165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_00160 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_00160  6-phosphogluconolactonase/glucosamine-6- phosphate isomerase/deaminase  100 
 
 
258 aa  526  1e-148  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2155  glucosamine-6-phosphate isomerase  40.66 
 
 
242 aa  170  2e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.998917 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06760  glucosamine-6-phosphate isomerase  40.51 
 
 
249 aa  167  1e-40  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.000000583825  normal  0.599232 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0167  glucosamine-6-phosphate isomerase  37.76 
 
 
244 aa  157  1e-37  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0765559  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3582  glucosamine-6-phosphate isomerase  36.64 
 
 
236 aa  155  8e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000420118  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0236  glucosamine-6-phosphate isomerase  34.55 
 
 
250 aa  154  1e-36  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2431  glucosamine-6-phosphate deaminase  35.44 
 
 
242 aa  146  2.0000000000000003e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2744  glucosamine-6-phosphate deaminase  35.02 
 
 
242 aa  145  5e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2077  glucosamine-6-phosphate isomerase  34.6 
 
 
256 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1433  glucosamine-6-phosphate deaminase  32.91 
 
 
253 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.111516  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2590  glucosamine-6-phosphate deaminase  34.44 
 
 
260 aa  139  3e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.161657  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1219  glucosamine-6-phosphate isomerase  34.02 
 
 
256 aa  138  1e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2216  glucosamine-6-phosphate isomerase  32.92 
 
 
251 aa  137  1e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2791  glucosamine-6-phosphate isomerase  36.8 
 
 
642 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0815  glucosamine-6-phosphate isomerase  32.1 
 
 
268 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.288891  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22920  glucosamine-6-phosphate isomerase  30.8 
 
 
241 aa  135  4e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2322  glucosamine-6-phosphate deaminase  35.44 
 
 
259 aa  134  9.999999999999999e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000116436 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4131  hypothetical protein  33.76 
 
 
260 aa  133  3e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.311207  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2772  glucosamine-6-phosphate isomerase  28.46 
 
 
246 aa  130  3e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1521  glucosamine-6-phosphate isomerase  29.83 
 
 
279 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0844  glucosamine-6-phosphate isomerase  30.45 
 
 
262 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0943  glucosamine-6-phosphate isomerase  30.04 
 
 
264 aa  129  6e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0718256  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2021  glucosamine-6-phosphate deaminase-like protein  32.14 
 
 
647 aa  127  2.0000000000000002e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1508  glucosamine-6-phosphate isomerase  34.86 
 
 
252 aa  125  7e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0760  glucosamine-6-phosphate isomerase  29.22 
 
 
263 aa  125  9e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3702  glucosamine-6-phosphate isomerase  29.41 
 
 
247 aa  123  2e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.355712  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4557  glucosamine-6-phosphate deaminase-like protein  29.2 
 
 
670 aa  124  2e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.296514  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0405  glucosamine-6-phosphate isomerase  31.93 
 
 
253 aa  124  2e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4812  glucosamine-6-phosphate deaminase-like protein  28.75 
 
 
642 aa  123  3e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.116561  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2029  glucosamine-6-phosphate deaminase-like protein  30.53 
 
 
637 aa  122  6e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.458898  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2381  glucosamine-6-phosphate deaminase-like protein  32.92 
 
 
642 aa  122  6e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.136647  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0354  glucosamine-6-phosphate isomerase  34.18 
 
 
233 aa  120  1.9999999999999998e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00072402  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4121  glucosamine-6-phosphate deaminase  31.84 
 
 
262 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.850292  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3964  glucosamine-6-phosphate deaminase  31.84 
 
 
262 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.149974  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3795  glucosamine-6-phosphate deaminase  31.84 
 
 
262 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3810  glucosamine-6-phosphate deaminase  31.84 
 
 
262 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4273  glucosamine-6-phosphate deaminase  31.84 
 
 
262 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4074  glucosamine-6-phosphate deaminase  31.84 
 
 
262 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00843542 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4185  glucosamine-6-phosphate deaminase  31.84 
 
 
262 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00138576  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3512  glucosamine-6-phosphate isomerase  32.2 
 
 
268 aa  118  7.999999999999999e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4163  glucosamine-6-phosphate deaminase  31.84 
 
 
262 aa  118  9e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000395689  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1961  glucosamine-6-phosphate deaminase  29.88 
 
 
260 aa  117  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.297856 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1822  glucosamine-6-phosphate isomerase  34.82 
 
 
303 aa  117  1.9999999999999998e-25  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000307533  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1026  glucosamine/galactosamine-6-phosphate isomerase  32.91 
 
 
234 aa  116  3e-25  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000150801  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3813  glucosamine-6-phosphate deaminase-like protein  31.78 
 
 
646 aa  117  3e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.551853 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0749  glucosamine-6-phosphate isomerase  29.11 
 
 
242 aa  116  3.9999999999999997e-25  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1861  glucosamine-6-phosphate isomerase  35.02 
 
 
247 aa  115  5e-25  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000152113  hitchhiker  0.000000000130899 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3883  glucosamine-6-phosphate deaminase  31.02 
 
 
262 aa  115  6e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.116143  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1660  glucosamine-6-phosphate deaminase-like protein  30.47 
 
 
637 aa  115  7.999999999999999e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1348  glucosamine-6-phosphate isomerase  30.77 
 
 
261 aa  115  7.999999999999999e-25  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000459802 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1008  glucosamine-6-phosphate isomerase  27.92 
 
