61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1097 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1097  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  100 
 
 		 257 aa  519  1e-146  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000231282  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1703  peptidase S14 ClpP  71.31 
 
 		 254 aa  353  2e-96  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000655286  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1633  peptidase S14, ClpP  68.78 
 
 		 238 aa  334  5.999999999999999e-91  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000279538  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1267  peptidase S14, ClpP  72.22 
 
 		 267 aa  330  1e-89  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.394394  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1071  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  65.49 
 
 		 259 aa  322  5e-87  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.340083  normal  0.0736757 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1461  peptidase S14 ClpP  68.84 
 
 		 259 aa  318  6e-86  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0358067  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1266  peptidase S14 ClpP  66.21 
 
 		 234 aa  317  7.999999999999999e-86  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.720107  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3566  peptidase S14 ClpP  67.44 
 
 		 249 aa  313  9.999999999999999e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000648682  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1937  peptidase S14, ClpP  64.84 
 
 		 276 aa  312  2.9999999999999996e-84  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3895  clp protease  66.51 
 
 		 249 aa  310  1e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00193519  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2064  peptidase S14 ClpP  66.82 
 
 		 246 aa  310  1e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2448  peptidase S14 ClpP  65.14 
 
 		 250 aa  310  2e-83  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.522439  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1172  peptidase S14 ClpP  63.29 
 
 		 245 aa  310  2e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000317379  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3537  translocation-enhancing protein  65.58 
 
 		 249 aa  310  2e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000163872  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3555  translocation-enhancing protein  65.58 
 
 		 249 aa  309  2e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3844  clp protease  65.58 
 
 		 249 aa  309  2e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000681675  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3808  clp protease  65.58 
 
 		 249 aa  309  2e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.27202e-31 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1404  clp protease  67.45 
 
 		 249 aa  309  2.9999999999999997e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000177875  hitchhiker  0.00000000296057 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3932  hypothetical protein  65.12 
 
 		 249 aa  308  5e-83  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00334728  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3647  hypothetical protein  65.12 
 
 		 249 aa  308  5e-83  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3831  hypothetical protein  65.58 
 
 		 249 aa  308  5e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000217927  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0829  peptidase S14, ClpP  62.11 
 
 		 266 aa  307  9e-83  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08720  peptidase S14 ClpP  62.17 
 
 		 264 aa  306  2.0000000000000002e-82  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.185019  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1461  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  63.94 
 
 		 280 aa  292  4e-78  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1649  Clp protease  64.22 
 
 		 229 aa  285  5.999999999999999e-76  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1931  Clp protease  64.22 
 
 		 229 aa  285  7e-76  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.75511  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2759  peptidase S14 ClpP  57.14 
 
 		 316 aa  272  5.000000000000001e-72  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00664159  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3132  peptidase S14 ClpP  54.87 
 
 		 230 aa  267  1e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  7.17903e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1429  Endopeptidase Clp  26.62 
 
 		 210 aa  52.8  0.000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0700  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  28.03 
 
 		 199 aa  50.1  0.00003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000807571  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0715  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  24.64 
 
 		 196 aa  47.8  0.0002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2166  Endopeptidase Clp  28.82 
 
 		 221 aa  47  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.223886 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3055  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  28.49 
 
 		 235 aa  46.6  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0863  peptidase S49  24.18 
 
 		 552 aa  45.8  0.0006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0954  peptidase S14 ClpP  24.34 
 
 		 355 aa  45.4  0.0008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000584125 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2052  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  25.81 
 
 		 201 aa  45.1  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.913784  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6060  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  25.16 
 
 		 203 aa  45.4  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.353257  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0766  endopeptidase Clp  24.07 
 
 		 195 aa  44.3  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000455068  hitchhiker  1.46896e-16 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1051  Endopeptidase Clp  25.97 
 
 		 218 aa  44.7  0.002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0321666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1476  endopeptidase Clp  27.33 
 
 		 219 aa  43.9  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.219391  normal  0.220131 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1978  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  24.36 
 
 		 197 aa  44.7  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0100238 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3642  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  26.52 
 
 		 202 aa  43.9  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.349726  normal  0.779583 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3662  endopeptidase Clp  27.33 
 
 		 219 aa  43.5  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.711446  normal  0.125677 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1385  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  27.39 
 
 		 194 aa  43.9  0.003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0104132  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1647  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  27.39 
 
 		 194 aa  43.9  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2790  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  23.93 
 
 		 202 aa  43.5  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1434  peptidase S49  23.64 
 
 		 552 aa  43.1  0.004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1672  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  24.03 
 
 		 197 aa  43.1  0.004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.122412  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2340  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  28.21 
 
 		 213 aa  43.1  0.004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0274292  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1102  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  24.53 
 
 		 197 aa  42.7  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.270574 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1864  peptidase S49  22.05 
 
 		 550 aa  43.1  0.005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.534893 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3421  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  28.39 
 
 		 204 aa  42.7  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.461069  normal  0.155928 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0809  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  24.03 
 
 		 195 aa  42.7  0.006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0793  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  24.03 
 
 		 195 aa  42.7  0.006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0153  peptidase S49  24.48 
 
 		 612 aa  42.7  0.006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.908032 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1585  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  27.62 
 
 		 196 aa  42.7  0.006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0454013  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0709  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  25.81 
 
 		 195 aa  42.4  0.007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1011  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  27.85 
 
 		 219 aa  42.4  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.258522  normal  0.818355 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3828  endopeptidase Clp  25.32 
 
 		 218 aa  42.4  0.008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0167081  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4515  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  24.84 
 
 		 202 aa  42  0.01  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000010245  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1537  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  25.79 
 
 		 200 aa  42  0.01  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.17923  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>