184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_3555 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_3555  zinc transporter ZupT  100 
 
 
271 aa  536  1e-151  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.0000000000223536  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2971  zinc transporter ZupT  64.98 
 
 
277 aa  354  7.999999999999999e-97  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0157  zinc transporter ZupT  62.92 
 
 
268 aa  341  7e-93  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0903  zinc transporter ZupT  58.5 
 
 
298 aa  313  9.999999999999999e-85  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.373127  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0856  zinc transporter ZupT  60.63 
 
 
289 aa  311  5.999999999999999e-84  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000612212  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2825  zinc transporter ZupT  57.43 
 
 
298 aa  306  2.0000000000000002e-82  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0908  zinc transporter ZupT  59.36 
 
 
266 aa  305  5.0000000000000004e-82  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.855869  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07430  zinc/iron permease  56.46 
 
 
272 aa  299  4e-80  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0717  zinc transporter ZupT  59.86 
 
 
279 aa  298  7e-80  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0000000126072  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1320  zinc transporter ZupT  54.58 
 
 
298 aa  297  1e-79  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00680166  hitchhiker  0.00681091 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1152  zinc transporter ZupT  58.5 
 
 
266 aa  293  2e-78  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1456  zinc transporter ZupT  58.33 
 
 
267 aa  293  2e-78  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.556549  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0206  zinc transporter ZupT  56.46 
 
 
300 aa  288  5.0000000000000004e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0874805  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1483  zinc/iron permease  54.68 
 
 
270 aa  285  5e-76  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.287328  normal  0.134401 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1174  zinc/iron permease  55.06 
 
 
281 aa  278  5e-74  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.371558  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0290  zinc transporter ZupT  50.87 
 
 
291 aa  244  8e-64  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0448  zinc/iron permease  50.78 
 
 
265 aa  243  1.9999999999999999e-63  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000257065  hitchhiker  0.0000000301064 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0313  zinc transporter ZupT  50 
 
 
291 aa  243  3e-63  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0920658  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22030  predicted divalent heavy-metal cations transporter  48.73 
 
 
275 aa  232  5e-60  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.895881  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2676  zinc transporter ZupT  45.72 
 
 
269 aa  224  1e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.264874 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2670  zinc transporter ZupT  43.73 
 
 
258 aa  223  3e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000324662  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42358  ZIP family transporter: zinc ion  50.92 
 
 
269 aa  219  5e-56  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.505528 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_52343  iron permease 1  48.88 
 
 
265 aa  209  5e-53  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0298528  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_22166  predicted protein  43.68 
 
 
280 aa  204  1e-51  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00107582  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_38445  predicted protein  60.26 
 
 
390 aa  179  2.9999999999999997e-44  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.261739  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15590  predicted divalent heavy-metal cations transporter  44.87 
 
 
262 aa  173  1.9999999999999998e-42  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0273955  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0568  zinc transporter ZupT  40.32 
 
 
252 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.181834  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4285  zinc transporter ZupT  38.96 
 
 
255 aa  159  4e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3452  zinc transporter ZupT  39.23 
 
 
257 aa  159  7e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0404231 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3472  zinc transporter ZupT  39.46 
 
 
253 aa  155  6e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000026596  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3441  zinc transporter ZupT  40.15 
 
 
257 aa  155  8e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.321701  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3448  zinc transporter ZupT  39.92 
 
 
257 aa  155  9e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3371  zinc transporter ZupT  39.92 
 
 
257 aa  155  9e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3376  zinc transporter ZupT  39.92 
 
 
257 aa  155  9e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.59755 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3543  zinc transporter ZupT  39.92 
 
 
257 aa  155  9e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.519213  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02912  zinc transporter ZupT  38.37 
 
 
257 aa  150  2e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0661  zinc/iron permease  38.37 
 
 
257 aa  150  2e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4353  zinc transporter ZupT  38.37 
 
 
257 aa  150  2e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00000140214  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02862  hypothetical protein  38.37 
 
 
257 aa  150  2e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3217  zinc transporter ZupT  38.37 
 
 
257 aa  150  2e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  1.5422e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3504  zinc transporter ZupT  38.37 
 
 
257 aa  150  2e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000224726  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0658  zinc transporter ZupT  38.37 
 
 
257 aa  150  2e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.46164 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3337  zinc transporter ZupT  38.37 
 
 
257 aa  150  2e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.991489  normal 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_26405  predicted protein  41.52 
 
 
188 aa  146  4.0000000000000006e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0159507  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_12811  ZIP family transporter: zinc ion  35.63 
 
 
232 aa  133  3e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0345434  normal  0.714203 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0510  zinc/iron permease  33.08 
 
 
271 aa  109  4.0000000000000004e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1427  zinc/iron permease  32.1 
 
 
272 aa  108  1e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3571  zinc/iron permease  31.27 
 
