More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2310 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_2310  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  100 
 
 		 112 aa  218  1.9999999999999999e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0255165  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1830  nitrogen regulatory protein P-II  79.46 
 
 		 115 aa  186  1e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.579927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0865  nitrogen regulatory protein P-II  81.25 
 
 		 112 aa  182  1.0000000000000001e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.445753 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1074  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 		 112 aa  167  5e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2268  nitrogen regulatory protein P-II  72.32 
 
 		 112 aa  166  9e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0132  nitrogen regulatory protein P-II  66.96 
 
 		 112 aa  161  2.0000000000000002e-39  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000199717  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1291  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 		 112 aa  161  3e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.230659 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0808  nitrogen regulatory protein P-II  66.96 
 
 		 112 aa  159  8.000000000000001e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0899844  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3047  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  159  1e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.414736  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1885  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  64.29 
 
 		 112 aa  159  1e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.614675  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1760  nitrogen regulatory protein P-II  66.96 
 
 		 112 aa  158  2e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.654192  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1680  nitrogen regulatory protein P-II  66.96 
 
 		 112 aa  159  2e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000892392  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1481  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  157  4e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.19711 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1779  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 		 112 aa  157  7e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.903734 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0146  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 		 112 aa  157  7e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.220304  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1345  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 		 112 aa  156  7e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.934318 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4461  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 		 112 aa  156  9e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.188449  normal  0.905473 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2345  nitrogen regulatory P-II transcription regulator protein  65.18 
 
 		 112 aa  155  1e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.782832  normal  0.263317 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1879  nitrogen regulatory protein P-II  66.96 
 
 		 112 aa  156  1e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000257329  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1351  nitrogen regulatory protein P-II  66.96 
 
 		 112 aa  156  1e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000771293  hitchhiker  0.0000000000923382 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2560  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  156  1e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.24557  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2852  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  155  1e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.287324  normal  0.0455746 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0969  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 		 112 aa  156  1e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.916041  hitchhiker  0.000334887 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2156  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  156  1e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0805697  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1836  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 		 112 aa  155  2e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0337137  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0683  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  155  2e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.173796  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03014  GlnB  63.39 
 
 		 112 aa  155  2e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000337232  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47790  Nitrogen regulatory protein P-II GlnK  62.5 
 
 		 112 aa  155  2e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.144153  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0694  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 		 112 aa  155  2e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.804518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2536  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  66.96 
 
 		 112 aa  155  2e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.679414  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0485  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  155  2e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.65619  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3366  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  154  3e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4248  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  154  4e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.415508  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2376  nitrogen regulatory protein PII  62.5 
 
 		 112 aa  154  5.0000000000000005e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0285666  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4397  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  154  6e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.467345 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3243  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  154  6e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.669306  normal  0.422234 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1110  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 		 112 aa  153  7e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000614062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1494  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 		 112 aa  153  7e-37  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1388  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 		 112 aa  153  7e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.258506  normal  0.939142 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1737  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 		 112 aa  153  8e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0595912  normal  0.82137 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0552  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 		 112 aa  153  8e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.524059  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2783  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 112 aa  152  1e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.190051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4404  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 117 aa  152  1e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.795902  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4381  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 117 aa  152  1e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.647425  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0437  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 112 aa  152  1e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1957  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 112 aa  152  1e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1921  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 		 112 aa  152  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2877  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 112 aa  152  1e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.58077  normal  0.596742 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3267  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  152  1e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2252  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 112 aa  152  1e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0233324  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1545  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  152  1e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0472  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  152  1e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0782781  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2921  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 112 aa  152  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0772673  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2866  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 136 aa  152  1e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00138557  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6030  nitrogen regulatory protein P-II 2  61.61 
 
 		 112 aa  152  2e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0047  nitrogen regulatory protein P-II  66.96 
 
 		 112 aa  151  2e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000287221  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3119  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 		 112 aa  152  2e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1086  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  152  2e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1133  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  152  2e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3223  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  152  2e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.808026  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0232  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 		 112 aa  152  2e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0312248  normal  0.530475 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1217  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  151  2e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.967639 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0259  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 		 112 aa  152  2e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3163  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 		 112 aa  151  2e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.105283  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3162  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  152  2e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00000317831  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69810  nitrogen regulatory protein P-II 2  61.61 
 
 		 112 aa  152  2e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.194686  normal  0.241854 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0939  nitrogen regulatory protein P-II, putative  63.39 
 
 		 112 aa  151  2.9999999999999998e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1069  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  151  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.607168  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1005  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 		 112 aa  151  2.9999999999999998e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0053  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  151  2.9999999999999998e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0041295  normal  0.377674 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0291  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 		 112 aa  151  2.9999999999999998e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1168  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  151  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.474784  normal  0.334361 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0642  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  61.61 
 
 		 112 aa  151  2.9999999999999998e-36  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0211837  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1183  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  151  2.9999999999999998e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000414961 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3078  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  151  2.9999999999999998e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000004264  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2088  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 		 112 aa  151  2.9999999999999998e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0971  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 		 112 aa  151  2.9999999999999998e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.650891  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0195  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 112 aa  151  2.9999999999999998e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.863029 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2274  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 		 112 aa  151  2.9999999999999998e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.468205  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1331  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 		 112 aa  151  2.9999999999999998e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.311288  normal  0.632434 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3649  nitrogen regulatory protein P-II 1  67.92 
 
 		 112 aa  151  2.9999999999999998e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1516  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 112 aa  150  4e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.14536 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3161  nitrogen regulatory protein P-II  59.82 
 
 		 112 aa  150  4e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0791702  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0148  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 112 aa  150  4e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2842  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 		 112 aa  150  4e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.723657 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2036  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 		 112 aa  151  4e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.504448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0080  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 		 112 aa  151  4e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.416357  normal  0.780104 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2550  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  150  4e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0188103  normal  0.0743791 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2387  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 		 112 aa  150  5e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.344208 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0428  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  150  5e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2767  nitrogen regulatory protein P-II  66.04 
 
 		 112 aa  150  5e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1262  nitrogen regulatory protein P-II 1  66.98 
 
 		 112 aa  150  5.9999999999999996e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.297918  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4580  nitrogen regulatory protein P-II  59.82 
 
 		 112 aa  150  5.9999999999999996e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.495708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1155  nitrogen regulatory protein P-II 1  66.98 
 
 		 112 aa  150  5.9999999999999996e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.717243  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2168  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 112 aa  150  5.9999999999999996e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000216085  hitchhiker  0.000000791345 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1303  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  150  5.9999999999999996e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.539571 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3631  nitrogen regulatory protein P-II 1  66.98 
 
 		 112 aa  150  5.9999999999999996e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3519  nitrogen regulatory protein P-II 1  64.29 
 
 		 112 aa  150  7e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0591  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  150  7e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.307832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4832  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  150  7e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>