195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0027 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_0027  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  100 
 
 		 230 aa  459  9.999999999999999e-129  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.615155  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0342  precorrin-8X methylmutase  53.47 
 
 		 220 aa  209  3e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.470855  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2253  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  56.11 
 
 		 245 aa  205  5e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0292  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  53.62 
 
 		 213 aa  196  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.599912 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0965  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  50.48 
 
 		 213 aa  194  7e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.519287  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1435  precorrin-8X methylmutase  44.02 
 
 		 209 aa  161  7e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.170002  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1241  precorrin-8X methylmutase  44.02 
 
 		 209 aa  161  7e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.189427  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0308  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  38.78 
 
 		 207 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3611  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  40.8 
 
 		 216 aa  143  2e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1269  precorrin-8X methylmutase  43.07 
 
 		 214 aa  142  3e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0352716  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1250  precorrin-8X methylmutase  45.45 
 
 		 208 aa  143  3e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0554951  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1287  precorrin-8X methylmutase  44.95 
 
 		 208 aa  141  9.999999999999999e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2136  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  42 
 
 		 224 aa  141  9.999999999999999e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0350382 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1898  precorrin-8X methylmutase  45.23 
 
 		 208 aa  139  4.999999999999999e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.171358  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0480  precorrin isomerase, CbiC-like  39.81 
 
 		 225 aa  137  2e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3545  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  40.3 
 
 		 214 aa  137  2e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0697  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  38.38 
 
 		 205 aa  137  2e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1298  precorrin-8X methylmutase  42.86 
 
 		 211 aa  135  4e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000022919  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1298  Precorrin-8X methylmutase  37.31 
 
 		 207 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00456818 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1720  cobalt-precorrin-8X methylmutase  38 
 
 		 227 aa  132  3.9999999999999996e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0033  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  41.79 
 
 		 213 aa  132  5e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1382  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  37.56 
 
 		 214 aa  131  6.999999999999999e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1269  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  46.05 
 
 		 219 aa  130  1.0000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1553  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  38.54 
 
 		 215 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.160219  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2613  Precorrin-8X methylmutase  38.02 
 
 		 215 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1008  Precorrin-8X methylmutase  35.11 
 
 		 211 aa  130  3e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1285  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  39.22 
 
 		 211 aa  129  4.0000000000000003e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.808372  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0477  precorrin-8X methylmutase  43.84 
 
 		 214 aa  128  7.000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2706  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  41.38 
 
 		 207 aa  128  8.000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0197172  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1573  precorrin-8X methylmutase  43.72 
 
 		 208 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.377269  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0080  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  34.34 
 
 		 213 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.52758 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21130  precorrin-8X methylmutase  41.63 
 
 		 219 aa  127  2.0000000000000002e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2555  precorrin-8X methylmutase  36.27 
 
 		 207 aa  126  3e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1591  precorrin-8X methylmutase  43.22 
 
 		 208 aa  126  3e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.257981 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3134  precorrin-8X methylmutase  38.78 
 
 		 217 aa  125  4.0000000000000003e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.688258 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3509  precorrin-8X methylmutase  44.39 
 
 		 209 aa  125  6e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.400984  normal  0.540092 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3117  precorrin-8X methylmutase  42.56 
 
 		 230 aa  124  8.000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2999  precorrin-8X methylmutase  40.78 
 
 		 213 aa  124  9e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.540254  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1782  Precorrin-8X methylmutase  41.71 
 
 		 208 aa  123  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.140584  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4876  precorrin-8X methylmutase  41.38 
 
 		 208 aa  123  3e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0317  precorrin-8X methylmutase  39.35 
 
 		 224 aa  122  3e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4416  precorrin-8X methylmutase  41.38 
 
 		 208 aa  122  4e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.416711 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4823  precorrin-8X methylmutase  42.71 
 
 		 208 aa  122  6e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.183427 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1646  precorrin-8X methylmutase  42.21 
 
 		 208 aa  122  7e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.996028  normal  0.344579 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1193  precorrin-8X methylmutase  42.21 
 
 		 208 aa  122  7e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0208289  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1673  precorrin-8X methylmutase  42.21 
 
 		 208 aa  122  7e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0355413  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1852  precorrin-8X methylmutase  42.16 
 
 		 209 aa  121  9e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.334862  normal  0.809538 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3146  precorrin-8X methylmutase  42.05 
 
 		 210 aa  121  9e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.757727  normal  0.930234 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3376  precorrin-8X methylmutase  40.89 
 
 		 221 aa  121  9.999999999999999e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.218633 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0575  Precorrin-8X methylmutase  41.62 
 
 		 206 aa  121  9.999999999999999e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.204948  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3178  precorrin-8X methylmutase  43.94 
 
