277 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_1670 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_1670  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 339 aa  708    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0387663  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0731  Radical SAM domain protein  54.95 
 
 		 342 aa  381  1e-104  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00683582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0044  Radical SAM domain protein  55.02 
 
 		 343 aa  375  1e-103  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.671161  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0200  Radical SAM domain protein  53.74 
 
 		 386 aa  367  1e-100  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0237698 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1670  radical SAM domain-containing protein  52.31 
 
 		 362 aa  353  2e-96  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0537367  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1761  Radical SAM domain protein  47.18 
 
 		 337 aa  322  6e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0383887 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2456  Radical SAM domain protein  47.18 
 
 		 337 aa  322  7e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2243  Radical SAM domain protein  49.26 
 
 		 337 aa  320  3e-86  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0761  Radical SAM domain protein  45.72 
 
 		 340 aa  317  2e-85  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00535967  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2854  radical SAM domain-containing protein  46.59 
 
 		 337 aa  316  4e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1841  Radical SAM domain protein  46.59 
 
 		 340 aa  316  4e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0354  radical SAM domain-containing protein  47.63 
 
 		 337 aa  315  6e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.898506 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0922  radical SAM domain-containing protein  46.73 
 
 		 333 aa  315  8e-85  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1524  radical SAM domain-containing protein  47.6 
 
 		 337 aa  313  2.9999999999999996e-84  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1006  radical SAM family protein  46.43 
 
 		 336 aa  312  4.999999999999999e-84  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0779  radical SAM domain-containing protein  45.97 
 
 		 336 aa  311  1e-83  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000436315  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1728  hypothetical protein  46.27 
 
 		 336 aa  305  6e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.241184  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4120  radical SAM domain-containing protein  45.83 
 
 		 372 aa  305  9.000000000000001e-82  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.246389  normal  0.424935 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0308  pyruvate-formate lyase-activating enzyme  44.94 
 
 		 342 aa  297  1e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000547663  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0629  Radical SAM domain protein  44.51 
 
 		 343 aa  283  4.0000000000000003e-75  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000217214  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1034  radical SAM domain-containing protein  43.77 
 
 		 337 aa  280  3e-74  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0759  radical SAM domain-containing protein  44.28 
 
 		 336 aa  275  1.0000000000000001e-72  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1849  radical SAM family protein  40.43 
 
 		 329 aa  269  5e-71  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1995  radical SAM domain-containing protein  41.34 
 
 		 405 aa  268  1e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1150  DNA mismatch repair protein  43.15 
 
 		 338 aa  267  2e-70  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.926871 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1963  Radical SAM domain protein  42.51 
 
 		 334 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0105086  decreased coverage  0.00565461 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0904  Radical SAM domain protein  38.87 
 
 		 395 aa  266  4e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0776722 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0086  radical SAM family protein  42.69 
 
 		 356 aa  263  2e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.508004  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2539  Radical SAM domain protein  40.06 
 
 		 360 aa  264  2e-69  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2551  pyruvate formate-lyase activating enzyme-like protein  38.92 
 
 		 354 aa  263  3e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.592966  normal  0.73651 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0983  radical SAM domain-containing protein  40.87 
 
 		 344 aa  257  2e-67  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2294  radical SAM family protein  42.9 
 
 		 332 aa  256  5e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2404  radical SAM family Fe-S protein  39.94 
 
 		 353 aa  255  6e-67  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0103  Radical SAM domain protein  40.88 
 
 		 356 aa  254  1.0000000000000001e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2431  radical SAM domain-containing protein  41.72 
 
 		 396 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2213  radical SAM domain-containing protein  41.69 
 
 		 367 aa  254  2.0000000000000002e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0100129 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0388  Radical SAM domain protein  37.98 
 
 		 339 aa  253  3e-66  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00103201  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0041  radical SAM domain-containing protein  41.84 
 
 		 362 aa  253  4.0000000000000004e-66  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.821324  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0093  Radical SAM domain protein  41.19 
 
 		 356 aa  252  6e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1455  Radical SAM domain protein  39.33 
 
 		 333 aa  250  2e-65  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1063  radical SAM domain-containing protein  38.25 
 
 		 336 aa  248  1e-64  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.665632  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0348  radical SAM domain-containing protein  38.25 
 
 		 336 aa  248  1e-64  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.224287  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2430  radical SAM domain-containing protein  40.48 
 
 		 365 aa  248  1e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0451112 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1563  radical SAM domain-containing protein  38.25 
 
 		 336 aa  248  1e-64  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.356418 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0073  pyruvate formate lyase-activating enzyme, putative  38.74 
 
 		 365 aa  246  4.9999999999999997e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2948  radical SAM family Fe-S protein  39.63 
 
 		 347 aa  245  6e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1017  Radical SAM domain protein  39.22 
 
 		 335 aa  245  6e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.677632  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1215  radical SAM domain-containing protein  40.12 
 
 		 331 aa  244  9.999999999999999e-64  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1240  radical SAM domain-containing protein  40.12 
 
 		 331 aa  244  9.999999999999999e-64  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1055  radical SAM domain-containing protein  37.98 
 
