More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_1233 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_00263  predicted amino acid dehydrogenase with NAD(P)-binding domain and ferridoxin-like domain  78.86 
 
 
475 aa  806    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3298  iron-sulfur cluster binding protein  78.86 
 
 
475 aa  806    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0258  iron-sulfur cluster binding protein  78.01 
 
 
475 aa  798    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2769  iron-sulfur cluster binding protein  85.84 
 
 
475 aa  859    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1233  iron-sulfur cluster binding protein  100 
 
 
473 aa  989    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.318042  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00267  hypothetical protein  78.86 
 
 
475 aa  806    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1748  iron-sulfur cluster binding protein  80.43 
 
 
474 aa  808    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.131347  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3315  iron-sulfur cluster binding protein  78.86 
 
 
475 aa  806    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0322  iron-sulfur cluster binding protein  78.86 
 
 
475 aa  805    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0339  iron-sulfur cluster binding protein  78.65 
 
 
475 aa  804    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0360  iron-sulfur cluster binding protein  78.86 
 
 
475 aa  805    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.53651  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0710  hypothetical protein  67.53 
 
 
470 aa  690    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0360  iron-sulfur cluster binding protein  78.65 
 
 
475 aa  802    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.400129 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2678  iron-sulfur cluster binding protein  80.21 
 
 
473 aa  815    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0391  iron-sulfur cluster binding protein  55.32 
 
 
475 aa  556  1e-157  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1273  iron-sulfur cluster binding protein  54.04 
 
 
476 aa  549  1e-155  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1025  iron-sulfur cluster-binding protein  55.86 
 
 
473 aa  546  1e-154  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1219  iron-sulfur cluster binding protein  54.8 
 
 
473 aa  540  9.999999999999999e-153  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.394191  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1393  iron-sulfur cluster-binding protein  54.58 
 
 
473 aa  538  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3989  iron-sulfur cluster-binding protein  54.8 
 
 
473 aa  539  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.638276  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1355  iron-sulfur cluster-binding protein  54.8 
 
 
473 aa  539  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1417  iron-sulfur cluster-binding protein  54.58 
 
 
473 aa  538  1e-151  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1457  iron-sulfur cluster-binding protein  54.58 
 
 
473 aa  538  1e-151  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.720803  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1217  iron-sulfur cluster-binding protein  54.58 
 
 
473 aa  538  1e-151  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.387258  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1195  iron-sulfur cluster-binding protein  54.58 
 
 
473 aa  538  1e-151  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1197  iron-sulfur cluster-binding protein  54.58 
 
 
473 aa  538  1e-151  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.208704  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1316  iron-sulfur cluster-binding protein  54.58 
 
 
473 aa  538  1e-151  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0968  iron-sulfur cluster binding protein  52.78 
 
 
476 aa  520  1e-146  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3262  iron-sulfur cluster-binding protein  48.91 
 
 
470 aa  502  1e-141  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3036  iron-sulfur cluster-binding protein  48.91 
 
 
470 aa  501  1e-140  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2957  iron-sulfur cluster-binding protein  48.7 
 
 
470 aa  499  1e-140  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3269  iron-sulfur cluster-binding protein  48.91 
 
 
470 aa  501  1e-140  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0374  iron-sulfur cluster binding protein  46.26 
 
 
495 aa  455  1e-127  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.172404  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3260  iron-sulfur cluster binding protein  45.54 
 
 
480 aa  439  9.999999999999999e-123  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05540  (4Fe-4S) cluster-containing protein  45.24 
 
 
488 aa  427  1e-118  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2994  Iron-sulfur cluster binding protein  44.47 
 
 
489 aa  414  1e-114  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0716  iron-sulfur cluster binding protein  42.92 
 
 
472 aa  409  1e-113  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2719  iron-sulfur cluster binding protein  43.1 
 
 
473 aa  401  9.999999999999999e-111  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0811  iron-sulfur cluster binding protein  42.43 
 
 
470 aa  395  1e-108  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.016821 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4459  iron-sulfur cluster binding protein  41.91 
 
 
470 aa  390  1e-107  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.187768 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1612  putative iron-sulfur binding protein  40.98 
 
 
469 aa  388  1e-106  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1606  protein of unknown function DUF162  39.83 
 
 
469 aa  385  1e-106  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.143052  normal  0.308482 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3244  iron-sulfur cluster binding protein  42.98 
 
 
479 aa  386  1e-106  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.968259  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1934  iron-sulfur cluster binding protein  39.83 
 
 
469 aa  385  1e-106  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.628498  normal  0.020498 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0080  iron-sulfur cluster binding protein  42.55 
 
 
475 aa  382  1e-105  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.157943  unclonable  0.0000167452 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1311  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  40.13 
 
 
470 aa  379  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1754  iron-sulfur cluster binding protein  43.07 
 
 
512 aa  377  1e-103  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.258831  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3165  iron-sulfur cluster binding protein  42.8 
 
 
475 aa  378  1e-103  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1095  iron-sulfur cluster binding protein  40.9 
 
 
463 aa  373  1e-102  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1430  iron-sulfur cluster binding protein  41.53 
 
 
482 aa  375  1e-102  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.461528  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0459  iron-sulfur cluster-binding protein  41.31 
 