 		 209 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.333659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4572  precorrin-8X methylmutase  43.75 
 
 		 208 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5593  Precorrin-8X methylmutase  41.29 
 
 		 208 aa  120  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.179804  normal  0.278794 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1303  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  38.54 
 
 		 212 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3144  precorrin-8X methylmutase  43.32 
 
 		 212 aa  119  3e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2320  precorrin-8X methylmutase  42.42 
 
 		 209 aa  118  7e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.415646  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7175  precorrin-8X methylmutase  38.83 
 
 		 210 aa  118  7e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.894546  normal  0.0915035 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2440  precorrin-8X methylmutase  41.33 
 
 		 210 aa  118  7.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.341213  normal  0.0714057 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1244  precorrin-8X methylmutase  41.75 
 
 		 208 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0926514  normal  0.29626 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17660  precorrin-8X methylmutase  42.94 
 
 		 221 aa  117  9.999999999999999e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0262485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2081  precorrin-8X methylmutase  36.27 
 
 		 218 aa  116  3e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2399  precorrin-8X methylmutase  44.78 
 
 		 208 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.154427  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1434  Precorrin-8X methylmutase  42.86 
 
 		 210 aa  115  5e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.656935  normal  0.667092 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2991  precorrin-8X methylmutase  43.88 
 
 		 208 aa  115  6e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0642  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  41.26 
 
 		 222 aa  115  6e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1437  precorrin-8X methylmutase  41.84 
 
 		 210 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.226548  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1712  Precorrin-8X methylmutase  42.35 
 
 		 210 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.61701  hitchhiker  0.00790463 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0567  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  41.26 
 
 		 222 aa  113  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2817  precorrin-8X methylmutase  40.4 
 
 		 210 aa  113  3e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.603033 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1888  precorrin-8X methylmutase  41.08 
 
 		 209 aa  113  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1691  precorrin-8X methylmutase  35.27 
 
 		 225 aa  112  5e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.188396 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1569  precorrin-8X methylmutase  43.75 
 
 		 208 aa  112  5e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0892973 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0605  precorrin-8X methylmutase  41.24 
 
 		 208 aa  112  6e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.414575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2355  precorrin-8X methylmutase  39.89 
 
 		 249 aa  111  7.000000000000001e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000155393  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6020  precorrin-8X methylmutase  37.86 
 
 		 210 aa  111  9e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00161417  normal  0.19604 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3284  precorrin-8X methylmutase  43 
 
 		 211 aa  111  1.0000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.174863  normal  0.987458 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0122  precorrin-8X methylmutase  41.49 
 
 		 209 aa  111  1.0000000000000001e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2866  precorrin-8X methylmutase  43.16 
 
 		 732 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0172  precorrin-8X methylmutase  42.11 
 
 		 512 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00890226  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4884  precorrin-8X methylmutase  40.64 
 
 		 208 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12101  precorrin-8X methylmutase  39.46 
 
 		 208 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0138483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0070  precorrin-8X methylmutase  38.62 
 
 		 239 aa  109  3e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.104216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2380  precorrin-8X methylmutase  42.42 
 
 		 209 aa  109  3e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4618  precorrin-8X methylmutase  40.64 
 
 		 208 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.427711 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2639  precorrin isomerase  40.98 
 
 		 499 aa  109  4.0000000000000004e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0523957  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5370  precorrin-8X methylmutase  41.24 
 
 		 208 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.218381  normal  0.626073 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1477  precorrin-8X methylmutase  35.53 
 
 		 201 aa  108  5e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2360  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  39.81 
 
 		 520 aa  109  5e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4828  precorrin-8X methylmutase  40.64 
 
 		 208 aa  108  6e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.111052  normal  0.504707 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4706  precorrin-8X methylmutase  40.64 
 
 		 208 aa  108  6e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.735221 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0143  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  34.55 
 
 		 209 aa  108  7.000000000000001e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1504  precorrin-8X methylmutase  35.64 
 
 		 200 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5060  precorrin-8X methylmutase  36.95 
 
 		 211 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.341493 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2249  precorrin-8X methylmutase  42.11 
 
 		 208 aa  107  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.668584  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2298  precorrin-8X methylmutase  38.83 
 
 		 219 aa  106  3e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.191284  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2777  precorrin-8X methylmutase  34.95 
 
 		 224 aa  106  3e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.066759 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2480  Precorrin-8X methylmutase  40.32 
 
 		 208 aa  106  3e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.182678  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3739  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  35.75 
 
 		 226 aa  106  3e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2151  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  39.29 
 
 		 210 aa  106  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0108715  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0927  Precorrin-8X methylmutase  37.76 
 
 		 204 aa  106  3e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000290763 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>