206 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_06760 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013170  Ccur_06760  glucosamine-6-phosphate isomerase  100 
 
 
249 aa  513  1e-144  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.000000583825  normal  0.599232 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2155  glucosamine-6-phosphate isomerase  68.33 
 
 
242 aa  340  2e-92  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.998917 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0167  glucosamine-6-phosphate isomerase  59.58 
 
 
244 aa  294  8e-79  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0765559  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3582  glucosamine-6-phosphate isomerase  58.19 
 
 
236 aa  279  4e-74  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000420118  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22920  glucosamine-6-phosphate isomerase  53.53 
 
 
241 aa  277  1e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1433  glucosamine-6-phosphate deaminase  53.69 
 
 
253 aa  276  3e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.111516  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0236  glucosamine-6-phosphate isomerase  52.46 
 
 
250 aa  274  8e-73  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2216  glucosamine-6-phosphate isomerase  54.73 
 
 
251 aa  270  2e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2744  glucosamine-6-phosphate deaminase  50.62 
 
 
242 aa  268  7e-71  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2431  glucosamine-6-phosphate deaminase  50.62 
 
 
242 aa  267  1e-70  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0405  glucosamine-6-phosphate isomerase  53.94 
 
 
253 aa  261  6e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2077  glucosamine-6-phosphate isomerase  51.06 
 
 
256 aa  251  6e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0815  glucosamine-6-phosphate isomerase  51 
 
 
268 aa  251  7e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.288891  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0749  glucosamine-6-phosphate isomerase  50.21 
 
 
242 aa  249  2e-65  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1219  glucosamine-6-phosphate isomerase  50.42 
 
 
256 aa  248  4e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0943  glucosamine-6-phosphate isomerase  49 
 
 
264 aa  245  4.9999999999999997e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0718256  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0760  glucosamine-6-phosphate isomerase  47.79 
 
 
263 aa  237  1e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0844  glucosamine-6-phosphate isomerase  47.79 
 
 
262 aa  236  3e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1521  glucosamine-6-phosphate isomerase  49.59 
 
 
279 aa  231  6e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1008  glucosamine-6-phosphate isomerase  47.13 
 
 
268 aa  228  8e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0823298  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1652  glucosamine-6-phosphate isomerase  46.94 
 
 
266 aa  221  7e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0766585  normal  0.955714 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0354  glucosamine-6-phosphate isomerase  47.7 
 
 
233 aa  216  2.9999999999999998e-55  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00072402  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0631  glucosamine-6-phosphate isomerase  46.44 
 
 
259 aa  211  7e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.676761  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2021  glucosamine-6-phosphate deaminase-like protein  45.22 
 
 
647 aa  209  2e-53  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2772  glucosamine-6-phosphate isomerase  42.45 
 
 
246 aa  209  4e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1348  glucosamine-6-phosphate isomerase  45.54 
 
 
261 aa  207  1e-52  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000459802 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1656  glucosamine-6-phosphate isomerase  43.57 
 
 
240 aa  206  2e-52  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4131  hypothetical protein  45.64 
 
 
260 aa  205  5e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.311207  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1731  glucosamine-6-phosphate isomerase  46.28 
 
 
245 aa  205  7e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.598204  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2590  glucosamine-6-phosphate deaminase  44.77 
 
 
260 aa  204  9e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.161657  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0644  glucosamine-6-phosphate isomerase  46.64 
 
 
236 aa  203  2e-51  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0215  glucosamine-6-phosphate isomerase  47.27 
 
 
243 aa  202  3e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4163  glucosamine-6-phosphate deaminase  41.77 
 
 
262 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000395689  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1075  glucosamine-6-phosphate deaminase  42.17 
 
 
262 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.115447  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1667  glucosamine-6-phosphate isomerase  43.8 
 
 
235 aa  200  1.9999999999999998e-50  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00815686  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0803  glucosamine-6-phosphate deaminase  43.67 
 
 
263 aa  199  3e-50  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1822  glucosamine-6-phosphate isomerase  46.98 
 
 
303 aa  199  3e-50  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000307533  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4812  glucosamine-6-phosphate deaminase-like protein  39.75 
 
 
642 aa  199  3e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.116561  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4557  glucosamine-6-phosphate deaminase-like protein  40.87 
 
 
670 aa  199  5e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.296514  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0337  glucosamine-6-phosphate deaminase  44.44 
 
 
270 aa  198  6e-50  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00000149372  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2322  glucosamine-6-phosphate deaminase  44.4 
 
 
259 aa  198  7e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000116436 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1961  glucosamine-6-phosphate deaminase  42.44 
 
 
260 aa  198  7.999999999999999e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.297856 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1026  glucosamine/galactosamine-6-phosphate isomerase  45.87 
 
 
234 aa  198  7.999999999999999e-50  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000150801  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1861  glucosamine-6-phosphate isomerase  46.86 
 
 
247 aa  197  9e-50  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000152113  hitchhiker  0.000000000130899 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4074  glucosamine-6-phosphate deaminase  41.37 
 
 
262 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00843542 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4121  glucosamine-6-phosphate deaminase  41.37 
 
 
262 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.850292  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3964  glucosamine-6-phosphate deaminase  41.37 
 
 
262 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.149974  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3795  glucosamine-6-phosphate deaminase  41.37 
 
 
262 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3810  glucosamine-6-phosphate deaminase  41.37 
 
 
262 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4273  glucosamine-6-phosphate deaminase  41.37 
 
 
262 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4185  glucosamine-6-phosphate deaminase  41.37 
 
