13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7229 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_7229  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 470 aa  910    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2005  transcriptional regulator, XRE family  34.14 
 
 		 388 aa  125  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.445906  normal  0.114252 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01940  hypothetical protein  35.86 
 
 		 360 aa  122  9.999999999999999e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.705916 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1837  hypothetical protein  33.98 
 
 		 509 aa  94.7  3e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1710  transcriptional regulator, XRE family  46.15 
 
 		 420 aa  53.5  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.371639  normal  0.199479 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2498  XRE family transcriptional regulator  43.84 
 
 		 474 aa  52.8  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.153795 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2547  hypothetical protein  33.48 
 
 		 545 aa  50.8  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.441995  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1813  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  32.45 
 
 		 444 aa  50.4  0.00007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7352  hypothetical protein  31.28 
 
 		 518 aa  47.4  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1107  hypothetical protein  30.87 
 
 		 468 aa  45.1  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.551011  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0762  XRE family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 132 aa  43.5  0.009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2421  helix-turn-helix domain-containing protein  45.45 
 
 		 132 aa  43.5  0.009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.195917  normal  0.223738 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25890  predicted transcriptional regulator  40.85 
 
 		 272 aa  43.5  0.009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>