More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2441 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_2441  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  100 
 
 		 540 aa  1085    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3991  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  48.07 
 
 		 553 aa  452  1.0000000000000001e-126  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00164194  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0470  sensor histidine kinase  39.14 
 
 		 536 aa  425  1e-118  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.398861  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0615  sensor histidine kinase  39.36 
 
 		 534 aa  424  1e-117  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0620  sensor histidine kinase  41.01 
 
 		 536 aa  419  1e-116  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0688  sensor histidine kinase  38.79 
 
 		 534 aa  420  1e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0527  sensor histidine kinase  38.58 
 
 		 536 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0470  sensor histidine kinase  38.39 
 
 		 536 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.974367  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0559  sensor histidine kinase  38.58 
 
 		 536 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0595  sensor protein CitS  38.23 
 
 		 533 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0472  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  41.01 
 
 		 532 aa  418  9.999999999999999e-116  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4744  sensor protein CitS  40.73 
 
 		 533 aa  412  1e-114  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2789  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  42.07 
 
 		 536 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2898  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  42.3 
 
 		 553 aa  391  1e-107  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0876  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  36.64 
 
 		 537 aa  341  2e-92  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3096  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  35.51 
 
 		 537 aa  332  1e-89  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.955955  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0928  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  35.51 
 
 		 537 aa  332  1e-89  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0938  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  35.51 
 
 		 537 aa  331  2e-89  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.101589 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0904  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  35.51 
 
 		 537 aa  331  2e-89  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3432  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  35.51 
 
 		 537 aa  331  2e-89  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0837  sensor histidine kinase  35.08 
 
 		 529 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1210  putative sensor kinase citA  37.43 
 
 		 538 aa  321  1.9999999999999998e-86  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000551679  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0965  sensor histidine kinase  34.52 
 
 		 529 aa  316  5e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0869  sensor histidine kinase  34.71 
 
 		 529 aa  315  9e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0923  sensor histidine kinase  34.71 
 
 		 529 aa  315  9e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4346  sensor histidine kinase  35.08 
 
 		 529 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.149156  hitchhiker  0.000000000000186115 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003319  sensor kinase CitA  37.25 
 
 		 539 aa  314  2.9999999999999996e-84  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1004  sensor histidine kinase  34.79 
 
 		 529 aa  312  9e-84  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.68776e-61 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1009  sensor histidine kinase  34.15 
 
 		 529 aa  312  1e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0811  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  36.66 
 
 		 529 aa  309  8e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02431  sensor kinase CitA  35.71 
 
 		 541 aa  309  9e-83  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1089  sensor histidine kinase  33.96 
 
 		 529 aa  309  9e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0318  sensor kinase citA  33.59 
 
 		 565 aa  291  3e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0044  sensory histidine kinase DcuS  35.95 
 
 		 542 aa  283  6.000000000000001e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0496  sensory histidine kinase DcuS  32.88 
 
 		 528 aa  280  3e-74  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0489  sensory histidine kinase DcuS  32.24 
 
 		 534 aa  280  4e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0515  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  34.57 
 
 		 526 aa  279  9e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0632  sensory histidine kinase DcuS  32.05 
 
 		 534 aa  278  1e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0487  sensory histidine kinase DcuS  32.05 
 
 		 534 aa  278  1e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0614  sensory histidine kinase DcuS  32.44 
 
 		 534 aa  275  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0639  sensory histidine kinase DcuS  32.17 
 
 		 534 aa  274  3e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0545  sensory histidine kinase DcuS  31.98 
 
 		 534 aa  272  1e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.847766  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0057  sensor kinase DpiB  31.59 
 
 		 552 aa  272  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0425242  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0060  sensor kinase DpiB  31.4 
 
 		 552 aa  272  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0576  sensory histidine kinase DcuS  31.98 
 
 		 534 aa  272  1e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.391584  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0059  sensor kinase DpiB  31.78 
 
 		 552 aa  272  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0058  sensor kinase DpiB  31.4 
 
 		 552 aa  271  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.736152  normal  0.965676 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0038  sensory histidine kinase DcuS  35.17 
 
 		 542 aa  271  2e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0490  sensory histidine kinase DcuS  31.98 
 
 		 534 aa  271  2.9999999999999997e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4725  sensory histidine kinase DcuS  31.78 
 
 		 534 aa  271  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.678206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1377  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  32.62 
 