 
270 aa  107  3e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.640289  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0830  zinc/iron permease  33.46 
 
 
271 aa  105  8e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1152  zinc/iron permease  32.65 
 
 
271 aa  104  2e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.661251  normal  0.519901 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0414  zinc/iron permease  29.48 
 
 
269 aa  102  5e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1670  zinc/iron permease  33.71 
 
 
255 aa  102  5e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.31853  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0036  zinc/iron permease  31.73 
 
 
247 aa  101  1e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1761  zinc/iron permease  30.89 
 
 
269 aa  101  1e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.209568  normal  0.0390334 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1497  zinc/iron permease  31.97 
 
 
269 aa  100  3e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.265438  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0382  gufA protein, putative  30.92 
 
 
271 aa  99  7e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1033  zinc/iron permease  34.65 
 
 
245 aa  97.1  3e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1051  zinc/iron permease  29.89 
 
 
246 aa  97.1  3e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1087  zinc/iron permease  34.65 
 
 
245 aa  97.1  3e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2417  ZIP zinc transporter family protein  30.95 
 
 
279 aa  96.7  4e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1916  zinc/iron permease  30.71 
 
 
270 aa  95.9  6e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0208  zinc/iron permease  29.6 
 
 
269 aa  95.5  8e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.478364  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3615  zinc/iron permease  31.75 
 
 
260 aa  95.5  9e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.314729  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3953  zinc/iron permease  31.75 
 
 
260 aa  95.5  9e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.210601  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00170  zinc/iron permease  33.88 
 
 
261 aa  93.2  4e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000172235  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4410  zinc/iron permease  29.64 
 
 
244 aa  92.8  6e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_6528  predicted protein  44 
 
 
125 aa  92  9e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.8441  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2925  GufA protein  28.63 
 
 
273 aa  90.9  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0386986  hitchhiker  0.00221874 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0224  metal cation transporter, zinc (Zn2+)-iron (Fe2+) permease (ZIP) family protein  31.23 
 
 
273 aa  90.9  2e-17  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0186331  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0655  zinc/iron permease  30.65 
 
 
270 aa  90.9  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0529529  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1779  zinc/iron permease  31.85 
 
 
258 aa  90.5  2e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1616  zinc/iron permease  29.59 
 
 
272 aa  90.9  2e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2324  hypothetical protein  31.1 
 
 
305 aa  90.1  3e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3117  zinc/iron permease  29.5 
 
 
251 aa  89.4  6e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3261  zinc/iron permease  31.62 
 
 
304 aa  88.6  9e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.28457  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0563  zinc/iron permease  30.21 
 
 
239 aa  88.6  1e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0781  zinc/iron permease  31.52 
 
 
261 aa  87.8  2e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.910074  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0199  zinc/iron permease  29.32 
 
 
239 aa  87  3e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0415  zinc/iron permease  31.4 
 
 
264 aa  86.7  4e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2663  zinc/iron permease  30.86 
 
 
300 aa  86.3  5e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0744572  normal  0.129144 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2912  zinc/iron permease  32.61 
 
 
264 aa  86.3  5e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1721  zinc/iron permease  29.84 
 
 
309 aa  85.5  7e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2509  zinc/iron permease  33.33 
 
 
259 aa  85.1  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0715  zinc/iron permease  28.46 
 
 
262 aa  85.1  0.000000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00169409 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1139  hypothetical protein  30.74 
 
 
237 aa  84.3  0.000000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.854966  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1836  hypothetical protein  31.17 
 
 
250 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.438488  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3874  zinc/iron permease  31.17 
 
 
312 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0665498  normal  0.190441 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0256  zinc/iron permease  28.16 
 
 
247 aa  83.6  0.000000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.015628  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0056  zinc/iron permease  29.2 
 
 
271 aa  83.6  0.000000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1163  zinc/iron permease  32.08 
 
 
300 aa  83.2  0.000000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.436725  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1749  zinc/iron permease  28.46 
 
 
244 aa  82.8  0.000000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1414  zinc/iron permease  31.17 
 
 
312 aa  83.2  0.000000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2969  zinc/iron permease  31.82 
 
 
306 aa  81.6  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2787  Zinc transporter ZIP  30.57 
 
 
309 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0009  zinc/iron permease  33.52 
 
 
248 aa  80.9  0.00000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.288224  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0214  zinc/iron permease  30.4 
 
 
268 aa  81.3  0.00000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000199646  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0597  zinc/iron permease  30.47 
 
 
246 aa  79.7  0.00000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000532722  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2053  hypothetical protein  29.6 
 
 
305 aa  79.3  0.00000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0183571  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2882  zinc/iron permease  32.57 
 
 
267 aa  79  0.00000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0713  zinc/iron permease  29.58 
 
 
258 aa  78.6  0.00000000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000233647  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>