 
477 aa  372  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2183  iron-sulfur cluster-binding protein  42.33 
 
 
477 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1874  iron-sulfur cluster binding protein  41.31 
 
 
482 aa  374  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0556  iron-sulfur cluster binding protein  41.31 
 
 
477 aa  372  1e-102  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0868  iron-sulfur cluster-binding protein  42.33 
 
 
477 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.307451  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1207  Iron-sulfur cluster binding protein  39.96 
 
 
470 aa  375  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.112405 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2721  Iron-sulfur cluster binding protein  41.42 
 
 
471 aa  373  1e-102  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.535874  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0368  iron-sulfur cluster binding protein  39.37 
 
 
478 aa  374  1e-102  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2079  iron-sulfur cluster binding protein  40.38 
 
 
482 aa  368  1e-100  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.293755  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1453  putative iron-sulfur cluster binding protein  40.22 
 
 
471 aa  365  1e-99  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00604252  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1463  hypothetical protein  38.77 
 
 
470 aa  364  1e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.57968  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0817  iron-sulfur cluster binding protein  41.22 
 
 
464 aa  364  1e-99  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.244426  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3703  iron-sulfur cluster binding protein  42.65 
 
 
496 aa  364  2e-99  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0892333  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5436  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  39.29 
 
 
470 aa  364  2e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0384157  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2167  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  39.5 
 
 
470 aa  364  2e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.928776  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1140  hypothetical protein  39.71 
 
 
470 aa  364  2e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.344454  normal  0.667086 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2040  hypothetical protein  39.29 
 
 
470 aa  362  7.0000000000000005e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19830  (4Fe-4S) cluster-containing protein  41.08 
 
 
528 aa  361  2e-98  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3605  Iron-sulfur cluster binding protein  39.74 
 
 
472 aa  361  2e-98  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5947  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  39.08 
 
 
470 aa  361  2e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.127817  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3588  iron-sulfur cluster binding protein  38.17 
 
 
469 aa  360  2e-98  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2130  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  39.08 
 
 
470 aa  361  2e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.350099  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5227  iron-sulfur cluster binding protein  40.8 
 
 
493 aa  360  3e-98  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1768  hypothetical protein  38.95 
 
 
490 aa  360  4e-98  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.215438  normal  0.0554235 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1033  iron-sulfur cluster binding protein  40.8 
 
 
493 aa  360  4e-98  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.768116  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2603  iron-sulfur cluster binding protein  38.51 
 
 
483 aa  359  6e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.255424  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1712  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  38.51 
 
 
483 aa  359  6e-98  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1493  putative iron-sulfur cluster-binding protein  38.51 
 
 
483 aa  359  6e-98  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04080  (4Fe-4S) cluster-containing protein  41.98 
 
 
493 aa  359  6e-98  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.066804 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2221  putative iron-sulfur cluster-binding protein  38.51 
 
 
483 aa  359  6e-98  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2147  hypothetical protein  38.87 
 
 
470 aa  359  7e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.68355  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2737  iron-sulfur cluster binding protein  38.51 
 
 
483 aa  358  8e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3099  putative iron-sulfur cluster-binding protein  38.51 
 
 
536 aa  358  8e-98  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.178742  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1871  iron-sulfur cluster binding protein  38.84 
 
 
522 aa  358  8e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.287018  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2659  iron-sulfur cluster binding protein  38.51 
 
 
483 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1217  iron-sulfur cluster binding protein  40.46 
 
 
481 aa  358  9.999999999999999e-98  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.49103  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1463  iron-sulfur cluster binding protein  41.53 
 
 
485 aa  358  9.999999999999999e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0261337  normal  0.617254 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1396  hypothetical protein  42.86 
 
 
465 aa  357  2.9999999999999997e-97  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3562  iron-sulfur cluster binding protein  39.92 
 
 
501 aa  357  2.9999999999999997e-97  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0176735  hitchhiker  0.00702325 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2897  hypothetical protein  39.08 
 
 
473 aa  356  5e-97  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00038131  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2000  iron-sulfur cluster binding protein  42.24 
 
 
481 aa  355  6.999999999999999e-97  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000090477  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0890  iron-sulfur cluster binding protein  40.53 
 
 
510 aa  355  7.999999999999999e-97  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.850775  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3037  protein of unknown function DUF162  41.11 
 
 
467 aa  355  8.999999999999999e-97  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.779274  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1019  ferrodoxin  44.74 
 
 
456 aa  355  8.999999999999999e-97  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2281  iron-sulfur cluster binding protein  41.45 
 
 
476 aa  355  1e-96  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0365  iron-sulfur cluster binding protein  39.5 
 
 
480 aa  354  2e-96  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.146775  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37070  (4Fe-4S) cluster-containing protein  41.42 
 
 
475 aa  354  2e-96  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.621566  normal  0.014795 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1548  putative iron-sulfur binding protein  39.54 
 
 
471 aa  353  4e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.360609  normal  0.0421236 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2710  iron-sulfur cluster binding protein  42.89 
 
 
486 aa  353  5e-96  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.105822 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2584  protein of unknown function DUF162  39.33 
 
 
471 aa  352  5.9999999999999994e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.31363  hitchhiker  0.000668194 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>