More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1637 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1637  translation initiation factor IF-1  100 
 
 		 72 aa  147  4e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.367326  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0624  translation initiation factor IF-1  81.94 
 
 		 72 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1916  translation initiation factor IF-1  77.78 
 
 		 72 aa  121  3e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4365  translation initiation factor IF-1  77.78 
 
 		 72 aa  121  3e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.286797  normal  0.304596 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3140  translation initiation factor IF-1  75 
 
 		 72 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.222249  normal  0.343136 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1168  translation initiation factor IF-1  74.65 
 
 		 71 aa  117  3.9999999999999996e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.143107  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0376  translation initiation factor IF-1  74.65 
 
 		 71 aa  116  7.999999999999999e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5765  translation initiation factor IF-1  73.61 
 
 		 72 aa  116  7.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.959499 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3972  translation initiation factor IF-1  77.78 
 
 		 72 aa  115  9.999999999999999e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1809  translation initiation factor IF-1  73.61 
 
 		 72 aa  115  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.23928  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0680  translation initiation factor IF-1  76.39 
 
 		 72 aa  114  3e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.453286 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0864  translation initiation factor IF-1  70.83 
 
 		 72 aa  114  3e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.177716  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2296  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 		 72 aa  114  3e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2255  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 		 72 aa  114  3e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0195898  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05825  translation initiation factor IF-1  71.83 
 
 		 71 aa  112  1.0000000000000001e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.193917  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0134  translation initiation factor IF-1  68.06 
 
 		 72 aa  111  3e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000106677  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19760  translation initiation factor 1  72.22 
 
 		 72 aa  111  4.0000000000000004e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00431201  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0130  translation initiation factor IF-1  66.67 
 
 		 72 aa  110  6e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01400  translation initiation factor IF-1  69.44 
 
 		 75 aa  110  6e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000118167  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2809  translation initiation factor IF-1  70.83 
 
 		 72 aa  110  7.000000000000001e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000000371749  hitchhiker  0.00000000419913 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2688  translation initiation factor IF-1  66.67 
 
 		 72 aa  110  7.000000000000001e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00223234  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0218  translation initiation factor 1 (bIF-1)  69.44 
 
 		 85 aa  110  7.000000000000001e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0498  translation initiation factor IF-1  70.83 
 
 		 72 aa  109  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0300  translation initiation factor IF-1  73.61 
 
 		 72 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000000294229  hitchhiker  0.0000161331 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2132  translation initiation factor IF-1  70.83 
 
 		 72 aa  109  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2042  translation initiation factor IF-1  69.44 
 
 		 72 aa  108  3e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000556493  normal  0.276902 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3276  translation initiation factor IF-1  70.83 
 
 		 72 aa  107  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000759571 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2132  translation initiation factor 1  66.67 
 
 		 73 aa  107  4.0000000000000004e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0444568  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1857  translation initiation factor IF-1  68.06 
 
 		 72 aa  108  4.0000000000000004e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0737608  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1578  translation initiation factor IF-1  69.44 
 
 		 73 aa  108  4.0000000000000004e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.0000164388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4295  translation initiation factor IF-1  68.57 
 
 		 73 aa  107  5e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0203  translation initiation factor IF-1  68.06 
 
 		 72 aa  107  5e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00000000310182  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1501  translation initiation factor IF-1  63.89 
 
 		 72 aa  107  5e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01400  translation initiation factor 1  69.44 
 
 		 72 aa  107  5e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0644583  normal  0.998737 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0336  translation initiation factor IF-1  70.83 
 
 		 72 aa  107  6e-23  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0311  translation initiation factor IF-1  68.06 
 
 		 72 aa  107  6e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000252323  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1138  translation initiation factor IF-1  70.83 
 
 		 72 aa  107  6e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000117845  normal  0.0449626 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3422  translation initiation factor IF-1  70.83 
 
 		 72 aa  107  7.000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.198765 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2207  translation initiation factor IF-1  66.67 
 
 		 72 aa  107  7.000000000000001e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000268658  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2929  translation initiation factor IF-1  70.83 
 
 		 72 aa  107  8.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000204255 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0729  translation initiation factor IF-1  66.67 
 
 		 72 aa  107  8.000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000728141  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2949  translation initiation factor IF-1  69.44 
 
 		 72 aa  107  8.000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0071  translation initiation factor IF-1  69.44 
 
 		 72 aa  106  9.000000000000001e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.358943  hitchhiker  0.000000000845588 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3623  translation initiation factor IF-1  69.44 
 
 		 72 aa  106  9.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000249232  hitchhiker  0.0000000000154943 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0270  translation initiation factor IF-1  69.44 
 
 		 72 aa  106  9.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.712061  normal  0.0408075 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3755  translation initiation factor IF-1  69.44 
 
 		 72 aa  106  9.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0935334  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3468  translation initiation factor IF-1  69.44 
 
 		 72 aa  106  9.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.623681  normal  0.410728 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3614  translation initiation factor 1  70 
 
 		 72 aa  106  9.000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000124653  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0788  translation initiation factor IF-1  70.83 
 
 		 72 aa  106  9.000000000000001e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0427715  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3783  translation initiation factor IF-1  69.44 
 
