More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0873 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_0873  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 
305 aa  602  1.0000000000000001e-171  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2764  protein of unknown function DUF6 transmembrane  58.28 
 
 
305 aa  336  3.9999999999999995e-91  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1758  protein of unknown function DUF6 transmembrane  53.27 
 
 
306 aa  326  3e-88  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000138196  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1029  protein of unknown function DUF6 transmembrane  55.29 
 
 
304 aa  305  8.000000000000001e-82  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0872  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45.99 
 
 
303 aa  279  5e-74  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.187128  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1550  protein of unknown function DUF6 transmembrane  49.67 
 
 
315 aa  251  1e-65  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.213106  normal  0.0477313 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1069  hypothetical protein  39.51 
 
 
305 aa  205  6e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.113736  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0781  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.52 
 
 
302 aa  154  1e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.943556  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1215  hypothetical protein  36.76 
 
 
299 aa  137  2e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2469  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.46 
 
 
293 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0904  hypothetical protein  31.08 
 
 
296 aa  126  6e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1696  hypothetical protein  30.74 
 
 
296 aa  125  9e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0216  hypothetical protein  30.3 
 
 
296 aa  119  7e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.685922  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0463  hypothetical protein  28.17 
 
 
289 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0332  hypothetical protein  32.82 
 
 
301 aa  104  2e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.156874  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0350  hypothetical protein  32.82 
 
 
301 aa  104  2e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0129  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.69 
 
 
283 aa  103  3e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0919  hypothetical protein  26.26 
 
 
274 aa  100  2e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0301  hypothetical protein  30.58 
 
 
308 aa  100  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000637282  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3057  transporter, EamA family  27.7 
 
 
303 aa  99  9e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3092  EamA family protein  28.04 
 
 
303 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00288744  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2848  EamA family protein  27.7 
 
 
303 aa  98.6  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2780  drug/metabolite exporter family protein  27.33 
 
 
303 aa  98.2  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3061  eama family protein  27.7 
 
 
303 aa  98.6  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2043  hypothetical protein  29.6 
 
 
304 aa  98.6  1e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2821  drug/metabolite exporter family protein  27.7 
 
 
303 aa  98.2  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3090  transporter, EamA family  27.7 
 
 
303 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0880872  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3073  transporter, EamA family  27.7 
 
 
303 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0260  DMT family permease  26.4 
 
 
312 aa  97.1  3e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4993  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  27.78 
 
 
306 aa  97.4  3e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.570492  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50670  hypothetical protein  29.41 
 
 
301 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0191207 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1807  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.82 
 
 
320 aa  96.7  4e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.805576 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1521  hypothetical protein  27.97 
 
 
266 aa  95.5  9e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.851073  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4318  hypothetical protein  29.41 
 
 
301 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.136132  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2840  hypothetical protein  27.36 
 
 
303 aa  94.7  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.269386  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0257  DMT family permease  26.8 
 
 
310 aa  93.6  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0644  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.38 
 
 
287 aa  94  3e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000380606  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2189  transporter, EamA family  28.16 
 
 
303 aa  94  3e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000931242 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0297  hypothetical protein  28.67 
 
 
300 aa  92.8  6e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0314  hypothetical protein  26.8 
 
 
306 aa  90.9  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0328  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  28.47 
 
 
306 aa  89.7  6e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0605966  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2038  hypothetical protein  29 
 
 
301 aa  89  9e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.174012  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0352  permease, drug/metabolite transporter  26.85 
 
 
306 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.110507  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2185  hypothetical protein  29.79 
 
 
291 aa  85.1  0.000000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1524  hypothetical protein  24.15 
 
 
312 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.499904  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  29.89 
 
 
315 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1804  hypothetical protein  26.1 
 
 
296 aa  80.5  0.00000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.363545  normal  0.129857 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0439  YyaM  27.02 
 
 
301 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0824  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.71 
 
