More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_1766 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_1766  hypothetical protein  100 
 
 
260 aa  542  1e-153  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0201  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich protein  62.45 
 
 
267 aa  336  2.9999999999999997e-91  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1715  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  60.85 
 
 
277 aa  317  1e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43080  hypothetical protein  58.33 
 
 
274 aa  307  9e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0752  hypothetical protein  58.27 
 
 
274 aa  297  1e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.195276 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5378  hypothetical protein  58.5 
 
 
264 aa  294  9e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.441128  normal  0.860708 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6081  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  57.41 
 
 
266 aa  292  4e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.364654 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2803  hypothetical protein  57.03 
 
 
266 aa  290  2e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.632072  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2670  hypothetical protein  56.65 
 
 
266 aa  289  3e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4689  hypothetical protein  55.6 
 
 
261 aa  282  3.0000000000000004e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0364  hypothetical protein  54.12 
 
 
275 aa  279  3e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.228325  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5899  hypothetical protein  55.3 
 
 
261 aa  279  4e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.583895 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5448  hypothetical protein  55.73 
 
 
259 aa  278  5e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.950541  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1421  cysteine-rich domain-containing protein  51.98 
 
 
250 aa  271  6e-72  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1375  hypothetical protein  53.36 
 
 
250 aa  264  1e-69  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.267748  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0397  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  50.58 
 
 
253 aa  259  4e-68  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.110974 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1842  hypothetical protein  52.19 
 
 
265 aa  244  9.999999999999999e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00098228  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1413  hypothetical protein  52.4 
 
 
249 aa  241  7e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.170159  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0086  hypothetical protein  42.68 
 
 
245 aa  214  9.999999999999999e-55  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0071  hypothetical protein  42.68 
 
 
246 aa  213  1.9999999999999998e-54  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0112  hypothetical protein  42.68 
 
 
246 aa  212  5.999999999999999e-54  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1454  cysteine-rich domain protein  40.65 
 
 
245 aa  202  3e-51  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00283589  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0967  hypothetical protein  47.95 
 
 
245 aa  193  2e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0367  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  44.91 
 
 
259 aa  193  3e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0140  hypothetical protein  43.48 
 
 
263 aa  192  4e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1216  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  43.3 
 
 
244 aa  191  8e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.770234  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0717  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  47.25 
 
 
248 aa  191  1e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1310  hypothetical protein  45.81 
 
 
241 aa  189  5e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0884  hypothetical protein  40.41 
 
 
244 aa  188  9e-47  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2080  hypothetical protein  44.29 
 
 
268 aa  186  5e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.945675  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3606  hypothetical protein  44.95 
 
 
270 aa  185  6e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0555  Fe-S oxidoreductase  43.84 
 
 
268 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2182  hypothetical protein  43.84 
 
 
268 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1431  hypothetical protein  43.84 
 
 
268 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.667811  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1873  hypothetical protein  43.84 
 
 
289 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0867  hypothetical protein  43.84 
 
 
268 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.258503  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0458  hypothetical protein  43.84 
 
 
268 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2958  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, iron-sulfur subunit  39.09 
 
 
242 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1769  hypothetical protein  41.83 
 
 
266 aa  183  2.0000000000000003e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.329693  normal  0.0772008 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2995  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  43.32 
 
 
246 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0392  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  41.46 
 
 
238 aa  182  7e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3263  hypothetical protein  38.27 
 
 
242 aa  181  7e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1611  hypothetical protein  43.17 
 
 
241 aa  181  1e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0746419  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3164  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  43.56 
 
 
256 aa  180  2e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3037  hypothetical protein  37.86 
 
 
242 aa  180  2e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.291586  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3270  hypothetical protein  37.86 
 
 
242 aa  180  2e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1206  hypothetical protein  45.58 
 
 
241 aa  179  4.999999999999999e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.546437  normal  0.272976 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1935  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  45.16 
 
 
241 aa  179  5.999999999999999e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.907916  normal  0.0152527 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1607  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  45.16 
 
 
241 aa  178  5.999999999999999e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.096074  normal  0.366344 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1024  hypothetical protein  39.59 
 