 		 335 aa  244  9.999999999999999e-64  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.146783  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1585  hypothetical protein  38.99 
 
 		 364 aa  243  5e-63  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1052  radical SAM family protein  41.9 
 
 		 335 aa  241  1e-62  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0963674 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1625  radical SAM domain-containing protein  39.47 
 
 		 363 aa  241  1e-62  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02500  Radical SAM domain protein  38.55 
 
 		 329 aa  240  2.9999999999999997e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000194797  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01540  Radical SAM domain protein  38.55 
 
 		 329 aa  240  2.9999999999999997e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000382646  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1969  radical SAM family protein  37.5 
 
 		 370 aa  239  4e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.327469 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1325  radical SAM domain-containing protein  38.1 
 
 		 365 aa  239  4e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.322233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1648  radical SAM domain-containing protein  39.47 
 
 		 363 aa  239  4e-62  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3292  Radical SAM domain protein  38.55 
 
 		 366 aa  238  1e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1815  radical SAM domain-containing protein  38.28 
 
 		 364 aa  238  1e-61  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0542  radical SAM domain-containing protein  40.58 
 
 		 384 aa  238  1e-61  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0194035 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2684  Radical SAM domain protein  37.65 
 
 		 367 aa  238  1e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.307935  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2293  pyruvate-formate lyase-activating enzyme  39.88 
 
 		 336 aa  237  2e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.388191  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2555  Radical SAM domain protein  39.34 
 
 		 366 aa  236  4e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.466932  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1712  Radical SAM domain protein  36.92 
 
 		 351 aa  235  7e-61  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.465127  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1005  radical SAM domain-containing protein  37.58 
 
 		 370 aa  232  6e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0449  radical SAM family protein  40.48 
 
 		 370 aa  232  6e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.355453  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1698  radical SAM domain-containing protein  36.67 
 
 		 337 aa  232  7.000000000000001e-60  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.588108  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1870  radical SAM domain-containing protein  36.64 
 
 		 374 aa  232  7.000000000000001e-60  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1497  radical SAM domain-containing protein  37.79 
 
 		 365 aa  232  8.000000000000001e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.398952  normal  0.0425103 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1460  radical SAM domain-containing protein  37.5 
 
 		 332 aa  231  1e-59  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0539  radical SAM domain-containing protein  36.72 
 
 		 376 aa  231  1e-59  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00688869  normal  0.395603 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0338  radical SAM domain-containing protein  40.31 
 
 		 348 aa  231  2e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.364245  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2217  Radical SAM domain protein  37.61 
 
 		 374 aa  231  2e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0932  radical SAM domain-containing protein  38.02 
 
 		 362 aa  230  3e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2136  Radical SAM domain protein  35.82 
 
 		 356 aa  229  4e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.219183  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1178  hypothetical protein  37.31 
 
 		 358 aa  228  8e-59  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1066  radical SAM domain-containing protein  36.34 
 
 		 333 aa  228  8e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.925022  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1172  hypothetical protein  37.35 
 
 		 358 aa  227  2e-58  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0088  radical SAM domain-containing protein  38.21 
 
 		 357 aa  225  7e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.400989  normal  0.227798 
 
 
-
 
NC_002936  DET1314  radical SAM domain-containing protein  36.23 
 
 		 345 aa  225  8e-58  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0728  Radical SAM domain protein  36.12 
 
 		 361 aa  225  1e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000489129 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0574  radical SAM domain protein  36.12 
 
 		 361 aa  225  1e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0396  radical SAM family protein  36.36 
 
 		 358 aa  224  1e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0325  Radical SAM domain protein  37.05 
 
 		 333 aa  225  1e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1123  radical SAM domain-containing protein  36.51 
 
 		 345 aa  224  2e-57  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0893  radical SAM domain-containing protein  36.06 
 
 		 361 aa  223  3e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.910266 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0219  Radical SAM domain protein  37.76 
 
 		 337 aa  223  3e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0211251  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5878  Radical SAM domain protein  35.65 
 
 		 362 aa  223  4e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0206709  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0217  radical SAM domain-containing protein  34.33 
 
 		 356 aa  223  4.9999999999999996e-57  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0898  radical SAM domain-containing protein  36.06 
 
 		 369 aa  222  6e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0464  Radical SAM domain protein  37.16 
 
 		 348 aa  221  9.999999999999999e-57  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.521225  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1999  radical SAM domain-containing protein  36.31 
 
 		 351 aa  220  1.9999999999999999e-56  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.156539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1095  radical SAM domain protein  34.73 
 
 		 345 aa  219  3.9999999999999997e-56  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13159  pyruvate formate lyase activating protein pflA  36.45 
 
 		 362 aa  218  1e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1058  radical SAM domain-containing protein  35.76 
 
 		 382 aa  216  4e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6076  radical SAM family protein  37.35 
 
 		 363 aa  214  9.999999999999999e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0540  radical SAM domain-containing protein  37.05 
 
 		 326 aa  211  1e-53  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2402  radical SAM domain-containing protein  38.33 
 
 		 297 aa  210  3e-53  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6305  Radical SAM domain-containing protein  37.01 
 
 		 388 aa  208  1e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>