 
301 aa  79.7  0.00000000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000157317  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1702  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.74 
 
 
302 aa  78.6  0.0000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.352845  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.06 
 
 
291 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0574  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.49 
 
 
307 aa  78.2  0.0000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1938  hypothetical protein  26.58 
 
 
309 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.94685  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2450  drug/metabolite exporter family protein  28.52 
 
 
303 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000213459  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4731  hypothetical protein  28.81 
 
 
293 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00404903 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2739  permease, drug/metabolite transporter superfamily  28.52 
 
 
303 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000046973  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1865  hypothetical protein  30 
 
 
328 aa  77  0.0000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0251  hypothetical protein  28.72 
 
 
305 aa  76.6  0.0000000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4853  hypothetical protein  28.62 
 
 
293 aa  76.3  0.0000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0128243 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4508  integral membrane protein  25.32 
 
 
309 aa  76.3  0.0000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.563212  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0919  EamA family protein  26.8 
 
 
303 aa  75.9  0.0000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.23491  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0725  DMT family permease  27.12 
 
 
303 aa  76.3  0.0000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.123032  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0265  hypothetical protein  26.58 
 
 
307 aa  75.9  0.0000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.726467  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0292  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.49 
 
 
292 aa  75.5  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0789  EamA family protein  26.8 
 
 
303 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000376936  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1374  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.13 
 
 
300 aa  75.1  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124016  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0738  DMT family permease  26.25 
 
 
303 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000110425  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4157  DMT family permease  25.42 
 
 
309 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000489633  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0829  eama family protein  26.8 
 
 
303 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000248571  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55720  hypothetical protein  27.15 
 
 
296 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4826  hypothetical protein  26.67 
 
 
300 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4453  transporter, EamA family  27.92 
 
 
303 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0045987  normal  0.86451 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0882  transporter, EamA family  27.56 
 
 
303 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0755337  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2616  transporter, EamA family  30.5 
 
 
304 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000255461 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4047  hypothetical protein  28.09 
 
 
312 aa  74.3  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0924  transporter, EamA family  27.78 
 
 
303 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.64365e-45 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2630  hypothetical protein  25.56 
 
 
309 aa  73.9  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.815333 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0739  hypothetical protein  26.41 
 
 
303 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.159061  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0679  hypothetical protein  26.58 
 
 
302 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0993  transporter, EamA family  27.43 
 
 
303 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00144449  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1891  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.08 
 
 
301 aa  73.2  0.000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00000802295  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6627  hypothetical protein  27.99 
 
 
299 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.725322 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0267  hypothetical protein  25.6 
 
 
306 aa  72.8  0.000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6477  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.68 
 
 
301 aa  72.8  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.531293  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4854  hypothetical protein  27.4 
 
 
296 aa  72.8  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1473  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.51 
 
 
300 aa  72.4  0.000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.226388  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1024  hypothetical protein  29.63 
 
 
330 aa  72.4  0.000000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4910  hypothetical protein  28.62 
 
 
290 aa  72.4  0.000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000131826 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5782  hypothetical protein  27.99 
 
 
299 aa  72.4  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6147  hypothetical protein  27.99 
 
 
299 aa  72.4  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.609004 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4645  hypothetical protein  27.59 
 
 
297 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.430538  normal  0.037772 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0346  hypothetical protein  28.17 
 
 
302 aa  72  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1368  hypothetical protein  29.17 
 
 
306 aa  72  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.496352  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2926  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.45 
 
 
305 aa  72  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2686  transporter, EamA family  29.18 
 
 
304 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000188959 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1505  hypothetical protein  24.48 
 
 
305 aa  71.6  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1039  hypothetical protein  26.97 
 
 
303 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.371653  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1447  hypothetical protein  27.44 
 
 
301 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.23861  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0739  hypothetical protein  27.59 
 
 
294 aa  71.2  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.354242  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1999  hypothetical protein  28.57 
 
 
293 aa  71.2  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.355274  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>