33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_2202 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1675  hypothetical protein  71.76 
 
 
689 aa  1018    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.404714  hitchhiker  0.000649266 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2202  hypothetical protein  100 
 
 
670 aa  1392    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.501325  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3729  alkaline phosphatase domain-containing protein  60.29 
 
 
703 aa  875    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.141206  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0565  hypothetical protein  69.9 
 
 
686 aa  1001    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.642014  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02910  conserved hypothetical protein TIGR02688  52.53 
 
 
694 aa  721    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000891633  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4849  hypothetical protein  44.3 
 
 
675 aa  570  1e-161  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.895704  normal  0.860028 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5032  putative ATP-dependent Lon protease  46.88 
 
 
686 aa  460  9.999999999999999e-129  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2488  ATP-dependent Lon protease  48.65 
 
 
678 aa  460  9.999999999999999e-129  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2283  ATP-dependent Lon-type protease  48.07 
 
 
679 aa  456  1e-127  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0341  hypothetical protein  47 
 
 
694 aa  450  1e-125  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.168371  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0301  putative ATP-dependent Lon protease  45.51 
 
 
676 aa  451  1e-125  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1906  ATP-dependent protease La  45.17 
 
 
687 aa  445  1e-123  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.672246  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2105  hypothetical protein  45.64 
 
 
676 aa  426  1e-118  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_258  ATP-dependent Lon protease  44.51 
 
 
676 aa  425  1e-117  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1126  hypothetical protein  43.04 
 
 
678 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.596948  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0999  ATP-dependent protease La  42.54 
 
 
679 aa  398  1e-109  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.48984  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2041  ATP-dependent protease La  39.59 
 
 
684 aa  382  1e-105  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1077  putative ATP-dependent Lon protease  42.64 
 
 
681 aa  367  1e-100  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.543626 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3231  putative ATP-dependent Lon protease  40.65 
 
 
684 aa  352  1e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2236  putative ATP-dependent Lon protease  41.52 
 
 
682 aa  350  5e-95  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000058517 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1136  putative ATP-dependent Lon protease  39 
 
 
682 aa  342  1e-92  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.541958  hitchhiker  0.000000432292 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2752  putative ATP-dependent Lon protease  37 
 
 
682 aa  334  4e-90  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1323  putative ATP-dependent Lon protease  38.91 
 
 
681 aa  333  7.000000000000001e-90  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1245  ATP-dependent Lon-type protease  32.89 
 
 
531 aa  238  3e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.587882  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3353  hypothetical protein  33.89 
 
 
508 aa  234  4.0000000000000004e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1800  ATP-dependent protease La  30.39 
 
 
469 aa  224  4.9999999999999996e-57  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.186498  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1063  hypothetical protein  28.94 
 
 
477 aa  201  3.9999999999999996e-50  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0757607  hitchhiker  0.000125956 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1754  hypothetical protein  30.95 
 
 
473 aa  194  4e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1519  ATP-dependent protease La  30.37 
 
 
470 aa  183  7e-45  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0803  ATP-dependent protease La  26.8 
 
 
485 aa  163  1e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0793  ATP-dependent Lon-type protease-like protein  27.03 
 
 
485 aa  152  2e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0583  ATP-dependent protease La  29.89 
 
 
186 aa  78.6  0.0000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1406  hypothetical protein  29.19 
 
 
914 aa  72  0.00000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>