213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1025 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_1025  peptidase M19 renal dipeptidase  100 
 
 		 356 aa  738    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.134164  normal  0.69522 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6999  peptidase M19 renal dipeptidase  63.48 
 
 		 356 aa  479  1e-134  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.584329 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0672  peptidase M19, renal dipeptidase  60.56 
 
 		 356 aa  475  1e-133  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3958  peptidase M19 renal dipeptidase  56.27 
 
 		 362 aa  425  1e-118  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.561135  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1888  peptidase M19 renal dipeptidase  55.77 
 
 		 362 aa  412  1e-114  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4630  peptidase M19 renal dipeptidase  33.42 
 
 		 350 aa  185  9e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2247  peptidase M19 renal dipeptidase  32.5 
 
 		 330 aa  157  2e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00766827  normal  0.323905 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1112  peptidase M19, renal dipeptidase  32.95 
 
 		 327 aa  155  1e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0274447  hitchhiker  0.0050668 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2534  peptidase M19 renal dipeptidase  30.75 
 
 		 331 aa  151  2e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1304  peptidase M19, renal dipeptidase  30.34 
 
 		 349 aa  125  1e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.53734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1592  peptidase M19, renal dipeptidase  30.34 
 
 		 349 aa  125  1e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0400913 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1009  membrane dipeptidase  31.51 
 
 		 311 aa  119  6e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5916  dipeptidase  26.91 
 
 		 344 aa  118  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0386  Membrane dipeptidase  30.25 
 
 		 342 aa  117  3e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09650  Membrane dipeptidase  29.5 
 
 		 315 aa  113  5e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0654  renal dipeptidase family protein  26.11 
 
 		 346 aa  112  1.0000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1194  Membrane dipeptidase  30.21 
 
 		 307 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000135749  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6456  Membrane dipeptidase  27.07 
 
 		 402 aa  111  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0026  Membrane dipeptidase  28.57 
 
 		 354 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3100  Membrane dipeptidase  29.41 
 
 		 315 aa  110  5e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000119053  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0616  renal dipeptidase family protein  27.13 
 
 		 346 aa  109  7.000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3097  Membrane dipeptidase  31.14 
 
 		 333 aa  109  8.000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0690607 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3994  Membrane dipeptidase  25.07 
 
 		 360 aa  108  1e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3810  renal dipeptidase family protein  28.52 
 
 		 307 aa  104  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0377  membrane dipeptidase  28.92 
 
 		 355 aa  105  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.116941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1494  membrane dipeptidase  25.75 
 
 		 348 aa  103  4e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1915  membrane dipeptidase  30 
 
 		 313 aa  103  5e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.708743  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0756  thermostable dipeptidase  27.78 
 
 		 311 aa  102  9e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0331  Membrane dipeptidase  29.37 
 
 		 444 aa  101  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0134  Membrane dipeptidase  24.7 
 
 		 355 aa  101  2e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5702  Membrane dipeptidase  30.25 
 
 		 345 aa  100  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.23726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1907  peptidase M19 renal dipeptidase  25.08 
 
 		 352 aa  101  3e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.486675  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3742  peptidase M19 renal dipeptidase  26.61 
 
 		 346 aa  100  4e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2477  Membrane dipeptidase  29.87 
 
 		 438 aa  100  5e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.533309  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3312  membrane dipeptidase  28.88 
 
 		 342 aa  100  5e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.965789  normal  0.649064 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3853  peptidase M19 renal dipeptidase  27.59 
 
 		 352 aa  99.4  9e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.417509 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0802  dipeptidase AC  28.99 
 
 		 355 aa  99  1e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.709374  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0039  dipeptidase AC  24.65 
 
 		 349 aa  99  1e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.508075  normal  0.304593 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2460  peptidase M19, renal dipeptidase  28.99 
 
 		 355 aa  99  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.133769 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1472  Membrane dipeptidase  29.33 
 
 		 307 aa  98.6  1e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3546  membrane dipeptidase  25.63 
 
 		 307 aa  98.6  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0243201  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3688  membrane dipeptidase  31.56 
 
 		 399 aa  98.2  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.083911  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3534  renal dipeptidase family protein  27.5 
 
 		 307 aa  97.8  3e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00478646  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3883  membrane dipeptidase  27.66 
 
 		 342 aa  97.1  4e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3889  dipeptidase  27.98 
 
 		 350 aa  97.1  4e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.741978  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2427  membrane dipeptidase  28.7 
 
 		 307 aa  96.7  5e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.939171  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3822  renal dipeptidase family protein  26.52 
 
 		 307 aa  97.1  5e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.137554  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2327  peptidase M19 renal dipeptidase  27.16 
 
 		 353 aa  96.7  5e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.140494  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3872  Membrane dipeptidase  25.19 
 
 		 412 aa  94.4  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3505  peptidase M19, renal dipeptidase  30.08 
 
 		 327 aa  94.7  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0645  peptidase M19, renal dipeptidase  24.81 
 
 		 306 aa  94.7  2e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0951  membrane dipeptidase  25 
 
