47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_07920 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_07920  hypothetical protein  100 
 
 		 286 aa  579  1e-164  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00573747  normal  0.450178 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17570  hypothetical protein  41.96 
 
 		 231 aa  187  2e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.526889  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1707  hypothetical protein  40.08 
 
 		 241 aa  179  2.9999999999999997e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1679  hypothetical protein  28.52 
 
 		 252 aa  145  9e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00685149  normal  0.0163026 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0551  hypothetical protein  32.98 
 
 		 226 aa  137  1e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0869  hypothetical protein  31.38 
 
 		 222 aa  124  1e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000122685  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0881  hypothetical protein  33.85 
 
 		 228 aa  122  7e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0940  hypothetical protein  28.8 
 
 		 224 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1473  hypothetical protein  32.28 
 
 		 226 aa  111  1.0000000000000001e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1402  hypothetical protein  35.79 
 
 		 223 aa  109  5e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0106  hypothetical protein  32.29 
 
 		 214 aa  106  5e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0440784  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06710  hypothetical protein  27.87 
 
 		 226 aa  105  7e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1610  hypothetical protein  32.98 
 
 		 231 aa  99  8e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1094  hypothetical protein  27.72 
 
 		 229 aa  98.6  1e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.248004  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1044  hypothetical protein  30.81 
 
 		 215 aa  97.1  3e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1387  putative ATP/GTP-binding protein  35.68 
 
 		 229 aa  95.1  1e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0109  hypothetical protein  28.95 
 
 		 232 aa  87.4  2e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.385594  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1068  hypothetical protein  28 
 
 		 218 aa  85.9  7e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.952967  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0589  putative ATP/GTP-binding protein  30.53 
 
 		 217 aa  72.4  0.000000000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0020  hypothetical protein  25.37 
 
 		 218 aa  67.8  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.921254 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2126  putative ATP/GTP-binding protein  27.23 
 
 		 216 aa  67.4  0.0000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.542682  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0046  hypothetical protein  28.95 
 
 		 230 aa  66.2  0.0000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.350099  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2076  hypothetical protein  30.46 
 
 		 237 aa  56.6  0.0000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0035  hypothetical protein  23.53 
 
 		 226 aa  50.4  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0200777  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0965  Signal recognition particle protein  33.33 
 
 		 449 aa  49.3  0.00007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.000000805339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0032  hypothetical protein  29.6 
 
 		 158 aa  48.1  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000810858 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0907  ATP-binding protein  37.08 
 
 		 293 aa  47  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.124437  normal  0.543626 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1122  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  52.08 
 
 		 471 aa  46.6  0.0005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.998483  normal  0.257216 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3200  iron-sulfur cluster-binding/ATPase domain-containing protein  44.44 
 
 		 311 aa  45.8  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.752938  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2410  chromosome partitioning ATPase  49.02 
 
 		 360 aa  44.7  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1291  signal recognition particle protein  30.43 
 
 		 449 aa  44.7  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0012852  normal  0.892865 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0897  capsular exopolysaccharide family  38.14 
 
 		 496 aa  44.7  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.240779  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1399  signal recognition particle protein  30.56 
 
 		 449 aa  43.9  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000293601  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2597  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  59.46 
 
 		 296 aa  43.1  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000736548  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1356  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  59.46 
 
 		 296 aa  43.1  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0188424  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2501  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  59.46 
 
 		 296 aa  43.1  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0308577  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1027  signal recognition particle protein  26.98 
 
 		 450 aa  43.1  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.588339  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1313  NifH/FrxC:cobyrinic acid a,c-diamide synthase  55 
 
 		 302 aa  43.1  0.005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2027  Mrp protein  46.94 
 
 		 285 aa  42.7  0.006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.251832 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1624  putative ATPase  40 
 
 		 361 aa  42.7  0.008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.55961  normal  0.291525 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1493  signal recognition particle protein  31.48 
 
 		 449 aa  42.4  0.008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.00000265163  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0395  Mrp/NBP35 family protein  47.27 
 
 		 354 aa  42.4  0.009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.616395  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1128  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  56.41 
 
 		 261 aa  42.4  0.009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.433779  normal  0.690565 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1306  hypothetical protein  51.22 
 
 		 401 aa  42.4  0.009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0319756  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3478  septum site-determining protein MinD  58.33 
 
 		 268 aa  42.4  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.144531  normal  0.63228 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2510  hypothetical protein  33.68 
 
 		 360 aa  42  0.01  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3390  signal recognition particle protein  45.24 
 
 		 440 aa  42.4  0.01  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.202247  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>