167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0713 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_0713  zinc/iron permease  100 
 
 		 258 aa  502  1e-141  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000233647  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0415  zinc/iron permease  64.34 
 
 		 264 aa  334  7e-91  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0715  zinc/iron permease  64.34 
 
 		 262 aa  332  4e-90  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00169409 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1616  zinc/iron permease  54.92 
 
 		 272 aa  269  4e-71  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2912  zinc/iron permease  53.23 
 
 		 264 aa  261  1e-68  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1427  zinc/iron permease  56.63 
 
 		 272 aa  254  8e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1916  zinc/iron permease  55.28 
 
 		 270 aa  253  3e-66  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3571  zinc/iron permease  54.88 
 
 		 270 aa  248  8e-65  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.640289  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0382  gufA protein, putative  51.97 
 
 		 271 aa  245  4.9999999999999997e-64  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0830  zinc/iron permease  52.02 
 
 		 271 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1761  zinc/iron permease  50.79 
 
 		 269 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.209568  normal  0.0390334 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0414  zinc/iron permease  50.2 
 
 		 269 aa  241  6e-63  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0510  zinc/iron permease  53.04 
 
 		 271 aa  241  9e-63  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1152  zinc/iron permease  51.61 
 
 		 271 aa  239  2.9999999999999997e-62  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.661251  normal  0.519901 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1497  zinc/iron permease  49.41 
 
 		 269 aa  236  4e-61  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.265438  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0208  zinc/iron permease  50.79 
 
 		 269 aa  235  6e-61  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.478364  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0056  zinc/iron permease  52.21 
 
 		 271 aa  234  9e-61  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1977  hypothetical protein  51 
 
 		 270 aa  232  5e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0214  zinc/iron permease  50.6 
 
 		 268 aa  229  4e-59  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000199646  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2925  GufA protein  54.07 
 
 		 273 aa  227  1e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0386986  hitchhiker  0.00221874 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2882  zinc/iron permease  54.92 
 
 		 267 aa  216  2.9999999999999998e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0655  zinc/iron permease  49.02 
 
 		 270 aa  205  5e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0529529  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1728  ZIP zinc transporter family protein  46.03 
 
 		 277 aa  201  9e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0265073  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0224  metal cation transporter, zinc (Zn2+)-iron (Fe2+) permease (ZIP) family protein  42.49 
 
 		 273 aa  179  2.9999999999999997e-44  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0186331  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2148  zinc/iron permease  40 
 
 		 276 aa  173  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0387  zinc/iron permease  39.42 
 
 		 300 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.314049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3615  zinc/iron permease  39.52 
 
 		 260 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.314729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3953  zinc/iron permease  39.52 
 
 		 260 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.210601  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2969  zinc/iron permease  40 
 
 		 306 aa  160  1e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1670  zinc/iron permease  37.4 
 
 		 255 aa  158  7e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.31853  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2787  Zinc transporter ZIP  39.57 
 
 		 309 aa  157  1e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3117  zinc/iron permease  39.18 
 
 		 251 aa  157  1e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2663  zinc/iron permease  37.45 
 
 		 300 aa  155  4e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0744572  normal  0.129144 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4268  zinc/iron permease  39.61 
 
 		 297 aa  155  9e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3261  zinc/iron permease  37.85 
 
 		 304 aa  154  2e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.28457  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1033  zinc/iron permease  40.89 
 
 		 245 aa  154  2e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0954  zinc/iron permease  38.82 
 
 		 297 aa  153  2e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.55549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1087  zinc/iron permease  40.89 
 
 		 245 aa  154  2e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1414  zinc/iron permease  40.47 
 
 		 312 aa  150  1e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1836  hypothetical protein  40.08 
 
 		 250 aa  149  4e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.438488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3874  zinc/iron permease  40.08 
 
 		 312 aa  149  5e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0665498  normal  0.190441 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1163  zinc/iron permease  43.22 
 
 		 300 aa  148  9e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.436725  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1862  Zinc transporter ZIP  38.28 
 
 		 308 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.697173 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5081  hypothetical protein  37.74 
 
 		 300 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.53383  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1445  zinc/iron permease  39.69 
 
 		 312 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.67  normal  0.0542344 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2053  hypothetical protein  39.3 
 
 		 305 aa  146  3e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0183571  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00170  zinc/iron permease  38.65 
 
 		 261 aa  145  4.0000000000000006e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000172235  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2194  zinc/iron permease  37.32 
 
 		 285 aa  145  5e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0986  zinc/iron permease  37.07 
 
 		 297 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0947  zinc/iron permease  37.07 
 
