More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0447 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0447  Phosphoglucomutase  100 
 
 
460 aa  946    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000142951  normal  0.775368 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0411  Phosphomannomutase  67.98 
 
 
460 aa  629  1e-179  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.606567 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0442  Phosphoglucomutase  67.83 
 
 
460 aa  625  1e-178  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1740  phosphoglucomutase  67.61 
 
 
460 aa  622  1e-177  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0251978 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0341  Phosphoglucomutase  67.17 
 
 
460 aa  624  1e-177  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0410  phosphomannomutase  68.04 
 
 
460 aa  623  1e-177  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.158132  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0474  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  64.35 
 
 
460 aa  610  1e-173  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0372  Phosphoglucosamine mutase  44.91 
 
 
474 aa  409  1e-113  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3321  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  44.71 
 
 
469 aa  397  1e-109  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0135  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  45.16 
 
 
469 aa  396  1e-109  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000226581  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3418  phosphoglucomutase  45.09 
 
 
478 aa  396  1e-109  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4381  phosphoglucomutase  44.61 
 
 
469 aa  388  1e-106  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000631194  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3319  Phosphoglucomutase  44.73 
 
 
468 aa  386  1e-106  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3964  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  44.33 
 
 
469 aa  358  8e-98  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000701668  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4050  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  43.59 
 
 
469 aa  351  2e-95  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2567  phosphoglucosamine mutase  38.85 
 
 
488 aa  342  1e-92  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.6066  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1752  Phosphoglucomutase  42.3 
 
 
463 aa  335  1e-90  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1936  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  39.66 
 
 
463 aa  332  6e-90  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0571  phosphoglucosamine mutase  40.77 
 
 
472 aa  317  3e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.217924 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1132  Phosphoglucomutase  35.82 
 
 
470 aa  312  1e-83  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.301327  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4823  phosphoglucomutase  38.78 
 
 
471 aa  312  1e-83  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0794  Phosphomannomutase  40.26 
 
 
474 aa  310  2.9999999999999997e-83  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0510  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  35.56 
 
 
475 aa  308  2.0000000000000002e-82  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0221  phosphoglucomutase  36.56 
 
 
471 aa  306  4.0000000000000004e-82  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1899  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  41.51 
 
 
473 aa  302  9e-81  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00145231 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1486  Phosphoglucomutase  36.5 
 
 
457 aa  301  1e-80  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.000000000000122855  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0991  Phosphomannomutase  36.29 
 
 
458 aa  301  1e-80  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.160254  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2013  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  36.74 
 
 
472 aa  300  3e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0108375  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4110  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  35.9 
 
 
470 aa  300  4e-80  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00036282 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1605  Phosphoglucomutase  36.07 
 
 
472 aa  296  6e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000165819  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2089  phosphomannomutase  35.76 
 
 
467 aa  295  1e-78  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.631588  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0990  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  36.56 
 
 
472 aa  295  2e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000661724  normal  0.0347081 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2040  Phosphomannomutase  36.32 
 
 
467 aa  293  4e-78  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0022355  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2017  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  36.17 
 
 
472 aa  293  5e-78  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000060131  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1768  Phosphomannomutase  35.36 
 
 
480 aa  292  7e-78  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1796  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  35.36 
 
 
480 aa  292  7e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.238511  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0352  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  37.58 
 
 
475 aa  292  7e-78  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.345655 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1737  phosphoglucomutase/phosphomannomutase  34.95 
 
 
475 aa  291  2e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.148942  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0970  phosphoglucomutase  34.24 
 
 
479 aa  290  4e-77  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0168511  normal  0.552873 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2367  phosphoglucomutase/phosphomannomutase  37.37 
 
 
478 aa  290  5.0000000000000004e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000518249  normal  0.780869 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1767  phosphoglucosamine mutase  34.79 
 
 
475 aa  289  6e-77  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1831  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  35.9 
 
 
472 aa  287  2.9999999999999996e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000124706  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1311  phosphomannomutase ManB  34.75 
 
 
473 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.81653e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1751  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  35.84 
 
 
467 aa  285  2.0000000000000002e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0038  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  35.96 
 
 
480 aa  282  9e-75  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3100  phosphoglucomutase  34.19 
 
 
486 aa  282  1e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2649  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  35.39 
 
 
474 aa  281  2e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000128846 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0114  phosphomannomutase  37.07 
 
 
467 aa  281  2e-74  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.154128  hitchhiker  0.0000359682 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1567  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  34.69 
 
 
474 aa  280  3e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000749576  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03111  phosphotransferase superclass  34.45 
 
 
486 aa  278  2e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.309336  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2223  Phosphoglucomutase  34.66 
 
 
490 aa  277  3e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0282699 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3749  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  36.03 
 
 
464 aa  272  1e-71  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1268  phosphoglucomutase  35.94 
 
 
484 aa  270  4e-71  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.43258  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1967  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  33.77 
 
