More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_4946 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_4946  uridylate kinase  100 
 
 		 240 aa  482  1e-135  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.723957 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1825  uridylate kinase  93.33 
 
 		 240 aa  447  1e-125  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.537862  normal  0.866362 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2583  uridylate kinase  92.5 
 
 		 240 aa  446  1.0000000000000001e-124  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.284597  normal  0.0617202 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1225  uridylate kinase  92.5 
 
 		 240 aa  446  1.0000000000000001e-124  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0229654  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1440  uridylate kinase  89.96 
 
 		 240 aa  437  9.999999999999999e-123  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.610442 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2601  uridylate kinase  87.5 
 
 		 240 aa  425  1e-118  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1991  uridylate kinase  87.5 
 
 		 240 aa  425  1e-118  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1760  uridylate kinase  86.32 
 
 		 236 aa  410  1e-114  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0656922 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2693  uridylate kinase  86.75 
 
 		 236 aa  409  1e-113  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.506156  normal  0.870267 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1977  uridylate kinase  82.91 
 
 		 236 aa  402  1e-111  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0969376 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2848  uridylate kinase  82.91 
 
 		 236 aa  399  9.999999999999999e-111  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.892922 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2491  uridylate kinase  79.83 
 
 		 237 aa  387  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1553  uridylate kinase  79.83 
 
 		 237 aa  387  1e-107  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3257  uridylate kinase  79.83 
 
 		 237 aa  387  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1336  uridylate kinase  79.4 
 
 		 237 aa  387  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.399857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1879  uridylate kinase  79.91 
 
 		 236 aa  389  1e-107  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.422558  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2581  uridylate kinase  79.83 
 
 		 237 aa  387  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2037  uridylate kinase  79.08 
 
 		 237 aa  390  1e-107  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.865842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5327  uridylate kinase  79.08 
 
 		 237 aa  389  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0388616  normal  0.289961 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1919  uridylate kinase  79.08 
 
 		 237 aa  389  1e-107  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.302064 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2435  uridylate kinase  79.83 
 
 		 237 aa  387  1e-107  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0771842  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1259  uridylate kinase  79.08 
 
 		 237 aa  390  1e-107  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.370411  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2029  uridylate kinase  79.08 
 
 		 237 aa  389  1e-107  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1684  uridylate kinase  79.83 
 
 		 237 aa  388  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.193496 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1437  uridylate kinase  79.06 
 
 		 258 aa  388  1e-107  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.439884  hitchhiker  0.000435544 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6060  uridylate kinase  79.08 
 
 		 237 aa  390  1e-107  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2050  uridylate kinase  79.08 
 
 		 237 aa  389  1e-107  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1326  uridylate kinase  79.83 
 
 		 237 aa  387  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.280205  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2017  uridylate kinase  79.08 
 
 		 237 aa  390  1e-107  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1406  uridylate kinase  79.06 
 
 		 236 aa  385  1e-106  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1344  uridylate kinase  78.63 
 
 		 236 aa  385  1e-106  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0291388  normal  0.514352 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2054  uridylate kinase  79.83 
 
 		 286 aa  386  1e-106  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1280  uridylate kinase  78.63 
 
 		 236 aa  385  1e-106  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.23079 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2453  uridylate kinase  79.4 
 
 		 237 aa  387  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.176053  hitchhiker  0.00168891 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1528  uridylate kinase  76.6 
 
 		 238 aa  367  1e-100  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000286053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1744  uridylate kinase  73.84 
 
 		 238 aa  363  1e-99  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0659  uridylate kinase  74.25 
 
 		 238 aa  362  3e-99  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2176  uridylate kinase  75.85 
 
 		 237 aa  357  9.999999999999999e-98  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.175348  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0509  uridylate kinase  71.37 
 
 		 236 aa  354  7.999999999999999e-97  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  decreased coverage  0.00424433  normal  0.390175 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1449  uridylate kinase  71.37 
 
 		 236 aa  353  2e-96  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1446  uridylate kinase  63.83 
 
 		 241 aa  318  3.9999999999999996e-86  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0296877  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1162  uridylate kinase  63.83 
 
 		 241 aa  318  3.9999999999999996e-86  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.899352 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1161  uridylate kinase  60.94 
 
 		 242 aa  303  2.0000000000000002e-81  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1780  uridylate kinase  57.14 
 
 		 245 aa  295  5e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0302  uridylate kinase  57.81 
 
 		 251 aa  293  1e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0291  uridylate kinase  57.81 
 
 		 251 aa  293  1e-78  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1861  uridylate kinase  59.15 
 
 		 242 aa  293  1e-78  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.57108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0280  uridylate kinase  57.38 
 
 		 251 aa  292  4e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2710  uridylate kinase  59.91 
 
 		 239 aa  291  5e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0334145  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1464  uridylate kinase  58.8 
 
 		 246 aa  291  5e-78  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.360774  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1495  uridylate kinase  58.8 
 
 		 245 aa  291  7e-78  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1274  uridylate kinase  58.55 
 
