73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4420 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_4420  hypothetical protein  100 
 
 
151 aa  300  5e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2220  hypothetical protein  35.1 
 
 
153 aa  97.8  5e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0134246 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2216  hypothetical protein  34.27 
 
 
148 aa  76.6  1e-13  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.00884783  normal  0.106638 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1099  hypothetical protein  36.17 
 
 
151 aa  68.9  2e-11  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3217  protein of unknown function DUF107  36.23 
 
 
151 aa  67.8  5e-11  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004151  putative activity regulator of membrane protease YbbK  31.91 
 
 
153 aa  64.3  6e-10  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1152  hypothetical protein  33.33 
 
 
153 aa  62  3e-09  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.243195  hitchhiker  3.02368e-07 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4304  hypothetical protein  34 
 
 
149 aa  62  3e-09  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0964  hypothetical protein  32.87 
 
 
150 aa  61.6  4e-09  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.634862  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0567  nodulation efficiency family protein  30 
 
 
152 aa  60.5  7e-09  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0527  nodulation efficiency family protein  30 
 
 
152 aa  60.5  7e-09  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3128  hypothetical protein  30 
 
 
152 aa  60.5  7e-09  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  7.72435e-05 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0537  nodulation efficiency family protein  30 
 
 
152 aa  60.5  7e-09  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3122  protein of unknown function DUF107  30 
 
 
152 aa  60.5  7e-09  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0423  nodulation efficiency family protein  30 
 
 
152 aa  60.5  7e-09  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4844  hypothetical protein  30.67 
 
 
147 aa  59.7  1e-08  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0592  nodulation efficiency family protein  30 
 
 
152 aa  60.1  1e-08  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.685146 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3025  protein of unknown function DUF107  32.43 
 
 
151 aa  58.9  2e-08  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1445  hypothetical protein  30.2 
 
 
148 aa  59.3  2e-08  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0155103  normal  0.203788 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00444  hypothetical protein  29.53 
 
 
151 aa  58.5  3e-08  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00439  conserved inner membrane protein  29.53 
 
 
151 aa  58.5  3e-08  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1033  protein of unknown function DUF107  31.21 
 
 
149 aa  57.4  7e-08  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0418  protein of unknown function DUF107  28.06 
 
 
150 aa  55.5  2e-07  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01316  hypothetical protein  28.57 
 
 
153 aa  55.5  3e-07  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0549  inner membrane protein YbbJ  30.07 
 
 
150 aa  55.1  4e-07  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3306  protein of unknown function DUF107  30.77 
 
 
153 aa  53.5  9e-07  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.471898  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1881  hypothetical protein  31.88 
 
 
150 aa  53.5  9e-07  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0471447  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1879  hypothetical protein  27.54 
 
 
142 aa  53.1  1e-06  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2173  hypothetical protein  27.54 
 
 
142 aa  53.1  1e-06  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0496  hypothetical protein  33.33 
 
 
149 aa  53.1  1e-06  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.41983  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2145  hypothetical protein  27.54 
 
 
142 aa  53.1  1e-06  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1360  hypothetical protein  32.65 
 
 
148 aa  52.8  2e-06  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0257829 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1923  hypothetical protein  26.09 
 
 
142 aa  52.4  2e-06  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.126265  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3244  hypothetical protein  26.09 
 
 
142 aa  51.2  4e-06  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00265616  normal  0.45038 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1559  hypothetical protein  28.26 
 
 
142 aa  51.6  4e-06  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.151405  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2105  hypothetical protein  26.81 
 
 
142 aa  51.2  5e-06  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1889  hypothetical protein  26.81 
 
 
142 aa  51.2  5e-06  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3025  nodulation efficiency protein D  28.67 
 
 
149 aa  50.4  7e-06  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2063  hypothetical protein  26.09 
 
 
142 aa  50.8  7e-06  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00757659  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3163  hypothetical protein  28.67 
 
 
149 aa  50.4  7e-06  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1267  hypothetical protein  28.67 
 
 
149 aa  50.4  7e-06  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.132196 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3111  hypothetical protein  30.07 
 
 
147 aa  50.4  8e-06  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3608  protein of unknown function DUF107  29.37 
 
 
151 aa  49.7  1e-05  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2074  hypothetical protein  26.09 
 
 
142 aa  49.7  2e-05  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1927  hypothetical protein  26.09 
 
 
142 aa  49.7  2e-05  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3005  protein of unknown function DUF107  25.9 
 
 
144 aa  48.9  3e-05  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0062  hypothetical protein  27.46 
 
 
140 aa  48.1  4e-05  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0560345  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0281  membrane protein  25.68 
 
 
150 aa  47.8  6e-05  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6549  protein of unknown function DUF107  28.97 
 
 
144 aa  47  8e-05  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0062  hypothetical protein  26.76 
 
 
140 aa  47.4  8e-05  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.351134  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3850  hypothetical protein  26.9 
 
 
156 aa  47  8e-05  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0149984  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0547  inner membrane protein YbbJ  30.77 
 
 
150 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0554  inner membrane protein YbbJ  30.77 
 
 
150 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0608  hypothetical protein  30.77 
 
 
150 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2705  hypothetical protein  33.33 
 
 
151 aa  47  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0564  inner membrane protein YbbJ  30.77 
 
 
150 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0945  protein of unknown function DUF107  29.58 
 
 
149 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.665646  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3721  hypothetical protein  28.37 
 
 
152 aa  45.8  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0493  protein of unknown function DUF107  26.21 
 
 
156 aa  45.4  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  3.58021e-07  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0469  hypothetical protein  26.21 
 
 
156 aa  45.4  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  2.06621e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0490  hypothetical protein  26.21 
 
 
156 aa  45.4  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  5.83526e-06  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4268  hypothetical protein  25.17 
 
 
153 aa  45.1  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14650  membrane protein implicated in regulation of membrane protease activity  29.75 
 
 
144 aa  44.7  0.0005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  3.89934e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2309  hypothetical protein  28.28 
 
 
149 aa  43.9  0.0008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06891  membrane protein implicated in regulation of membrane protease activity  32.67 
 
 
147 aa  43.5  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2736  hypothetical protein  28.03 
 
 
153 aa  43.1  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.355478  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1335  hypothetical protein  26.17 
 
 
154 aa  42.4  0.002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2413  protein of unknown function DUF107  32.98 
 
 
141 aa  42  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68830  hypothetical protein  31.43 
 
 
150 aa  41.2  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1454  hypothetical protein  28.87 
 
 
144 aa  41.6  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.348394 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0087  hypothetical protein  29.05 
 
 
150 aa  41.2  0.005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0069  hypothetical protein  25.35 
 
 
155 aa  40.8  0.007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.473003  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1602  Nodulation efficiency protein NfeD  39.29 
 
 
489 aa  40.4  0.009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>