65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_2192 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_2192  hypothetical protein  100 
 
 		 255 aa  507  1e-143  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0033  Nitrate reductase gamma subunit  59.29 
 
 		 254 aa  293  2e-78  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3199  nitrate reductase, gamma subunit  49.02 
 
 		 271 aa  212  5.999999999999999e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0075  Nitrate reductase gamma subunit  45.14 
 
 		 289 aa  192  6e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.506128  hitchhiker  0.00856354 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1146  nitrate reductase, gamma subunit  28.42 
 
 		 330 aa  81.3  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.247321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1535  nitrate reductase, gamma subunit  32.28 
 
 		 262 aa  81.6  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2191  Nitrate reductase gamma subunit  30.6 
 
 		 249 aa  81.3  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.258292  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0049  nitrate reductase, gamma subunit  32.31 
 
 		 233 aa  79.3  0.00000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000306057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0906  nitrate reductase, gamma subunit  29.15 
 
 		 257 aa  77.4  0.0000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0256  Nitrate reductase gamma subunit  30.45 
 
 		 333 aa  76.6  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0450  nitrate reductase gamma subunit  31.7 
 
 		 342 aa  75.1  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00150566  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2479  putative DsrM protein  29.6 
 
 		 244 aa  73.6  0.000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1602  nitrate reductase, gamma subunit  28.35 
 
 		 330 aa  71.6  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000153702  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0343  nitrate reductase gamma subunit  29.92 
 
 		 256 aa  70.9  0.00000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0242574 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0070  Nitrate reductase gamma subunit  29.96 
 
 		 335 aa  70.9  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.289973 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0172  nitrate reductase, gamma subunit  29.53 
 
 		 255 aa  68.9  0.00000000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0852  nitrate reductase gamma subunit-like protein  26.5 
 
 		 261 aa  67.8  0.0000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0235  Nitrate reductase gamma subunit  27.9 
 
 		 332 aa  67.4  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.911573  normal  0.884852 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1659  nitrate reductase, gamma subunit  32.43 
 
 		 255 aa  66.6  0.0000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2271  nitrate reductase, gamma subunit, putative  27.64 
 
 		 334 aa  66.2  0.0000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.237982  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0270  Nitrate reductase gamma subunit  28.08 
 
 		 337 aa  65.5  0.0000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00809754  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0037  Nitrate reductase gamma subunit  27.27 
 
 		 331 aa  65.1  0.0000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.548936 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0703  Nitrate reductase gamma subunit  26.52 
 
 		 331 aa  62.8  0.000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0396835  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0136  nitrate reductase, gamma subunit  26.24 
 
 		 331 aa  62.8  0.000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00937433  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1849  Nitrate reductase gamma subunit  27.69 
 
 		 331 aa  60.8  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000160376  normal  0.155774 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1634  hypothetical protein  26.52 
 
 		 220 aa  57.4  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2313  Nitrate reductase gamma subunit  26.15 
 
 		 331 aa  56.2  0.0000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1957  nitrate reductase, gamma subunit  29.02 
 
 		 248 aa  55.5  0.0000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.344796  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1228  nitrate reductase, gamma subunit  27.73 
 
 		 255 aa  55.1  0.000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.389364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1436  respiratory nitrate reductase gamma subunit  27.43 
 
 		 254 aa  53.9  0.000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0971317 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0180  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  23.32 
 
 		 247 aa  53.9  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.363972  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0451  Nitrate reductase gamma subunit  40.21 
 
 		 339 aa  53.5  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.213571  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0044  DsrM protein  26.22 
 
 		 331 aa  53.5  0.000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.877712 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2561  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  26.29 
 
 		 229 aa  52.8  0.000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.40821  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2312  respiratory nitrate reductase gamma subunit  27.57 
 
 		 225 aa  51.2  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2256  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  25.86 
 
 		 234 aa  50.8  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0442548  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1856  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  25.54 
 
 		 225 aa  50.4  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1775  nitrate reductase, gamma subunit  38.46 
 
 		 334 aa  48.5  0.00009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.377874  normal  0.253755 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2638  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  24.9 
 
 		 234 aa  48.5  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1892  respiratory nitrate reductase subunit gamma  25.86 
 
 		 225 aa  48.5  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.644939  normal  0.075518 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1956  respiratory nitrate reductase subunit gamma  25.86 
 
 		 225 aa  48.5  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.817539  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1897  respiratory nitrate reductase subunit gamma  25.86 
 
 		 225 aa  48.5  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.017842  normal  0.804398 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1562  respiratory nitrate reductase gamma subunit  25.86 
 
 		 225 aa  48.5  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.995386 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1379  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  25.86 
 
 		 225 aa  47.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.477496  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1957  nitrate reductase  25 
 
 		 225 aa  45.8  0.0007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.39248 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2418  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  26.29 
 
 		 225 aa  45.4  0.0009  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00170587  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2138  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  23.65 
 
 		 229 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01205  nitrate reductase 1, gamma (cytochrome b(NR)) subunit  26.29 
 
 		 225 aa  45.4  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.372615  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1337  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  26.29 
 
 		 225 aa  45.4  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00180394  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1378  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  26.29 
 
 		 225 aa  45.4  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0653452  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1974  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  23.55 
 
 		 229 aa  44.7  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2396  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  26.29 
 
 		 225 aa  45.4  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000178622 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1912  respiratory nitrate reductase 1, gamma subunit  26.29 
 
 		 225 aa  45.4  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0870039  normal  0.196031 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01215  hypothetical protein  26.29 
 
 		 225 aa  45.4  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.316454  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1528  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  22.27 
 
 		 234 aa  44.7  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000209931  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1395  respiratory nitrate reductase 1, gamma subunit  26.29 
 
 		 225 aa  45.4  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1711  respiratory nitrate reductase 1, gamma subunit  26.29 
 
 		 225 aa  45.4  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.163334  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1948  DsrM protein  23.53 
 
 		 332 aa  43.9  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.542498  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1774  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  24.24 
 
 		 225 aa  43.9  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.079326  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1507  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  27.06 
 
 		 233 aa  43.5  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5681  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  27.54 
 
 		 254 aa  42.4  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.365468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2880  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  25.21 
 
 		 225 aa  42.4  0.007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3177  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  24.38 
 
 		 229 aa  42.4  0.008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2631  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  26.41 
 
 		 225 aa  42  0.009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.997723  normal  0.0188377 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2161  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  23.97 
 
 		 229 aa  42  0.009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>