More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0680 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008010  Dgeo_2741  transposase, IS605 OrfB  96.14 
 
 
518 aa  794    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.230719  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0680  transposase, IS605 OrfB  100 
 
 
414 aa  849    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.143761 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0877  IS605 family transposase OrfB  32.94 
 
 
372 aa  158  1e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000122455  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2211  transposase IS605  32.47 
 
 
371 aa  150  3e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3539  transposase, IS605 OrfB family  34.5 
 
 
375 aa  148  1.0000000000000001e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.3879  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0563  transposase, IS605 OrfB family  34.5 
 
 
375 aa  148  1.0000000000000001e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.11437 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0541  transposase, IS605 OrfB family  30.63 
 
 
372 aa  146  6e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2881  transposase, IS605 OrfB family  31.62 
 
 
388 aa  143  6e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2549  transposase, IS605 OrfB family  36.45 
 
 
400 aa  140  4.999999999999999e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2685  transposase, IS605 OrfB family  37.96 
 
 
351 aa  139  6e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1982  transposase, IS605 OrfB family  35.98 
 
 
351 aa  139  7e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2016  transposase  30.23 
 
 
372 aa  139  7.999999999999999e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2374  transposase, IS605 OrfB family  36.45 
 
 
351 aa  139  7.999999999999999e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1116  transposase, IS605 OrfB family  34.3 
 
 
374 aa  138  1e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.309085  normal  0.355527 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1200  transposase, IS605 OrfB family  34.3 
 
 
374 aa  138  1e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0919979  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0800  transposase  30.93 
 
 
373 aa  139  1e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2902  transposase  34.29 
 
 
407 aa  138  2e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00617488  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2840  transposase, IS605 OrfB family  36.45 
 
 
351 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3343  transposase, IS605 OrfB family  36.45 
 
 
351 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1161  transposase, IS605 OrfB family  29.74 
 
 
372 aa  136  6.0000000000000005e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.292734  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1692  transposase  33.16 
 
 
358 aa  132  9e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.153302  normal  0.603744 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4043  transposase, OrfB family  32.44 
 
 
371 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1366  transposase IS605 OrfB domain-containing protein  32 
 
 
371 aa  130  6e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3330  Transport-associated OB domain protein  32.22 
 
 
418 aa  129  8.000000000000001e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0133521  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2903  IS605 family transposase OrfB  32 
 
 
371 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0029358  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7429  transposase  32.81 
 
 
358 aa  129  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.332742 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1250  transposase, IS605 OrfB family  28.31 
 
 
372 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1199  transposase IS605  32.48 
 
 
410 aa  127  4.0000000000000003e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0968514  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1428  transposase, IS605 OrfB family  39.38 
 
 
385 aa  127  4.0000000000000003e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.996106  normal 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3626  transposase, IS605 OrfB family  31.46 
 
 
425 aa  127  4.0000000000000003e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0563  transposase, IS605 OrfB family  28.04 
 
 
372 aa  127  5e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3375  transposase, IS605 OrfB family  30.97 
 
 
412 aa  126  9e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0928  transposase, IS605 OrfB  30.75 
 
 
450 aa  125  2e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.621318  normal  0.596351 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0681  transposase, IS605 OrfB family  32.97 
 
 
427 aa  125  2e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.146428  normal  0.17293 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4128  transposase, IS605 OrfB family  27.68 
 
 
397 aa  124  2e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.431566  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2488  transposase, IS605 OrfB family  32.97 
 
 
439 aa  125  2e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.143837 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2779  transposase, IS605 OrfB family  41.63 
 
 
412 aa  124  4e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.306797  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1635  transposase, IS605 OrfB family  37.85 
 
 
351 aa  123  7e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4786  IS605 family transposase OrfB  31.34 
 
 
359 aa  122  8e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1086  transposase, IS605 OrfB family  29.46 
 
 
434 aa  122  9.999999999999999e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6879  IS605 family transposase OrfB  38.56 
 
 
387 aa  120  3.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.642554  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2621  transposase, IS605 OrfB family  29.11 
 
 
412 aa  119  9e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3043  IS605 family transposase OrfB  29.75 
 
 
450 aa  119  9.999999999999999e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4668  transposase  30.77 
 
 
359 aa  117  3e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.177412  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0882  transposase  29.95 
 
 
359 aa  117  3e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00721916  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3228  transposase, IS605 OrfB family  28.19 
 
 
419 aa  117  3e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1128  transposase, IS605 OrfB family  28.19 
 
 
419 aa  117  3e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0996  transposase, IS605 OrfB family  30.03 
 
