39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0315 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0315  ribosomal protein L25/L23  100 
 
 		 86 aa  168  2e-41  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.997937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0815  50S ribosomal protein L23P  60.49 
 
 		 81 aa  93.6  7e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1798  50S ribosomal protein L23P  59.26 
 
 		 81 aa  90.9  5e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.217622  normal  0.590833 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1585  50S ribosomal protein L23P  58.02 
 
 		 81 aa  89  2e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2048  50S ribosomal protein L23P  54.32 
 
 		 82 aa  83.6  8e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.700766 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0093  50S ribosomal protein L23P  50.62 
 
 		 81 aa  70.5  0.000000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000000249681  unclonable  0.000000335999 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0228  ribosomal protein L25/L23  50.62 
 
 		 90 aa  69.7  0.00000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1726  ribosomal protein L25/L23  46.58 
 
 		 82 aa  62.8  0.000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0978109  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC00350  ribosomal protein, putative  43.24 
 
 		 154 aa  61.6  0.000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2220  ribosomal protein L23  38.27 
 
 		 84 aa  60.8  0.000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0805  50S ribosomal protein L23P  36.47 
 
 		 86 aa  59.7  0.00000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.720418  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0566  50S ribosomal protein L23P  39.51 
 
 		 82 aa  60.1  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0431079  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0534  50S ribosomal protein L23P  44 
 
 		 83 aa  59.7  0.00000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.646212  normal  0.481774 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0212  ribosomal protein L23  38.37 
 
 		 84 aa  58.9  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0859  50S ribosomal protein L23P  36.47 
 
 		 86 aa  57.8  0.00000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.455359  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0793  50S ribosomal protein L23P  36.47 
 
 		 86 aa  56.2  0.0000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.110307  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1830  50S ribosomal protein L23P  40 
 
 		 85 aa  56.2  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.649517 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0031  50S ribosomal protein L23P  35.29 
 
 		 86 aa  55.1  0.0000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_16602  Ribosomal protein L23a, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  33.33 
 
 		 121 aa  54.7  0.0000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1125  50S ribosomal protein L23P  35.29 
 
 		 86 aa  54.3  0.0000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0083  50S ribosomal protein L23P  35.53 
 
 		 82 aa  53.9  0.0000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.657611  normal  0.218333 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1776  ribosomal protein L23  45.95 
 
 		 81 aa  53.1  0.000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0108  50S ribosomal protein L23P  44 
 
 		 82 aa  52.8  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2251  50S ribosomal protein L23P  40.54 
 
 		 82 aa  53.1  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00000000299035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0444  50S ribosomal protein L23P  37.33 
 
 		 82 aa  51.2  0.000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0443463  normal  0.681719 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2447  50S ribosomal protein L23P  33.33 
 
 		 84 aa  50.8  0.000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2294  50S ribosomal protein L23P  34.88 
 
 		 87 aa  50.4  0.000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0289  50S ribosomal protein L23  47.89 
 
 		 97 aa  49.3  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0312226  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_61259  predicted protein  34.57 
 
 		 139 aa  48.1  0.00004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1519  ribosomal protein L23  37.5 
 
 		 87 aa  47.8  0.00005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000000000000262554  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08856  60S ribosomal protein L23 (AFU_orthologue; AFUA_5G05630)  37.31 
 
 		 153 aa  47.4  0.00007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0807  50S ribosomal protein L25/L23  35.8 
 
 		 88 aa  45.8  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.563432 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0424  50S ribosomal protein L23  43.75 
 
 		 95 aa  45.1  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000240996  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0003  50S ribosomal protein L23P  40 
 
 		 82 aa  44.7  0.0004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000337619  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05725  50S ribosomal protein L23  46.15 
 
 		 96 aa  43.5  0.0009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.261745  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0682  50S ribosomal protein L23  42.03 
 
 		 94 aa  42  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.633867  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2153  50S ribosomal protein L23P  35.42 
 
 		 95 aa  41.6  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0455845  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1228  50S ribosomal protein L23  35.79 
 
 		 98 aa  41.2  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.195733  unclonable  0.00000945894 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2125  50S ribosomal protein L23  42.25 
 
 		 98 aa  40  0.01  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.966187  normal  0.432558 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>