More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0546 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_0546  ferric uptake regulator family protein  100 
 
 		 139 aa  286  6e-77  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1373  ferric uptake regulator, Fur family  45.31 
 
 		 135 aa  116  9e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000536701  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3007  ferric uptake regulator, Fur family  43.55 
 
 		 143 aa  113  7.999999999999999e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0515  ferric uptake regulator, Fur family  39.1 
 
 		 142 aa  109  2.0000000000000002e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1138  ferric uptake regulator, Fur family  42.06 
 
 		 143 aa  101  3e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.716078  normal  0.825565 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2468  ferric uptake regulator, Fur family  32.59 
 
 		 146 aa  101  4e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0653957  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0045  ferric uptake regulator, Fur family  43.2 
 
 		 137 aa  100  6e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.4921e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1379  ferric uptake regulation protein Fur  33.83 
 
 		 143 aa  100  8e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.404925  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3367  ferric uptake regulator family protein  37.12 
 
 		 149 aa  99.8  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2612  ferric uptake regulator, Fur family  35.46 
 
 		 146 aa  96.7  1e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.539435  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2295  ferric uptake regulator family protein  34.72 
 
 		 159 aa  95.9  2e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1036  transcriptional regulator, Fur family  39.06 
 
 		 151 aa  95.5  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0163253  normal  0.210334 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4201  transcriptional regulator, Fur family  39.06 
 
 		 151 aa  95.5  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0217905  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4160  FUR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 151 aa  95.1  3e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4001  FUR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 151 aa  95.1  3e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000832394  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3832  FUR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 151 aa  95.1  3e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3848  FUR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 151 aa  95.1  3e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000844204  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4313  FUR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 151 aa  95.1  3e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.175912  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4224  transcriptional regulator, Fur family  39.06 
 
 		 151 aa  95.1  3e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00546613  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4115  transcriptional regulator, Fur family  39.06 
 
 		 151 aa  95.1  3e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5116299999999997e-20 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2790  ferric uptake regulator family protein  39.06 
 
 		 151 aa  94.7  3e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000512773  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05900  ferric uptake regulator, Fur family  35.82 
 
 		 145 aa  94.7  4e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000248432  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3922  ferric uptake regulator family protein  39.06 
 
 		 151 aa  94  6e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000000572819  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0772  ferric uptake regulator family protein  33.33 
 
 		 147 aa  94  6e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.230128  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4134  ferric uptake regulator, Fur family  31.71 
 
 		 132 aa  93.6  9e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2445  ferric uptake regulator family protein  30.88 
 
 		 143 aa  93.6  9e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000164453  normal  0.662654 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4174  ferric uptake regulator, Fur family  31.71 
 
 		 132 aa  93.6  9e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0365  ferric uptake regulator, Fur family  37.31 
 
 		 150 aa  93.2  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3002  ferric uptake regulator family protein  30.66 
 
 		 153 aa  93.2  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000499535  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2644  ferric uptake regulator family protein  34.88 
 
 		 146 aa  91.7  3e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0650  ferric uptake regulator family protein  37.01 
 
 		 144 aa  92  3e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000137697  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1892  Fur family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 141 aa  92  3e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4383  ferric uptake regulator, Fur family  31.71 
 
 		 132 aa  91.3  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.134348 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0817  ferric uptake regulator family protein  29.37 
 
 		 130 aa  90.9  5e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2982  ferric uptake regulator, Fur family  35.07 
 
 		 154 aa  90.9  5e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000154751  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4185  ferric uptake regulator, Fur family  32.61 
 
 		 139 aa  90.5  7e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.421488  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2248  ferric uptake regulator, Fur family  31.71 
 
 		 133 aa  90.5  7e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0111232 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1555  ferric uptake regulator family protein  37.59 
 
 		 149 aa  89.7  1e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1493  ferric uptake regulator family protein  35.66 
 
 		 146 aa  89.7  1e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000138692  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0939  ferric uptake regulator family protein  36.64 
 
 		 158 aa  89.7  1e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1587  ferric uptake regulator, Fur family  31.39 
 
 		 143 aa  89.7  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000012945  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1586  ferric-uptake regulator  37.59 
 
 		 149 aa  89.7  1e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.501887  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3370  ferric uptake regulator, Fur family  35.2 
 
 		 167 aa  89.4  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.073099  normal  0.112136 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1562  ferric uptake regulator, Fur family  37.23 
 
 		 147 aa  89  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1061  FUR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 149 aa  88.2  3e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.304588  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2626  ferric uptake regulator, Fur family  29.93 
 
 		 143 aa  88.2  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2867  ferric uptake regulator, Fur family  37.5 
 
 		 149 aa  88.2  3e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000960204  decreased coverage  0.0000000000000181287 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0753  ferric uptake regulator family protein  31.62 
 
 		 144 aa  88.2  4e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3820  ferric uptake regulator family protein  34.43 
 
 		 131 aa  87.8  4e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.396621  normal  0.536437 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3508  ferric uptake regulator  30.33 
 
 		 134 aa  87.4  5e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0405  ferric uptake regulator family protein  31.4 
 
