141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0519 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_0519  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  100 
 
 
97 aa  196  7e-50  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000291454  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0490  hypothetical protein  46.46 
 
 
125 aa  92  2e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1064  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  38.38 
 
 
101 aa  67  0.00000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3984  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  30.43 
 
 
117 aa  56.6  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.49889  normal  0.888803 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1370  nucleoid protein H-NS  36.11 
 
 
115 aa  55.8  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.620152  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5596  nucleoid protein H-NS  31.68 
 
 
102 aa  53.5  0.0000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.16143  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0132  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  36.84 
 
 
99 aa  53.1  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1239  H-NS histone family protein  32.94 
 
 
96 aa  52.4  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.0000000000958752  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0116  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  37.5 
 
 
100 aa  52  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1551  H-NS histone family protein  32.94 
 
 
96 aa  52.4  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000358636  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1136  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  30.77 
 
 
104 aa  52.4  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00265311  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1739  H-NS histone family protein  32.94 
 
 
96 aa  52.4  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  unclonable  0.00000000000000443719  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3002  H-NS histone family protein  32.94 
 
 
96 aa  52.4  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  unclonable  0.00000000000000136233  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2886  H-NS histone family protein  32.94 
 
 
96 aa  52.4  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.000145694  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0401  H-NS histone family protein  32.94 
 
 
96 aa  52.4  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000000304691  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2207  H-NS histone family protein  31.76 
 
 
96 aa  51.6  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000144624  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3677  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  29.7 
 
 
102 aa  52  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.166379 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0398  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  32.61 
 
 
100 aa  51.6  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02604  putative HNS-like transcription regulator protein  28.43 
 
 
102 aa  51.6  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00414449  normal  0.0842767 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4934  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  35.11 
 
 
103 aa  51.6  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0365  H-NS histone family protein  32.94 
 
 
96 aa  51.2  0.000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00000040716  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4220  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  28.32 
 
 
135 aa  51.2  0.000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3279  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  35.23 
 
 
97 aa  51.2  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0515948 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4238  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  29.41 
 
 
102 aa  50.8  0.000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4348  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  29.41 
 
 
102 aa  50.8  0.000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.513312 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4321  putative HNS-like transcriptional regulator  32.61 
 
 
100 aa  50.4  0.000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3822  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  36.36 
 
 
100 aa  49.7  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000137841  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6755  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  37.11 
 
 
113 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.13631  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0112  HNS-like transcriptional regulator  36.36 
 
 
100 aa  50.1  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000994611  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3154  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  33.33 
 
 
100 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5060  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  33.33 
 
 
100 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5214  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  33.33 
 
 
100 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.319749 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7403  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  37.18 
 
 
96 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4385  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  31.31 
 
 
105 aa  50.1  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0118502  normal  0.891502 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7449  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  39.13 
 
 
99 aa  48.5  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3806  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  32.63 
 
 
100 aa  48.5  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0101066  hitchhiker  0.00273603 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6929  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  33.33 
 
 
99 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.599841  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5767  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  34.78 
 
 
99 aa  48.1  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6596  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  32.58 
 
 
96 aa  47.8  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.540075  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2905  H-NS histone family protein  31.91 
 
 
97 aa  47.4  0.00007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3155  H-NS histone family protein  31.91 
 
 
97 aa  47.4  0.00007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3404  H-NS histone family protein  31.91 
 
 
97 aa  47.4  0.00007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.237819  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1636  H-NS histone family protein  31.91 
 
 
97 aa  47.4  0.00007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.741416  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3827  H-NS histone family protein  31.91 
 
 
97 aa  47.4  0.00007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3909  H-NS histone family protein  31.91 
 
 
97 aa  47.4  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2965  H-NS histone family protein  31.91 
 
 
97 aa  47.4  0.00007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5922  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  30.1 
 
 
102 aa  47  0.00009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.997127  normal  0.678214 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6191  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  27.45 
 