 		 72 aa  106  9.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.752054  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3047  translation initiation factor IF-1  69.44 
 
 		 72 aa  106  9.000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.119475  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0335  translation initiation factor IF-1  69.44 
 
 		 72 aa  106  9.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.170612  normal  0.0103305 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0297  translation initiation factor IF-1  69.44 
 
 		 72 aa  106  9.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00110331  normal  0.109612 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2738  translation initiation factor IF-1  69.44 
 
 		 72 aa  106  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3725  translation initiation factor IF-1  69.44 
 
 		 72 aa  106  9.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0238444  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3928  translation initiation factor IF-1  69.44 
 
 		 72 aa  106  9.000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0288  translation initiation factor IF-1  69.44 
 
 		 72 aa  106  9.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.460296  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2379  translation initiation factor IF-1  65.28 
 
 		 72 aa  106  9.000000000000001e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0001894  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0369  translation initiation factor IF-1  69.44 
 
 		 72 aa  106  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0502306  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0348  translation initiation factor IF-1  69.44 
 
 		 72 aa  106  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.101425 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2818  translation initiation factor IF-1  69.44 
 
 		 72 aa  106  9.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.196542  normal  0.235424 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0133  translation initiation factor IF-1  65.28 
 
 		 72 aa  106  1e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000119555  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0127  translation initiation factor IF-1  65.28 
 
 		 72 aa  106  1e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000431634  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0133  translation initiation factor IF-1  65.28 
 
 		 72 aa  106  1e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000000219097  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0129  translation initiation factor IF-1  65.28 
 
 		 72 aa  106  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  3.6060100000000006e-24  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0127  translation initiation factor IF-1  65.28 
 
 		 72 aa  106  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000000150239  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2622  translation initiation factor IF-1  67.14 
 
 		 73 aa  106  1e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.378683  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0959  translation initiation factor IF-1  68.57 
 
 		 73 aa  106  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0133  translation initiation factor IF-1  65.28 
 
 		 72 aa  106  1e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000000769266  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1160  translation initiation factor IF-1  66.67 
 
 		 72 aa  106  1e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000283848  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0074  translation initiation factor IF-1  70.83 
 
 		 72 aa  106  1e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.433818  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0164  translation initiation factor IF-1  65.28 
 
 		 72 aa  106  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000048346  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0154  translation initiation factor IF-1  65.28 
 
 		 72 aa  106  1e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000709815  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0128  translation initiation factor IF-1  65.28 
 
 		 72 aa  106  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000687625  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1113  translation initiation factor IF-1  67.14 
 
 		 73 aa  106  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.508115  normal  0.406339 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0146  translation initiation factor IF-1  65.28 
 
 		 72 aa  106  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.72927e-62 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5172  translation initiation factor IF-1  65.28 
 
 		 72 aa  106  1e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000000623661  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1461  translation initiation factor IF-1  66.67 
 
 		 72 aa  106  1e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000000527108  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0890  translation initiation factor IF-1  63.89 
 
 		 72 aa  105  2e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000152368  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2998  translation initiation factor IF-1  69.44 
 
 		 72 aa  105  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.155386 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2611  translation initiation factor IF-1  68.06 
 
 		 72 aa  105  2e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.430163  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0711  translation initiation factor IF-1  68.57 
 
 		 73 aa  105  2e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.21583 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0268  translation initiation factor IF-1  77.05 
 
 		 78 aa  105  2e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1163  translation initiation factor IF-1  70 
 
 		 73 aa  105  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000296746  normal  0.0905518 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0426  translation initiation factor IF-1  66.67 
 
 		 72 aa  105  2e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.249384  normal  0.130241 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0782  translation initiation factor IF-1  65.28 
 
 		 72 aa  105  2e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000000198783  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1945  translation initiation factor IF-1  68.06 
 
 		 72 aa  105  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1829  translation initiation factor IF-1  65.28 
 
 		 72 aa  105  2e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3769  translation initiation factor IF-1  70.83 
 
 		 72 aa  105  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00277571  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4222  translation initiation factor IF-1  68.06 
 
 		 72 aa  105  2e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.271914  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0496  translation initiation factor IF-1  68.06 
 
 		 72 aa  105  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4004  translation initiation factor IF-1  70 
 
 		 73 aa  105  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000265509  hitchhiker  0.000014317 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3148  translation initiation factor IF-1  68.06 
 
 		 72 aa  105  2e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0655502  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0329  translation initiation factor 1  67.14 
 
 		 73 aa  105  2e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.208578  decreased coverage  0.000347298 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3880  translation initiation factor IF-1  67.14 
 
 		 73 aa  105  2e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3499  translation initiation factor IF-1  68.06 
 
 		 72 aa  105  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2436  translation initiation factor 1  63.89 
 
 		 72 aa  105  3e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0238  translation initiation factor IF-1  62.5 
 
 		 72 aa  105  3e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.197943  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3296  translation initiation factor IF-1  69.44 
 
 		 72 aa  105  3e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2274  translation initiation factor IF-1  69.44 
 
 		 72 aa  105  3e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00199811  hitchhiker  0.00298742 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>