 
262 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00138576  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2029  glucosamine-6-phosphate deaminase-like protein  42.61 
 
 
637 aa  197  1.0000000000000001e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.458898  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2753  glucosamine-6-phosphate deaminase  41.77 
 
 
262 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0799  glucosamine-6-phosphate isomerase  45.83 
 
 
233 aa  195  6e-49  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.201106  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1006  glucosamine-6-phosphate deaminase-like protein  48.9 
 
 
655 aa  195  7e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000156439 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4142  glucosamine-6-phosphate deaminase-like protein  43.28 
 
 
639 aa  194  1e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.513919 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00670  glucosamine-6-phosphate isomerase  41.91 
 
 
260 aa  194  1e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.898664  normal  0.115582 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3883  glucosamine-6-phosphate deaminase  40.96 
 
 
262 aa  193  2e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.116143  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13500  glucosamine-6-phosphate isomerase  41.53 
 
 
265 aa  192  4e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0485171  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5415  glucosamine-6-phosphate isomerase  45.87 
 
 
657 aa  192  5e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.700694  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0960  glucosamine-6-phosphate deaminase  43.75 
 
 
261 aa  192  5e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.160778  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1660  glucosamine-6-phosphate deaminase-like protein  41.63 
 
 
637 aa  191  7e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6570  glucosamine-6-phosphate deaminase-like protein  45.11 
 
 
641 aa  191  1e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.220945  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4483  glucosamine-6-phosphate isomerase  46.25 
 
 
261 aa  190  2e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.543122  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0237  glucosamine-6-phosphate isomerase  41.49 
 
 
260 aa  189  2.9999999999999997e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1208  glucosamine-6-phosphate isomerase  42.04 
 
 
277 aa  188  5.999999999999999e-47  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3813  glucosamine-6-phosphate deaminase-like protein  45.45 
 
 
646 aa  188  9e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.551853 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2791  glucosamine-6-phosphate isomerase  42.86 
 
 
642 aa  186  2e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0581  glucosamine-6-phosphate isomerase  46.22 
 
 
233 aa  186  2e-46  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000075692  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0592  glucosamine/galactosamine-6-phosphate isomerase  40.91 
 
 
252 aa  186  3e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0606  glucosamine/galactosamine-6-phosphate isomerase  40.91 
 
 
252 aa  186  3e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2381  glucosamine-6-phosphate deaminase-like protein  46.46 
 
 
642 aa  185  5e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.136647  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1508  glucosamine-6-phosphate isomerase  46.15 
 
 
252 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2313  Glucosamine-6-phosphate deaminase  40.57 
 
 
253 aa  183  2.0000000000000003e-45  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0207649  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0180  glucosamine/galactosamine-6-phosphate isomerase  44.29 
 
 
262 aa  183  2.0000000000000003e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3702  glucosamine-6-phosphate isomerase  38.43 
 
 
247 aa  182  4.0000000000000006e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.355712  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM01050  Glucosamine-6-phosphate isomerase, putative  44.93 
 
 
339 aa  182  5.0000000000000004e-45  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3512  glucosamine-6-phosphate isomerase  40.5 
 
 
268 aa  180  2e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2749  glucosamine-6-phosphate deaminase  43.5 
 
 
261 aa  180  2e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000962  glucosamine-6-phosphate deaminase  39.92 
 
 
266 aa  178  7e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000448819  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2135  glucosamine-6-phosphate isomerase  40.41 
 
 
276 aa  177  1e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000621697  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1549  glucosamine-6-phosphate isomerase  43.46 
 
 
271 aa  176  3e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000670802  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1049  glucosamine-6-phosphate isomerase  39.75 
 
 
260 aa  176  3e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0216  glucosamine-6-phosphate deaminase  39.57 
 
 
266 aa  173  1.9999999999999998e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0490  glucosamine-6-phosphate deaminase  41.67 
 
 
266 aa  173  2.9999999999999996e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.532501 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07002  glucosamine-6-phosphate deaminase  39.42 
 
 
266 aa  173  2.9999999999999996e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01418  glucosamine-6-phosphate deaminase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G00480)  41.98 
 
 
358 aa  172  5e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.313025  normal  0.0950866 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0150  glucosamine-6-phosphate deaminase  40.74 
 
 
268 aa  172  5e-42  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3405  glucosamine/galactosamine-6-phosphate isomerase  42.67 
 
 
255 aa  172  5e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0209  glucosamine-6-phosphate deaminase  41.84 
 
 
270 aa  170  2e-41  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.147948  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00160  6-phosphogluconolactonase/glucosamine-6- phosphate isomerase/deaminase  40.51 
 
 
258 aa  168  8e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0128  glucosamine-6-phosphate deaminase  34.43 
 
 
255 aa  168  8e-41  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0731  glucosamine-6-phosphate deaminase  40.25 
 
 
266 aa  168  9e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.611373  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0839  glucosamine-6-phosphate deaminase  40.25 
 
 
266 aa  168  9e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0743  glucosamine-6-phosphate deaminase  40.25 
 
 
266 aa  168  9e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.248454 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0790  glucosamine-6-phosphate deaminase  40.25 
 
 
266 aa  168  9e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0803  glucosamine-6-phosphate deaminase  40.25 
 
 
266 aa  168  9e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1193  glucosamine-6-phosphate deaminase  39.83 
 
 
266 aa  167  2e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.455857  decreased coverage  0.0000186217 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2812  glucosamine-6-phosphate deaminase  40 
 
 
266 aa  167  2e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0573  glucosamine-6-phosphate deaminase  39.42 
 
 
266 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>