24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1402 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_1402  hypothetical protein  100 
 
 
223 aa  447  1e-125  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06710  hypothetical protein  39.5 
 
 
226 aa  144  1e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1679  hypothetical protein  36.28 
 
 
252 aa  137  1e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00685149  normal  0.0163026 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0106  hypothetical protein  35.12 
 
 
214 aa  135  5e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0440784  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0869  hypothetical protein  34.9 
 
 
222 aa  132  3.9999999999999996e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000122685  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0940  hypothetical protein  31.51 
 
 
224 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0109  hypothetical protein  37.44 
 
 
232 aa  125  4.0000000000000003e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.385594  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1610  hypothetical protein  34.38 
 
 
231 aa  125  8.000000000000001e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0551  hypothetical protein  30 
 
 
226 aa  114  1.0000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1387  putative ATP/GTP-binding protein  37.5 
 
 
229 aa  112  6e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17570  hypothetical protein  34.4 
 
 
231 aa  110  1.0000000000000001e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.526889  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07920  hypothetical protein  35.79 
 
 
286 aa  109  3e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00573747  normal  0.450178 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1473  hypothetical protein  31.03 
 
 
226 aa  109  4.0000000000000004e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0881  hypothetical protein  30.95 
 
 
228 aa  105  6e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1044  hypothetical protein  32.82 
 
 
215 aa  104  1e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0589  putative ATP/GTP-binding protein  35.23 
 
 
217 aa  101  9e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1068  hypothetical protein  31.28 
 
 
218 aa  99.8  3e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.952967  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1094  hypothetical protein  31.89 
 
 
229 aa  90.1  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.248004  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0020  hypothetical protein  30.88 
 
 
218 aa  89.7  3e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.921254 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0035  hypothetical protein  30.5 
 
 
226 aa  85.1  7e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0200777  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1707  hypothetical protein  28.57 
 
 
241 aa  82.8  0.000000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2126  putative ATP/GTP-binding protein  33.87 
 
 
216 aa  82.8  0.000000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.542682  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0046  hypothetical protein  29.79 
 
 
230 aa  73.2  0.000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.350099  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2076  hypothetical protein  27.05 
 
 
237 aa  61.6  0.000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>