 		 134 aa  87  9e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.165057 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1953  ferric uptake regulator family protein  31.15 
 
 		 131 aa  85.5  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00726041 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2373  ferric uptake regulator, Fur family  33.06 
 
 		 154 aa  85.1  3e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000416204 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1434  ferric uptake regulator  33.59 
 
 		 161 aa  84.7  3e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000031646  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0885  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  34.13 
 
 		 142 aa  84.7  4e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0293678  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2638  zinc uptake regulator  32.23 
 
 		 154 aa  84.3  5e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.777884  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0630  FUR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 143 aa  84  6e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1451  ferric uptake regulation protein  35.56 
 
 		 155 aa  84  6e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000060196  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2259  ferric uptake regulator, Fur family  38.06 
 
 		 154 aa  84  6e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12385  ferric uptake regulation protein furB  28.46 
 
 		 130 aa  84  6e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.473792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1389  ferric uptake regulation protein  35.56 
 
 		 145 aa  84  6e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.000000498211  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1789  ferric uptake regulator, Fur family  29.23 
 
 		 151 aa  84  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.372499  normal  0.929582 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0438  ferric uptake regulation protein  35.38 
 
 		 136 aa  84  7e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0414  ferric uptake regulation protein  35.38 
 
 		 136 aa  84  7e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1905  ferric uptake regulator family protein  33.08 
 
 		 140 aa  84  7e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0265  ferric-uptake regulator family  33.58 
 
 		 144 aa  83.6  9e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.460406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2810  ferric uptake regulator  32.81 
 
 		 143 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.644684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4078  ferric uptake regulator, Fur family  31.39 
 
 		 144 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000739269  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0449  ferric uptake regulation protein  30.6 
 
 		 157 aa  83.2  0.000000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.270092  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_19  transcriptional regulator, Fur family  35.16 
 
 		 142 aa  83.2  0.000000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.677591  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2717  ferric uptake regulator family protein  30.33 
 
 		 134 aa  83.2  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.519221 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1557  ferric uptake regulation protein  30.6 
 
 		 157 aa  83.2  0.000000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.754844  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1934  zinc uptake regulator  31.97 
 
 		 135 aa  83.2  0.000000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.395595  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0487  ferric uptake regulation protein  31.01 
 
 		 151 aa  82.8  0.000000000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3230  ferric uptake regulator, Fur family  35.48 
 
 		 150 aa  82.8  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0854036  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0423  ferric uptake regulation protein  30.6 
 
 		 157 aa  83.2  0.000000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00356258  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0020  FUR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 142 aa  82.4  0.000000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.147149  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0519  ferric uptake regulator family protein  30.33 
 
 		 135 aa  82  0.000000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.639512  normal  0.494415 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1842  ferric uptake regulator  32.81 
 
 		 143 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000122874  normal  0.0218944 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1885  ferric uptake regulator family protein  33.58 
 
 		 143 aa  82.4  0.000000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3458  zinc uptake regulator  31.71 
 
 		 131 aa  82  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.455544  normal  0.210399 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0291  ferric uptake regulator family protein  32.35 
 
 		 144 aa  81.6  0.000000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.420841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_571  transcriptional regulator, Fur family  31.75 
 
 		 143 aa  81.6  0.000000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3447  zinc uptake regulator  31.71 
 
 		 131 aa  82  0.000000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0819749  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3510  zinc uptake regulator  31.71 
 
 		 131 aa  82  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.11469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4538  ferric uptake regulator family protein  32 
 
 		 134 aa  81.6  0.000000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0148082  normal  0.344615 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0802  ferric uptake regulator family protein  38.21 
 
 		 121 aa  81.3  0.000000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1842  ferric uptake regulator  32.81 
 
 		 143 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000000255764  normal  0.0169118 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2622  ferric uptake regulator  32.81 
 
 		 143 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000000743772  normal  0.0672977 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2509  ferric uptake regulator  32.81 
 
 		 143 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000631479  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2502  ferric uptake regulator  32.81 
 
 		 143 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000739379  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0825  ferric uptake regulator family protein  38.21 
 
 		 121 aa  81.3  0.000000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1398  FUR family transcriptional regulator  27.48 
 
 		 150 aa  80.9  0.000000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1796  ferric uptake regulator  32.81 
 
 		 143 aa  80.9  0.000000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0654147  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1293  ferric uptake regulator family protein  26.28 
 
 		 149 aa  80.9  0.000000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.998505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2338  ferric uptake regulator  32.03 
 
 		 169 aa  80.9  0.000000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.807618  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0453  ferric uptake regulator family protein  27.94 
 
 		 142 aa  80.5  0.000000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.964373  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0593  transcriptional regulator, Fur family  27.94 
 
 		 142 aa  80.5  0.000000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000040057  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4784  transcriptional regulator, Fur family  27.94 
 
 		 142 aa  80.5  0.000000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000324074  hitchhiker  0.00000172777 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2340  ferric uptake regulator family protein  31.36 
 
 		 135 aa  80.5  0.000000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0648274  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>