 
268 aa  114  1.0000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0823298  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1075  glucosamine-6-phosphate deaminase  31.02 
 
 
262 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.115447  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1731  glucosamine-6-phosphate isomerase  32.19 
 
 
245 aa  113  3e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.598204  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5415  glucosamine-6-phosphate isomerase  31.78 
 
 
657 aa  113  3e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.700694  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6570  glucosamine-6-phosphate deaminase-like protein  31.14 
 
 
641 aa  113  3e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.220945  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13500  glucosamine-6-phosphate isomerase  31.36 
 
 
265 aa  112  4.0000000000000004e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0485171  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1652  glucosamine-6-phosphate isomerase  30 
 
 
266 aa  112  4.0000000000000004e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0766585  normal  0.955714 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2753  glucosamine-6-phosphate deaminase  30.2 
 
 
262 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0803  glucosamine-6-phosphate deaminase  28.35 
 
 
263 aa  112  6e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0180  glucosamine/galactosamine-6-phosphate isomerase  33.61 
 
 
262 aa  110  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0960  glucosamine-6-phosphate deaminase  30.25 
 
 
261 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.160778  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1006  glucosamine-6-phosphate deaminase-like protein  33.93 
 
 
655 aa  110  2.0000000000000002e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000156439 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2131  glucosamine/galactosamine-6-phosphate isomerase  30.67 
 
 
240 aa  110  3e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1049  glucosamine-6-phosphate isomerase  30.21 
 
 
260 aa  109  3e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0644  glucosamine-6-phosphate isomerase  30.28 
 
 
236 aa  109  5e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0337  glucosamine-6-phosphate deaminase  27.98 
 
 
270 aa  108  1e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00000149372  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0631  glucosamine-6-phosphate isomerase  29.11 
 
 
259 aa  107  3e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.676761  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00670  glucosamine-6-phosphate isomerase  30.38 
 
 
260 aa  106  3e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.898664  normal  0.115582 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4142  glucosamine-6-phosphate deaminase-like protein  29.31 
 
 
639 aa  106  4e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.513919 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01418  glucosamine-6-phosphate deaminase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G00480)  27.98 
 
 
358 aa  103  2e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.313025  normal  0.0950866 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0215  glucosamine-6-phosphate isomerase  28.07 
 
 
243 aa  102  4e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0209  glucosamine-6-phosphate deaminase  30.2 
 
 
270 aa  103  4e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.147948  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0581  glucosamine-6-phosphate isomerase  30.83 
 
 
233 aa  102  8e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000075692  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1549  glucosamine-6-phosphate isomerase  30.52 
 
 
271 aa  101  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000670802  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2160  putative 6-phosphogluconolactonase  28.99 
 
 
237 aa  100  2e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2749  glucosamine-6-phosphate deaminase  31.93 
 
 
261 aa  99  7e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01050  Glucosamine-6-phosphate isomerase, putative  27.05 
 
 
339 aa  98.6  9e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0237  glucosamine-6-phosphate isomerase  27 
 
 
260 aa  95.9  5e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0799  glucosamine-6-phosphate isomerase  29.96 
 
 
233 aa  95.1  1e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.201106  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5244  glucosamine-6-phosphate deaminase  29.54 
 
 
259 aa  92.4  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.965081 
 
 
-
 
NC_002950  PG1285  glucosamine-6-phosphate deaminase-like protein  26.95 
 
 
655 aa  92  9e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1667  glucosamine-6-phosphate isomerase  28.69 
 
 
235 aa  91.3  1e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00815686  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000962  glucosamine-6-phosphate deaminase  26.23 
 
 
266 aa  90.9  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000448819  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1208  glucosamine-6-phosphate isomerase  24.54 
 
 
277 aa  90.1  3e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2812  glucosamine-6-phosphate deaminase  24.69 
 
 
266 aa  89.7  4e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2135  glucosamine-6-phosphate isomerase  25.51 
 
 
276 aa  89.4  6e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000621697  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0216  glucosamine-6-phosphate deaminase  25.62 
 
 
266 aa  89  6e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00635  glucosamine-6-phosphate deaminase  25.51 
 
 
266 aa  87.8  2e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.69394  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00626  hypothetical protein  25.51 
 
 
266 aa  87.8  2e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.60182  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2959  glucosamine-6-phosphate isomerase  25.51 
 
 
266 aa  87.8  2e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.485164  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2313  Glucosamine-6-phosphate deaminase  25.1 
 
 
253 aa  87.4  2e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0207649  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1027  glucosamine-6-phosphate deaminase  24.59 
 
 
268 aa  87  2e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07002  glucosamine-6-phosphate deaminase  26.86 
 
 
266 aa  87  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0722  glucosamine-6-phosphate deaminase  25.51 
 
 
266 aa  87.8  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.372156  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0703  glucosamine-6-phosphate deaminase  25.51 
 
 
266 aa  87.8  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00284745  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2978  glucosamine-6-phosphate deaminase  25.51 
 
 
266 aa  87.8  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0698  glucosamine-6-phosphate deaminase  25.51 
 
 
266 aa  87.8  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0261175  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0573  glucosamine-6-phosphate deaminase  25.51 
 
 
266 aa  87.8  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0225  glucosamine/galactosamine-6-phosphate isomerase  25.85 
 
 
243 aa  87.8  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.535375  normal  0.600106 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0769  glucosamine-6-phosphate deaminase  25.51 
 
 
266 aa  87.8  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0136799  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>