 
239 aa  177  2e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1274  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  43.58 
 
 
239 aa  177  2e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0079  hypothetical protein  39.73 
 
 
260 aa  176  4e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.376514  unclonable  0.0000154463 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3259  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  40.25 
 
 
240 aa  176  5e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3990  hypothetical protein  39.18 
 
 
239 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.441671  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1392  hypothetical protein  39.18 
 
 
239 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2222  hypothetical protein  44.49 
 
 
263 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2738  Fe-S oxidoreductase  44.49 
 
 
240 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2718  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  38.27 
 
 
247 aa  172  3.9999999999999995e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1354  hypothetical protein  39.18 
 
 
239 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3098  hypothetical protein  44.49 
 
 
240 aa  172  5e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00812964  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2604  hypothetical protein  44.49 
 
 
240 aa  172  5e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.186656  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1713  hypothetical protein  44.49 
 
 
240 aa  172  5e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.8421  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1494  hypothetical protein  44.49 
 
 
240 aa  172  5e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2660  hypothetical protein  44.49 
 
 
240 aa  172  5e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1416  hypothetical protein  39.18 
 
 
239 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1216  hypothetical protein  39.18 
 
 
239 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0407054  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1194  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, iron-sulfur subunit  39.18 
 
 
239 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1196  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, iron-sulfur subunit  39.18 
 
 
239 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0498426  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1315  hypothetical protein  39.18 
 
 
239 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1456  hypothetical protein  39.18 
 
 
239 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4458  hypothetical protein  39.73 
 
 
247 aa  172  6.999999999999999e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.169961 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1218  hypothetical protein  39.18 
 
 
239 aa  171  6.999999999999999e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0560  hypothetical protein  43.58 
 
 
265 aa  170  2e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.221453  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1096  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  42.27 
 
 
249 aa  170  3e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.757675 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2926  hypothetical protein  41.48 
 
 
256 aa  169  3e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0345775  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3589  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  44.44 
 
 
265 aa  169  4e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1547  hypothetical protein  44.29 
 
 
240 aa  169  6e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.198081  normal  0.0351499 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2585  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  44.75 
 
 
240 aa  168  7e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.749181  hitchhiker  0.00208948 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1464  hypothetical protein  45.21 
 
 
240 aa  168  8e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.270606  normal  0.902058 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0818  hypothetical protein  40.83 
 
 
241 aa  168  9e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.212327  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1870  hypothetical protein  44.1 
 
 
240 aa  168  1e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.214075  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0810  hypothetical protein  39.27 
 
 
249 aa  167  1e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0233285 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05530  Fe-S oxidoreductase  36.89 
 
 
248 aa  166  5e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0338  hypothetical protein  39.43 
 
 
239 aa  165  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1896  Fe-S oxidoreductase  41.39 
 
 
256 aa  165  6.9999999999999995e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.138109  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1690  glycolate oxidase-like protein  39.57 
 
 
274 aa  165  6.9999999999999995e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0359  hypothetical protein  39.43 
 
 
239 aa  163  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.368337  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0321  hypothetical protein  39.43 
 
 
239 aa  163  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0359  cysteine-rich domain protein  39.43 
 
 
239 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.477523 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0259  cysteine-rich domain protein  39.43 
 
 
239 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1139  hypothetical protein  41.85 
 
 
236 aa  163  3e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.79138  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00262  predicted oxidoreductase  39.02 
 
 
239 aa  161  1e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3299  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  39.02 
 
 
239 aa  161  1e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00266  hypothetical protein  39.02 
 
 
239 aa  161  1e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2148  hypothetical protein  41.48 
 
 
240 aa  159  5e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.11459  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3316  hypothetical protein  38.62 
 
 
239 aa  159  5e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2168  hypothetical protein  41.05 
 
 
240 aa  159  6e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2041  hypothetical protein  41.05 
 
 
240 aa  158  7e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.914482  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5452  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  38.07 
 
 
239 aa  158  1e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.625319 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1905  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  37.33 
 
 
245 aa  156  2e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>