 
466 aa  270  4e-71  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0077  Phosphomannomutase  33.84 
 
 
460 aa  267  2.9999999999999995e-70  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.133339  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4933  Phosphoglucomutase  36.67 
 
 
477 aa  266  7e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0612098 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03021  phosphotransferase superclass  33.55 
 
 
484 aa  258  1e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1140  Phosphomannomutase  33.26 
 
 
482 aa  258  2e-67  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.188407  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0228  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  32.7 
 
 
487 aa  256  5e-67  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0280  phosphomannomutase  33.47 
 
 
484 aa  256  6e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0138376  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03011  phosphotransferase superclass  32.7 
 
 
484 aa  254  2.0000000000000002e-66  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0959823  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03432  phosphoglucomutase/phosphomannomutase  32.75 
 
 
470 aa  251  1e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0486  phosphomannomutase  32.43 
 
 
414 aa  250  4e-65  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.504312  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002577  GlcNAc phosphomutase  32.97 
 
 
470 aa  247  3e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0257  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  31.63 
 
 
487 aa  246  6.999999999999999e-64  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03051  phosphotransferase superclass  33.26 
 
 
485 aa  246  6.999999999999999e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_451  phosphomannomutase  32.42 
 
 
409 aa  244  1.9999999999999999e-63  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0496363  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1054  Glucosamine-1-phosphate N-acetyltransferase., Phosphoglucomutase  31.83 
 
 
733 aa  244  1.9999999999999999e-63  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.691488  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0140  putative phosphoglucomutase/phosphomannomutase  32.84 
 
 
470 aa  244  3e-63  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1955  Phosphoglucosamine mutase  33.33 
 
 
503 aa  243  5e-63  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.404155  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03581  phosphotransferase superclass  33.19 
 
 
486 aa  243  6e-63  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.37944  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3855  phosphomannomutase  32.38 
 
 
474 aa  243  7e-63  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28260  phosphomannomutase  32.55 
 
 
473 aa  241  2e-62  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3078  Phosphoglucosamine mutase  33.69 
 
 
470 aa  241  2e-62  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1644  phosphomannomutase  32.84 
 
 
486 aa  240  2.9999999999999997e-62  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2655  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  33.62 
 
 
484 aa  236  5.0000000000000005e-61  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2585  phosphoglucomutase/phosphomannomutase  30.04 
 
 
470 aa  235  1.0000000000000001e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24991  phosphotransferase superclass  32.07 
 
 
487 aa  220  3.9999999999999997e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3839  Phosphoglucosamine mutase  32.13 
 
 
468 aa  219  6e-56  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0369  phosphomannomutase  28.81 
 
 
501 aa  210  5e-53  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.391348  hitchhiker  0.00000119855 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1292  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  28.63 
 
 
471 aa  197  3e-49  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1893  phosphoglucomutase  31.96 
 
 
465 aa  195  2e-48  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.576391  normal  0.489627 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0496  Phosphoglucosamine mutase  29.87 
 
 
480 aa  182  9.000000000000001e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1538  Phosphoglucosamine mutase  31.77 
 
 
450 aa  174  3.9999999999999995e-42  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0505376  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0721  phosphomannomutase / alpha-phosphoglucomutase  28.04 
 
 
452 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0831033  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1269  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  27.19 
 
 
518 aa  156  8e-37  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000278301  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2115  phosphoglucosamine mutase  27.21 
 
 
448 aa  155  1e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2225  phosphomannomutase / alpha-phosphoglucomutase  27.06 
 
 
458 aa  151  2e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.161781  normal  0.0953517 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0486  phosphomannomutase  27.61 
 
 
483 aa  150  5e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.499643  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1298  phosphoglucomutase, alpha-D-glucose phosphate-specific  27.24 
 
 
547 aa  147  3e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000236068  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1882  phosphoglucomutase  28.52 
 
 
550 aa  147  3e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00767786  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07370  phosphoglucomutase  27.26 
 
 
546 aa  146  7.0000000000000006e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2017  phosphoglucomutase  27.27 
 
 
547 aa  145  1e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0565501  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3191  phosphoglucomutase, alpha-D-glucose phosphate- specific  27.87 
 
 
561 aa  145  2e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.434573  normal  0.0301219 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1780  phosphoglucomutase  29.04 
 
 
547 aa  145  2e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.331375  normal  0.165496 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3442  phosphoglucomutase, alpha-D-glucose phosphate- specific  28.06 
 
 
547 aa  145  2e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.797951  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4496  phosphoglucomutase  26.83 
 
 
553 aa  145  2e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2198  phosphoglucomutase  26.81 
 
 
549 aa  144  3e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.225859  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0258  phosphoglucomutase  28.46 
 
 
551 aa  144  4e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0336385  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0573  phosphomannomutase  27.97 
 
 
474 aa  144  4e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.660588  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>