 		 240 aa  290  1e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.000592855  normal  0.537978 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0304  uridylate kinase  58.8 
 
 		 249 aa  290  2e-77  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.336367  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0575  uridylate kinase  58.44 
 
 		 236 aa  288  5.0000000000000004e-77  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000374821  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1485  uridylate kinase  59.23 
 
 		 245 aa  288  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0971129  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17080  uridylate kinase  58.4 
 
 		 245 aa  288  6e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3051  uridylate kinase  58.65 
 
 		 247 aa  288  7e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.658125  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23620  uridylate kinase  56.47 
 
 		 238 aa  287  9e-77  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.240792 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0506  uridylate kinase  56.96 
 
 		 253 aa  286  2e-76  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2813  uridylate kinase  57.32 
 
 		 242 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000178948  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1593  uridylate kinase  57.56 
 
 		 247 aa  285  4e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.556866  normal  0.62461 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1252  uridylate kinase  58.8 
 
 		 239 aa  285  4e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000157297  hitchhiker  0.0010531 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4184  uridylate kinase  57.56 
 
 		 247 aa  285  4e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38970  uridylate kinase  57.56 
 
 		 249 aa  285  5.999999999999999e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.765948  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2639  uridylate kinase  56.9 
 
 		 242 aa  285  5.999999999999999e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000176881  normal  0.106095 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2706  uridylate kinase  56.9 
 
 		 242 aa  285  5.999999999999999e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000157467  hitchhiker  0.00256739 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1631  uridylate kinase  56.9 
 
 		 242 aa  284  8e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1536  uridylate kinase  59.31 
 
 		 247 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1345  uridylate kinase  59.31 
 
 		 246 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.15269  normal  0.199974 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0810  uridylate kinase  54.62 
 
 		 243 aa  283  1.0000000000000001e-75  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.128283  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3731  uridylate kinase  58.01 
 
 		 239 aa  283  1.0000000000000001e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000303912  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1015  uridylate kinase  56.96 
 
 		 241 aa  283  2.0000000000000002e-75  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000066823  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1068  uridylate kinase  56.96 
 
 		 241 aa  283  2.0000000000000002e-75  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0422743  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3433  uridylate kinase  56.54 
 
 		 241 aa  283  2.0000000000000002e-75  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00014808  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0569  uridylate kinase  57.08 
 
 		 239 aa  282  3.0000000000000004e-75  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0199156  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1350  uridylate kinase  56.07 
 
 		 245 aa  282  3.0000000000000004e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000001593  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2595  uridylate kinase  57.58 
 
 		 247 aa  282  3.0000000000000004e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0151239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0709  uridylate kinase  57.38 
 
 		 241 aa  282  3.0000000000000004e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0908162  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00169  uridylate kinase  57.38 
 
 		 241 aa  281  4.0000000000000003e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0505974  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3432  uridylate kinase  57.38 
 
 		 241 aa  281  4.0000000000000003e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0174185  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1919  uridylate kinase  57.94 
 
 		 239 aa  282  4.0000000000000003e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0182  uridylate kinase  57.38 
 
 		 241 aa  281  4.0000000000000003e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0585328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0175  uridylate kinase  57.38 
 
 		 241 aa  281  4.0000000000000003e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000281467  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0173  uridylate kinase  57.38 
 
 		 241 aa  281  4.0000000000000003e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.120351  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3489  uridylate kinase  57.38 
 
 		 241 aa  281  4.0000000000000003e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.257153  normal  0.522631 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0164  uridylate kinase  57.38 
 
 		 241 aa  281  4.0000000000000003e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0156878  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1148  uridylate kinase  57.14 
 
 		 247 aa  282  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0181  uridylate kinase  57.38 
 
 		 241 aa  281  4.0000000000000003e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000366692  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0943  uridylate kinase  56.96 
 
 		 241 aa  281  5.000000000000001e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00384678  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3279  uridylate kinase  55.65 
 
 		 245 aa  281  6.000000000000001e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00055393  hitchhiker  0.000297429 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3163  uridylate kinase  56.54 
 
 		 243 aa  281  6.000000000000001e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.117017  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1447  uridylate kinase  56.07 
 
 		 245 aa  281  7.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000325029  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3788  uridylate kinase  56.54 
 
 		 241 aa  281  7.000000000000001e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00180508 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1452  uridylate kinase  56.07 
 
 		 245 aa  281  7.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000689746  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2900  uridylate kinase  56.07 
 
 		 245 aa  281  7.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000103165  normal  0.114496 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1483  uridylate kinase  56.07 
 
 		 245 aa  281  7.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000885565  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0258  uridylate kinase  57.38 
 
 		 241 aa  281  8.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00100769  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0240  uridylate kinase  57.38 
 
 		 241 aa  281  8.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.432338 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0256  uridylate kinase  57.38 
 
 		 241 aa  281  8.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.923917 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0243  uridylate kinase  57.38 
 
 		 241 aa  281  8.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>