 		 326 aa  94  3e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4785  Membrane dipeptidase  29.95 
 
 		 355 aa  93.6  4e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3874  renal dipeptidase family protein  27.5 
 
 		 307 aa  94  4e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.452188  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2183  dipeptidase family protein  30.23 
 
 		 320 aa  93.6  5e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.503276  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1477  Membrane dipeptidase  27.09 
 
 		 315 aa  93.6  5e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.203918  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2089  Membrane dipeptidase  27.6 
 
 		 307 aa  93.6  5e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3516  renal dipeptidase family protein  26.07 
 
 		 307 aa  93.2  6e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4181  peptidase M19 renal dipeptidase  26.29 
 
 		 352 aa  93.2  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.351187  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0721  peptidase M19 renal dipeptidase  25.44 
 
 		 312 aa  93.2  7e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00790748  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3624  renal dipeptidase family protein  26.07 
 
 		 307 aa  93.2  7e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0203729  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3911  renal dipeptidase family protein  26.07 
 
 		 307 aa  93.2  7e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.809372  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3787  renal dipeptidase family protein  26.07 
 
 		 307 aa  93.2  7e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000820793 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2579  membrane dipeptidase  29.56 
 
 		 429 aa  93.2  7e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1425  renal dipeptidase family protein  25.27 
 
 		 307 aa  92.8  8e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0826575  normal  0.836876 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3261  peptidase M19, renal dipeptidase  27.35 
 
 		 394 aa  90.9  3e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.35092  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1894  dipeptidase family protein  30.06 
 
 		 320 aa  90.1  5e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6819  Membrane dipeptidase  27.73 
 
 		 345 aa  89.7  7e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.714223  normal  0.0281213 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1550  Membrane dipeptidase  28.41 
 
 		 388 aa  87.8  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3959  Membrane dipeptidase  27.55 
 
 		 412 aa  87.8  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.651593  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0827  Membrane dipeptidase  27.57 
 
 		 399 aa  87  4e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1249  Zn-dependent dipeptidase, microsomal dipeptidase-like protein  27.72 
 
 		 311 aa  87  4e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2312  membrane dipeptidase  25.78 
 
 		 419 aa  86.7  6e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0451  peptidase M19 renal dipeptidase  30.25 
 
 		 397 aa  86.7  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.645242 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1127  Membrane dipeptidase  27.47 
 
 		 297 aa  85.5  0.000000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0633246  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3815  membrane dipeptidase  27.17 
 
 		 418 aa  85.1  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1093  peptidase M19, renal dipeptidase  27.03 
 
 		 307 aa  84.7  0.000000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.620091 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1584  membrane dipeptidase  23.81 
 
 		 323 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.222083  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1478  Membrane dipeptidase  26.2 
 
 		 328 aa  83.6  0.000000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000344928  normal  0.899515 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2850  peptidase M19 renal dipeptidase  32.48 
 
 		 389 aa  83.2  0.000000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.25923  normal  0.0171201 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0910  peptidase M19, renal dipeptidase  30 
 
 		 324 aa  82.8  0.000000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4253  Membrane dipeptidase  29.17 
 
 		 359 aa  81.3  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.655109  normal  0.32173 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5836  Membrane dipeptidase  27.08 
 
 		 444 aa  80.5  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.449676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1847  peptidase M19, renal dipeptidase  26.83 
 
 		 357 aa  80.5  0.00000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2434  Membrane dipeptidase  25.49 
 
 		 381 aa  79.7  0.00000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.911642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1664  peptidase M19 renal dipeptidase  27.85 
 
 		 312 aa  79.7  0.00000000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.791756  hitchhiker  0.00631997 
 
 
-
 
NC_002950  PG1701  glutamine amidotransferase, class II/dipeptidase  23.77 
 
 		 602 aa  79.3  0.00000000000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.176176 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1867  renal dipeptidase family protein  24.4 
 
 		 323 aa  79.3  0.00000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03672  dipeptidase  27.97 
 
 		 409 aa  78.6  0.0000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3086  membrane dipeptidase  28.43 
 
 		 350 aa  79.3  0.0000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0805  membrane dipeptidase  26.46 
 
 		 420 aa  78.6  0.0000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3284  membrane dipeptidase  24.5 
 
 		 323 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5064  Membrane dipeptidase  25.47 
 
 		 323 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.723336  normal  0.0155477 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2131  Membrane dipeptidase  30.34 
 
 		 338 aa  78.2  0.0000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.248358  normal  0.363265 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5084  membrane dipeptidase  24.5 
 
 		 323 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1296  peptidase M19 renal dipeptidase  26.22 
 
 		 344 aa  78.2  0.0000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.488471  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5201  membrane dipeptidase  24.5 
 
 		 323 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5021  membrane dipeptidase  23.13 
 
 		 323 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.675997  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4496  membrane dipeptidase  23.13 
 
 		 323 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0032  peptidase M19, renal dipeptidase  27.07 
 
 		 307 aa  77  0.0000000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>