 
409 aa  117  3.9999999999999997e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2261  transposase, IS605 OrfB family  27.75 
 
 
360 aa  116  7.999999999999999e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1167  transposase, IS605 OrfB family  27.75 
 
 
360 aa  116  8.999999999999998e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000668854  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2867  transposase, IS605 OrfB family  27.65 
 
 
360 aa  116  8.999999999999998e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1586  transposase, IS605 OrfB family  27.75 
 
 
360 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000279316  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1753  transposase, IS605 OrfB family  27.75 
 
 
360 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0162  transposase, IS605 OrfB family  27.75 
 
 
360 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0171  transposase, IS605 OrfB family  27.75 
 
 
360 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0632  transposase, IS605 OrfB family  27.75 
 
 
360 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000767619  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2228  transposase, IS605 OrfB family  27.75 
 
 
360 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00238783  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2358  transposase, IS605 OrfB family  27.75 
 
 
360 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0658803  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0615  transposase, IS605 OrfB family  27.75 
 
 
360 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.562099  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2095  transposase, IS605 OrfB family  27.75 
 
 
360 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1921  transposase, IS605 OrfB family  27.75 
 
 
360 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2240  transposase, IS605 OrfB family  27.75 
 
 
360 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000297406  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1854  transposase, IS605 OrfB family  27.75 
 
 
360 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00011315  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0234  transposase, IS605 OrfB family  27.75 
 
 
360 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2274  transposase, IS605 OrfB family  27.75 
 
 
360 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.118023  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0284  transposase, IS605 OrfB family  27.65 
 
 
360 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000238986  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0585  transposase, IS605 OrfB family  27.75 
 
 
360 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0530  transposase, IS605 OrfB family  27.75 
 
 
360 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1257  transposase, IS605 OrfB family  27.75 
 
 
360 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000319001  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1446  transposase, IS605 OrfB family  27.75 
 
 
360 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.252161  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1768  transposase, IS605 OrfB family  27.75 
 
 
360 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1577  transposase, IS605 OrfB family  27.75 
 
 
360 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0208104  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2654  transposase, IS605 OrfB family  27.75 
 
 
360 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00128227  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2682  transposase, IS605 OrfB family  27.75 
 
 
360 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0586461  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2198  transposase IS605  33.03 
 
 
368 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4104  transposase, IS605 OrfB family  27.33 
 
 
419 aa  115  2.0000000000000002e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1604  transposase, IS605 OrfB family  27.75 
 
 
360 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2561  transposase, IS605 OrfB family  29.2 
 
 
440 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.467488  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1851  transposase, IS605 OrfB family  28.01 
 
 
360 aa  114  3e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000015791  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3366  transposase, IS605 OrfB family  27.17 
 
 
411 aa  113  5e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2928  transposase, IS605 OrfB family  27.17 
 
 
411 aa  113  5e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2941  transposase, IS605 OrfB family  35.02 
 
 
401 aa  113  6e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.644537  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2493  transposase, IS605 OrfB family  35.02 
 
 
401 aa  113  6e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.904299 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0456  transposase, IS605 OrfB family  27.49 
 
 
360 aa  113  8.000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3136  transposase, IS605 OrfB family  27.39 
 
 
360 aa  113  8.000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4673  transpoase  28.57 
 
 
359 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0861  transposase, IS1341 family  28.83 
 
 
404 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3293  transposase, IS605 OrfB family  30.08 
 
 
405 aa  110  4.0000000000000004e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.944265  normal  0.342145 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2125  transposase, IS605 OrfB family  35.62 
 
 
370 aa  110  5e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00617237  decreased coverage  0.0000396034 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1189  transposase, IS605 OrfB family  31.79 
 
 
382 aa  110  5e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4205  transposase, IS605 OrfB family  37.88 
 
 
417 aa  110  7.000000000000001e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5275  transposase, family IS1341  26.83 
 
 
463 aa  109  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0827371 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1239  transposase, IS605 OrfB family  29.22 
 
 
409 aa  109  8.000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5354  transposase, family IS1341  26.83 
 
 
442 aa  109  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0133  transposase  28.57 
 
 
409 aa  109  9.000000000000001e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0135  transposase, putative  28.57 
 
 
409 aa  109  9.000000000000001e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4063  transposase, IS1341 family  35.94 
 
 
400 aa  109  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1671  transposase, IS605 OrfB family  30.24 
 
 
405 aa  109  1e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3159  transposase, IS605 OrfB family  36.5 
 
 
430 aa  108  1e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2686  transposase  27.12 
 
 
372 aa  108  2e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.442816  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>