34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_17570 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_17570  hypothetical protein  100 
 
 
231 aa  468  1.0000000000000001e-131  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.526889  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1707  hypothetical protein  49.38 
 
 
241 aa  234  7e-61  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07920  hypothetical protein  41.96 
 
 
286 aa  187  1e-46  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00573747  normal  0.450178 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1679  hypothetical protein  33.05 
 
 
252 aa  149  3e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00685149  normal  0.0163026 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0940  hypothetical protein  36.16 
 
 
224 aa  149  5e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0869  hypothetical protein  32.29 
 
 
222 aa  140  1.9999999999999998e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000122685  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0551  hypothetical protein  33.04 
 
 
226 aa  139  3e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0881  hypothetical protein  34.9 
 
 
228 aa  124  2e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1044  hypothetical protein  36.41 
 
 
215 aa  122  4e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1610  hypothetical protein  36 
 
 
231 aa  119  3e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1068  hypothetical protein  34.47 
 
 
218 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.952967  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1094  hypothetical protein  29.74 
 
 
229 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.248004  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1402  hypothetical protein  34.4 
 
 
223 aa  110  1.0000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06710  hypothetical protein  31.08 
 
 
226 aa  107  1e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1473  hypothetical protein  32.32 
 
 
226 aa  102  6e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1387  putative ATP/GTP-binding protein  31.2 
 
 
229 aa  91.3  1e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0020  hypothetical protein  30.5 
 
 
218 aa  90.9  1e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.921254 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2126  putative ATP/GTP-binding protein  32.31 
 
 
216 aa  86.7  3e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.542682  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0106  hypothetical protein  29.41 
 
 
214 aa  85.9  5e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0440784  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0046  hypothetical protein  31.16 
 
 
230 aa  79.3  0.00000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.350099  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0109  hypothetical protein  29.29 
 
 
232 aa  78.2  0.0000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.385594  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0589  putative ATP/GTP-binding protein  26.89 
 
 
217 aa  67  0.0000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2076  hypothetical protein  28.8 
 
 
237 aa  63.2  0.000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0035  hypothetical protein  29.48 
 
 
226 aa  57.8  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0200777  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0959  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  44.16 
 
 
372 aa  50.1  0.00003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.152007 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1652  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  47.06 
 
 
305 aa  47  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.491623  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1313  NifH/FrxC:cobyrinic acid a,c-diamide synthase  45.65 
 
 
302 aa  45.4  0.0008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1337  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  50 
 
 
299 aa  44.3  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.299825  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0395  Mrp/NBP35 family protein  46 
 
 
354 aa  42.7  0.005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.616395  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40400  predicted protein  32.47 
 
 
349 aa  42  0.007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3344  ATPase-like, ParA/MinD  34.78 
 
 
358 aa  42.4  0.007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.312419  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2357  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  44 
 
 
298 aa  42  0.008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1360  ParA family protein, putative  30.77 
 
 
217 aa  42  0.009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0573305  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1306  hypothetical protein  34.69 
 
 
401 aa  41.6  0.01  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0319756  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>