 		 525 aa  270  4e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4679  sensory histidine kinase DcuS  33.33 
 
 		 543 aa  270  7e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4366  sensory histidine kinase DcuS  33.33 
 
 		 543 aa  269  8e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.206477  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0058  sensor kinase DpiB  31.2 
 
 		 552 aa  269  8.999999999999999e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.390736  normal  0.361929 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5639  sensory histidine kinase DcuS  32.96 
 
 		 543 aa  268  2e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3902  sensory histidine kinase DcuS  32.96 
 
 		 543 aa  268  2e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4645  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  32.88 
 
 		 529 aa  268  2e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0010254  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3867  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  32.77 
 
 		 543 aa  267  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4592  sensory histidine kinase DcuS  32.96 
 
 		 543 aa  268  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0700  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  34.02 
 
 		 543 aa  266  5e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4102  sensory histidine kinase DcuS  34.23 
 
 		 537 aa  266  7e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3731  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  33.74 
 
 		 532 aa  263  6e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.95506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2555  sensory histidine kinase DcuS  32.43 
 
 		 538 aa  261  2e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.129089 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0638  sensor histidine kinase DpiB  30.86 
 
 		 552 aa  256  5e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.736103  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2325  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  33.6 
 
 		 531 aa  257  5e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.18048  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4699  sensory histidine kinase DcuS  33.33 
 
 		 543 aa  256  7e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4567  sensory histidine kinase DcuS  33.14 
 
 		 543 aa  256  7e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4559  sensory histidine kinase DcuS  33.21 
 
 		 543 aa  256  8e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4650  sensory histidine kinase DcuS  33.33 
 
 		 543 aa  256  9e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.414572  normal  0.461897 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4650  sensory histidine kinase DcuS  33.33 
 
 		 543 aa  256  9e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3910  sensory histidine kinase DcuS  32.15 
 
 		 537 aa  256  1.0000000000000001e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0642  sensor histidine kinase DpiB  30.67 
 
 		 552 aa  255  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0459667  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3006  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  30.67 
 
 		 552 aa  254  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3025  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  30.67 
 
 		 552 aa  254  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1959  sensory histidine kinase DcuS  32.42 
 
 		 533 aa  253  6e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00516955 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00589  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with citB  30.48 
 
 		 552 aa  253  7e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0707  sensor histidine kinase DpiB  30.48 
 
 		 552 aa  253  7e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2790  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  33.8 
 
 		 547 aa  252  1e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000273411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0670  sensor histidine kinase DpiB  30.48 
 
 		 552 aa  251  2e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0246714  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3378  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  31.67 
 
 		 545 aa  249  6e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.960766  normal  0.505448 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4311  sensory histidine kinase DcuS  31.59 
 
 		 533 aa  248  3e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000412968  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2021  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  32.06 
 
 		 534 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.769355  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25730  PAS domain S-box  33.68 
 
 		 520 aa  244  1.9999999999999999e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1749  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  30.57 
 
 		 534 aa  240  5e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000244457  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2224  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  32.6 
 
 		 541 aa  238  2e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.691075  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4414  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  34.21 
 
 		 558 aa  235  1.0000000000000001e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0680  sensor kinase DpiB  30.36 
 
 		 553 aa  233  5e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.520362  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0740  sensor kinase DpiB  30.36 
 
 		 553 aa  232  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0666  sensor kinase DpiB  30.36 
 
 		 553 aa  233  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.863518  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0834  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  34.91 
 
 		 540 aa  232  2e-59  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0952704  normal  0.0982471 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0784  sensor kinase DpiB  30.17 
 
 		 553 aa  231  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.636686  normal  0.450792 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0350  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  29.07 
 
 		 555 aa  230  6e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0355  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  33.95 
 
 		 544 aa  218  2e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.514706 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8065  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  31.66 
 
 		 583 aa  218  2.9999999999999998e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2258  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  32.23 
 
 		 542 aa  217  4e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0498367  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5077  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  33.07 
 
 		 558 aa  216  9.999999999999999e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.669392 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8198  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  30.84 
 
 		 538 aa  214  1.9999999999999998e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37840  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  29.31 
 
 		 527 aa  213  1e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.183307 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5600  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  32.53 
 
 		 549 aa  209  9e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0363476  normal  0.371514 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3869  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  29.51 
 
 		 540 aa  208  3e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0780654  normal  0.0130314 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>