32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_4757 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_4757  hypothetical protein  100 
 
 		 238 aa  472  1e-132  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4040  hypothetical protein  48.1 
 
 		 252 aa  226  3e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03591  hypothetical protein  42.13 
 
 		 251 aa  218  7e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.459128  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4196  hypothetical protein  38.08 
 
 		 249 aa  154  1e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000215538  hitchhiker  0.000358046 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3564  hypothetical protein  36.6 
 
 		 245 aa  151  7e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000019199  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0805  hypothetical protein  36.55 
 
 		 231 aa  150  1e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000415651  hitchhiker  0.000000000063684 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2088  hypothetical protein  36.89 
 
 		 256 aa  150  1e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.100249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0780  hypothetical protein  36.55 
 
 		 245 aa  150  1e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000762567  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3579  hypothetical protein  36.55 
 
 		 245 aa  150  1e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000110891  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0812  hypothetical protein  36.55 
 
 		 245 aa  150  2e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000586351  normal  0.244718 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0767  hypothetical protein  36.55 
 
 		 231 aa  149  3e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000836076  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3237  hypothetical protein  36.97 
 
 		 231 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000795933  hitchhiker  0.0000110881 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0724  hypothetical protein  36.13 
 
 		 231 aa  146  3e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000015789  hitchhiker  0.00185842 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3905  hypothetical protein  35.29 
 
 		 231 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0752  hypothetical protein  36.97 
 
 		 231 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000104845  normal  0.017498 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0543  hypothetical protein  33.47 
 
 		 252 aa  138  7e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000718066  normal  0.604176 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0773  hypothetical protein  33.47 
 
 		 254 aa  133  3e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0548647  unclonable  0.0000000000796342 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3049  hypothetical protein  31.74 
 
 		 246 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00345897  normal  0.661514 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3333  hypothetical protein  33.05 
 
 		 244 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0150205  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3226  hypothetical protein  31.95 
 
 		 247 aa  113  3e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000725415  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1688  hypothetical protein  32.6 
 
 		 246 aa  90.1  3e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.136062  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0400  hypothetical protein  27.7 
 
 		 232 aa  76.3  0.0000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.458276  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0133  hypothetical protein  26.41 
 
 		 250 aa  74.7  0.000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3608  hypothetical protein  32.29 
 
 		 199 aa  72  0.000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000290926  normal  0.0278483 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1690  hypothetical protein  25.62 
 
 		 231 aa  68.2  0.0000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3433  hypothetical protein  30.67 
 
 		 209 aa  62.4  0.000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00305533 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1630  hypothetical protein  25.23 
 
 		 273 aa  62  0.000000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.000000000000164262  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1874  hypothetical protein  24.89 
 
 		 227 aa  61.6  0.000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.550374  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00007  hypothetical protein  27 
 
 		 221 aa  61.6  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002348  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system component  25.91 
 
 		 219 aa  57  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0027  hypothetical protein  26.26 
 
 		 256 aa  55.5  0.0000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000116236  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2792  hypothetical protein  27.09 
 
 		 221 aa  54.3  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.17249  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>