33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0604 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_0604  hypothetical protein  100 
 
 
468 aa  952    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0557  hypothetical protein  71.91 
 
 
470 aa  679    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0671  hypothetical protein  64 
 
 
444 aa  574  1.0000000000000001e-162  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1630  hypothetical protein  59.91 
 
 
450 aa  517  1.0000000000000001e-145  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.234159 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0037  hypothetical protein  27.1 
 
 
410 aa  87.8  4e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.434886  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1456  hypothetical protein  27.73 
 
 
434 aa  87  7e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1535  hypothetical protein  26.39 
 
 
432 aa  77  0.0000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2423  hypothetical protein  25.82 
 
 
426 aa  70.1  0.00000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1440  hypothetical protein  25.58 
 
 
426 aa  69.7  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0051  hypothetical protein  24.3 
 
 
423 aa  68.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0039  hypothetical protein  23.91 
 
 
424 aa  67.8  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0035  hypothetical protein  23.87 
 
 
425 aa  66.2  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1859  hypothetical protein  24.68 
 
 
393 aa  65.5  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1780  hypothetical protein  24.68 
 
 
393 aa  65.5  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2098  hypothetical protein  25.23 
 
 
393 aa  62.8  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.268023  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0519  hypothetical protein  22.75 
 
 
498 aa  58.5  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0828452  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3321  hypothetical protein  26.1 
 
 
347 aa  58.2  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3303  hypothetical protein  24.67 
 
 
448 aa  58.2  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.877956  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2049  hypothetical protein  29.27 
 
 
455 aa  57  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.717116 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3415  hypothetical protein  30.47 
 
 
549 aa  55.1  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3572  hypothetical protein  28.23 
 
 
452 aa  53.9  0.000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.544352  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2826  hypothetical protein  26.98 
 
 
441 aa  52  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1428  hypothetical protein  25.48 
 
 
441 aa  52.4  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134202  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3973  putative secreted protein  23.55 
 
 
475 aa  51.6  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.388131 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3388  hypothetical protein  26.96 
 
 
569 aa  50.1  0.00009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.174396 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0510  secreted porin family protein  23.7 
 
 
400 aa  47.8  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.938246  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3418  hypothetical protein  26.06 
 
 
351 aa  45.4  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3138  hypothetical protein  36.78 
 
 
346 aa  45.8  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.363093 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00710  hypothetical protein  31.36 
 
 
387 aa  44.7  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3299  hypothetical protein  24.09 
 
 
448 aa  44.3  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.832328  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1077  hypothetical protein  26.5 
 
 
551 aa  44.3  0.005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.350555 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2691  hypothetical protein  28.68 
 
 
585 aa  43.9  0.007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0485847  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4962  hypothetical protein  37.65 
 
 
352 aa  43.5  0.008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.936284  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>