22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_2118 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_2118  hypothetical protein  100 
 
 		 204 aa  420  1e-117  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  unclonable  0.00000000530474  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11983  hypothetical protein  31.16 
 
 		 207 aa  89.7  3e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0127  hypothetical protein  30.19 
 
 		 186 aa  81.6  0.000000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0844829  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4184  hypothetical protein  30.33 
 
 		 202 aa  79.7  0.00000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.180373 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11903  hypothetical protein  27.36 
 
 		 188 aa  79.3  0.00000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.537015  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1083  hypothetical protein  31.18 
 
 		 200 aa  68.6  0.00000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2314  hypothetical protein  27.32 
 
 		 214 aa  67.4  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.329476  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5218  hypothetical protein  27.14 
 
 		 192 aa  63.9  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1082  hypothetical protein  25.45 
 
 		 205 aa  62  0.000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0125  hypothetical protein  26.05 
 
 		 194 aa  60.1  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.177537  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0752  hypothetical protein  27.67 
 
 		 214 aa  60.1  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.718859  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3557  hypothetical protein  25.16 
 
 		 206 aa  59.7  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.0021439  normal  0.145009 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11978  hypothetical protein  32.76 
 
 		 189 aa  59.3  0.00000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2253  hypothetical protein  26.52 
 
 		 224 aa  51.6  0.000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.289772  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0613  hypothetical protein  22.71 
 
 		 263 aa  51.6  0.000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2122  hypothetical protein  27.2 
 
 		 194 aa  46.6  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000000123592  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5362  hypothetical protein  21.36 
 
 		 213 aa  46.6  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.141407  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4185  hypothetical protein  21.05 
 
 		 214 aa  45.8  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.279246 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5569  hypothetical protein  25.91 
 
 		 201 aa  45.4  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.021029  normal  0.152515 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6432  hypothetical protein  26.97 
 
 		 199 aa  45.1  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.693573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1519  hypothetical protein  26.34 
 
 		 211 aa  44.7  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0301691  normal  0.400253 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0739  hypothetical protein  28.24 
 
 		 227 aa  43.1  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>