336  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0873  spore germination protein  24.04 
 
 
362 aa  77.8  0.0000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1192  hypothetical protein  23.86 
 
 
366 aa  75.1  0.000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0296  spore germination protein  25.32 
 
 
385 aa  73.6  0.000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3137  spore germination protein A2  25.91 
 
 
363 aa  72.8  0.000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2102  spore germination protein A2  25.91 
 
 
363 aa  73.2  0.000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2565  spore germination protein  23.84 
 
 
357 aa  72.8  0.000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.760269 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2166  spore germination protein  24.23 
 
 
370 aa  72.4  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.444413  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3655  spore germination protein  25.47 
 
 
364 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2852  spore germination protein; amino acid permease  25.45 
 
 
363 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000387723  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3166  spore germination protein A2  25.45 
 
 
363 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.350807  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3333  spore germination protein; amino acid permease  24 
 
 
365 aa  69.7  0.00000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2340  spore germination protein  26.98 
 
 
367 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00328418  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2665  spore germination protein  27.38 
 
 
377 aa  68.2  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0781  spore germination protein  26.32 
 
 
360 aa  66.2  0.0000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.173787  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3583  spore germination protein  24.67 
 
 
365 aa  66.2  0.0000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0603  spore germination protein  21.51 
 
 
363 aa  65.9  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.18587  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3683  spore germination protein  23.47 
 
 
365 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0055  spore germination protein  24.91 
 
 
369 aa  66.2  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1011  spore germination protein  23.21 
 
 
361 aa  64.7  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3283  spore germination protein; amino acid permease  24.4 
 
 
365 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.946646  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5574  spore germination protein  26.05 
 
 
367 aa  65.1  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal  0.300189 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2664  spore germination protein  26.07 
 
 
362 aa  64.3  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3656  spore germination protein  23.21 
 
 
365 aa  63.9  0.000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3591  spore germination protein  25.98 
 
 
365 aa  64.3  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1012  spore germination protein  26.32 
 
 
359 aa  63.9  0.000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000935312 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2766  spore germination protein  24.06 
 
 
368 aa  63.5  0.000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000369492  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3600  spore germination protein  22.61 
 
 
365 aa  63.5  0.000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1708  GerZB  24.77 
 
 
367 aa  63.5  0.000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000089692 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3365  spore germination protein  24.2 
 
 
360 aa  62  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000593195  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2903  spore germination protein  26.36 
 
 
363 aa  62.8  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00161423  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2063  spore germination protein  22.42 
 
 
373 aa  62.8  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.722464  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3634  spore germination protein  25.27 
 
 
365 aa  62  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3370  spore germination protein  25.27 
 
 
365 aa  62  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0354912  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3159  spore germination protein A2  25.91 
 
 
363 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.165697 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0051  spore germination protein  28.45 
 
 
359 aa  60.8  0.00000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0844  spore germination protein  23.33 
 
 
364 aa  60.1  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3200  hypothetical membrane protein  27.43 
 
 
366 aa  60.5  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0136  spore germination protein  20.95 
 
 
365 aa  59.7  0.00000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00122585  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1633  spore germination protein  23.88 
 
 
365 aa  59.3  0.00000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2927  spore germination protein  27.23 
 
 
306 aa  58.5  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.495537  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0522  Spore germination protein  26.02 
 
 
367 aa  57.8  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.234591  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0439  spore germination protein  23.81 
 
 
374 aa  57.8  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2435  spore germination protein  24.16 
 
 
365 aa  56.6  0.0000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2466  spore germination protein  22.47 
 
 
367 aa  54.7  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0079  hypothetical protein  25.9 
 
 
374 aa  54.7  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4564  spore germination protein  23.34 
 
 
364 aa  55.1  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0604  spore germination protein  23.26 
 
 
369 aa  55.1  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00110  spore germination protein  23.62 
 
 
365 aa  53.9  0.000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1561  spore germination protein  25.84 
 
 
368 aa  53.9  0.000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.636005  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1733  spore germination protein  25.85 
 
 
369 aa  53.1  0.000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0363147  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2459  spore germination protein  22.96 
 
 
364 aa  52.8  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0074  hypothetical protein  24.91 
 
 
365 aa  52  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0702  spore germination protein GerKB  22.48 
 
 
369 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3073  spore germination protein  27.27 
 
 
366 aa  51.6  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3409  spore germination protein  23.9 
 
 
364 aa  49.7  0.00007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2954  spore germination protein  20.23 
 
 
364 aa  49.7  0.00009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0391  spore germination protein GerHB  23.56 
 
 
364 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4465  spore germination protein IB  21.68 
 
 
366 aa  48.5  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0224  spore germination protein XB  22.57 
 
 
359 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000100251 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2754  spore germination protein XB  21.65 
 
 
363 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0830054  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1937  spore germination protein  27.73 
 
 
363 aa  47.4  0.0004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0547  spore germination protein  22.11 
 
 
368 aa  47  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4875  spore germination protein GerHB  24.2 
 
 
366 aa  47  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4870  spore germination protein GerHB  24.2 
 
 
366 aa  46.6  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0663  spore germination protein B  24.03 
 
 
369 aa  46.6  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0832  spore germination protein GerYB  23.94 
 
 
369 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.11818e-54 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3120  spore germination protein QB  21.91 
 
 
360 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4631  spore germination protein GerHB  23.42 
 
 
364 aa  45.8  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0675  GerB family spore germination protein  23.94 
 
 
369 aa  45.8  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2457  spore germination protein  24.84 
 
 
359 aa  45.8  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4985  spore germination protein GerHB  23.42 
 
 
364 aa  45.8  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4853  spore germination protein GerHB  27.68 
 
 
364 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0156  spore germination protein xb  22.1 
 
 
355 aa  45.1  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2887  GerB family spore germination protein  21.91 
 
 
360 aa  44.7  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.070382  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0827  spore germination protein  23.15 
 
 
411 aa  44.3  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4845  spore germination protein GerHB  22.11 
 
 
364 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0774693  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3141  spore germination protein, GerB family  21.91 
 
 
360 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.543327 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4484  spore germination protein IB  21.55 
 
 
366 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2117  spore germination protein, GerB family  21.55 
 
 
360 aa  43.9  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4667  spore germination protein GerKB  21.41 
 
 
368 aa  43.9  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  6.310599999999999e-21 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0545  spore germination protein KB  21.58 
 
 
368 aa  42.7  0.01  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>