 		 302 aa  145  9e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0408  zinc/iron permease  37.65 
 
 		 278 aa  144  1e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.194102 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1051  zinc/iron permease  35.37 
 
 		 246 aa  144  2e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1295  zinc/iron permease  36.33 
 
 		 258 aa  142  4e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.80159  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0781  zinc/iron permease  36.67 
 
 		 261 aa  141  9.999999999999999e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.910074  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1721  zinc/iron permease  34.6 
 
 		 309 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2509  zinc/iron permease  37.97 
 
 		 259 aa  139  6e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2324  hypothetical protein  37.2 
 
 		 305 aa  137  1e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57990  hypothetical protein  37.5 
 
 		 310 aa  138  1e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2417  ZIP zinc transporter family protein  36.03 
 
 		 279 aa  136  4e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29340  Zinc/divalent heavy metal cation permease  38.14 
 
 		 317 aa  133  3e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0852  Zinc transporter ZIP  37.89 
 
 		 297 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0854  zinc/iron permease  33.73 
 
 		 243 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1749  zinc/iron permease  33.33 
 
 		 244 aa  129  5.0000000000000004e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0597  zinc/iron permease  36.18 
 
 		 246 aa  127  1.0000000000000001e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000532722  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1779  zinc/iron permease  33.61 
 
 		 258 aa  120  3e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0870  zinc/iron permease  31.82 
 
 		 290 aa  118  7e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1781  zinc/iron permease  37.39 
 
 		 284 aa  115  5e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.080702 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0130  zinc/iron permease  34.36 
 
 		 265 aa  113  3e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0305  zinc/iron permease  38.46 
 
 		 244 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0694906  normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5198  zinc/iron permease  30.93 
 
 		 286 aa  108  1e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1001  zinc/iron permease  35.24 
 
 		 267 aa  107  2e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1038  zinc/iron permease  35.1 
 
 		 254 aa  106  3e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.350201  normal  0.90903 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0009  zinc/iron permease  36.5 
 
 		 248 aa  104  2e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.288224  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2670  zinc transporter ZupT  31.56 
 
 		 258 aa  102  5e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000324662  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3077  zinc/iron permease  32.34 
 
 		 265 aa  102  7e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1236  zinc/iron permease  34.78 
 
 		 267 aa  98.2  1e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.216123  normal  0.828913 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0036  zinc/iron permease  32.13 
 
 		 247 aa  95.9  5e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0568  zinc transporter ZupT  32.27 
 
 		 252 aa  94.7  1e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.181834  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0256  zinc/iron permease  30.93 
 
 		 247 aa  91.7  1e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.015628  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1074  zinc/iron permease  31.87 
 
 		 255 aa  90.5  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0448  zinc/iron permease  30.28 
 
 		 265 aa  90.5  3e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000257065  hitchhiker  0.0000000301064 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0157  zinc transporter ZupT  29.96 
 
 		 268 aa  89  7e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4292  zinc/iron permease  29 
 
 		 310 aa  88.6  8e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07430  zinc/iron permease  29.77 
 
 		 272 aa  88.6  9e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4285  zinc transporter ZupT  30.32 
 
 		 255 aa  87.8  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0563  zinc/iron permease  29.11 
 
 		 239 aa  85.9  6e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2971  zinc transporter ZupT  28.46 
 
 		 277 aa  85.5  8e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1174  zinc/iron permease  30.88 
 
 		 281 aa  85.5  8e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.371558  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3472  zinc transporter ZupT  31.08 
 
 		 253 aa  85.1  0.000000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000026596  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_22166  predicted protein  29.46 
 
 		 280 aa  82.4  0.000000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00107582  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0908  zinc transporter ZupT  29.08 
 
 		 266 aa  82  0.000000000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.855869  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1483  zinc/iron permease  31.42 
 
 		 270 aa  82  0.000000000000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.287328  normal  0.134401 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3441  zinc transporter ZupT  30.12 
 
 		 257 aa  81.6  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.321701  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2676  zinc transporter ZupT  30.74 
 
 		 269 aa  81.6  0.00000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.264874 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3448  zinc transporter ZupT  31.39 
 
 		 257 aa  80.5  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3543  zinc transporter ZupT  31.39 
 
 		 257 aa  80.5  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.519213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3371  zinc transporter ZupT  31.39 
 
 		 257 aa  80.5  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3376  zinc transporter ZupT  31.39 
 
 		 257 aa  80.5  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.59755 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0313  zinc transporter ZupT  30.4 
 
 		 291 aa  80.5  0.00000000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0920658  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0717  zinc transporter ZupT  29.55 
 
 		 279 aa  79  0.00000000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0000000126072  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>