25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0046 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_0046  hypothetical protein  100 
 
 
230 aa  461  1e-129  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.350099  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2126  putative ATP/GTP-binding protein  59.72 
 
 
216 aa  277  1e-73  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.542682  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2076  hypothetical protein  61.01 
 
 
237 aa  271  6e-72  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0020  hypothetical protein  52.29 
 
 
218 aa  242  3.9999999999999997e-63  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.921254 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0035  hypothetical protein  52.73 
 
 
226 aa  233  3e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0200777  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0032  hypothetical protein  55.7 
 
 
158 aa  186  2e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000810858 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0940  hypothetical protein  34.25 
 
 
224 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1044  hypothetical protein  36.73 
 
 
215 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1068  hypothetical protein  33.79 
 
 
218 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.952967  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0869  hypothetical protein  32.06 
 
 
222 aa  103  2e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000122685  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0551  hypothetical protein  33 
 
 
226 aa  103  3e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1679  hypothetical protein  30.35 
 
 
252 aa  99  5e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00685149  normal  0.0163026 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1387  putative ATP/GTP-binding protein  32.73 
 
 
229 aa  97.1  2e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0109  hypothetical protein  30 
 
 
232 aa  90.1  3e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.385594  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0106  hypothetical protein  34.87 
 
 
214 aa  87.8  1e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0440784  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0589  putative ATP/GTP-binding protein  31.31 
 
 
217 aa  85.1  8e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1610  hypothetical protein  29.15 
 
 
231 aa  84.7  0.000000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1094  hypothetical protein  30.77 
 
 
229 aa  80.5  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.248004  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1473  hypothetical protein  31.22 
 
 
226 aa  80.1  0.00000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17570  hypothetical protein  31.16 
 
 
231 aa  79.3  0.00000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.526889  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1707  hypothetical protein  27.75 
 
 
241 aa  77  0.0000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0881  hypothetical protein  27.84 
 
 
228 aa  75.5  0.0000000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1402  hypothetical protein  29.79 
 
 
223 aa  73.2  0.000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06710  hypothetical protein  30.81 
 
 
226 aa  68.2  0.00000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07920  hypothetical protein  28.95 
 
 
286 aa  66.2  0.0000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00573747  normal  0.450178 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>