 
102 aa  47  0.00009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.299615  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4465  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  31.76 
 
 
92 aa  47  0.00009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.695514  normal  0.126063 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6005  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  27.93 
 
 
103 aa  46.2  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0048  H-NS histone family protein  31.91 
 
 
125 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6525  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  38.04 
 
 
99 aa  46.2  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.381726 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4285  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  34.12 
 
 
97 aa  46.2  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3525  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  28 
 
 
123 aa  46.6  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.698098  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5671  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  38.04 
 
 
99 aa  46.2  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6035  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  38.04 
 
 
99 aa  46.2  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.401704 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3717  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  29.59 
 
 
136 aa  46.2  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.989758  hitchhiker  0.00118334 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0720  H-NS histone family protein  30.21 
 
 
96 aa  45.4  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.232457  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6347  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  34.07 
 
 
516 aa  45.4  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.0000113528  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2442  H-NS histone family protein  30.21 
 
 
131 aa  45.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2060  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  33.33 
 
 
91 aa  45.8  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0796579  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5335  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  29.17 
 
 
101 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5527  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  29.17 
 
 
101 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.645148  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0742  H-NS histone family protein  30.21 
 
 
104 aa  45.4  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1247  H-NS histone family protein  30.21 
 
 
96 aa  45.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4746  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  29.17 
 
 
101 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.587516  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1174  H-NS histone family protein  30.21 
 
 
104 aa  45.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.354816  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1706  H-NS histone family protein  30.21 
 
 
104 aa  45.4  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6382  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  31 
 
 
589 aa  45.1  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.493779  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3384  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  30.85 
 
 
97 aa  45.4  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2825  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  30.85 
 
 
97 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0195  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  30.85 
 
 
97 aa  45.1  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.750004  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0281  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  30.85 
 
 
97 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.166699  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0190  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  30.85 
 
 
97 aa  45.1  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.317548  hitchhiker  0.0000000190695 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0209  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  30.85 
 
 
97 aa  45.1  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.726678 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0263  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  30.85 
 
 
97 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.820493 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4798  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  31.37 
 
 
96 aa  45.1  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.272454  normal  0.166506 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3721  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  31.37 
 
 
96 aa  45.1  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00112888  normal  0.513312 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1986  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  24.24 
 
 
105 aa  44.7  0.0004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000114439  normal  0.0153833 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4578  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  26.09 
 
 
121 aa  45.1  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6777  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  31.76 
 
 
99 aa  45.1  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4162  hypothetical protein  31.91 
 
 
247 aa  44.7  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4730  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  27.83 
 
 
121 aa  44.7  0.0005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.167387  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5080  Ler  28.12 
 
 
123 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0343561 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2290  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  29.7 
 
 
112 aa  44.3  0.0006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1545  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  27.84 
 
 
105 aa  44.3  0.0006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.718681  normal  0.0365604 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1150  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  29.63 
 
 
99 aa  43.9  0.0006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1558  H-NS histone family protein  30.59 
 
 
131 aa  43.9  0.0007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.752713  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6772  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  29.63 
 
 
254 aa  43.9  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.000000111168  normal  0.0541472 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1529  DNA-binding protein BprA  29 
 
 
96 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0569  HNS-like transcription regulator protein  29 
 
 
100 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.147609  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0843  DNA-binding protein BprA  30 
 
 
96 aa  43.5  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.277711  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2075  DNA-binding protein BprA  29 
 
 
100 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0585602  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4282  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  27.45 
 
 
100 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0105949  normal  0.0174683 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2160  DNA-binding protein BprA  29 
 
 
96 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2072  H-NS histone family protein  29 
 
 
96 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0755  H-NS histone family protein  29 
 
 
100 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0220992  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2158  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  28.41 
 
 
96 aa  43.5  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.232102  normal  0.811955 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6044  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  32.65 
 
 
116 aa  43.5  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.304642 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3156  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  33.9 
 
 
105 aa  42.7  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.116532  normal  0.477373 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>