13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1874 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1874  hypothetical protein  100 
 
 		 227 aa  459  9.999999999999999e-129  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.550374  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0027  hypothetical protein  44.02 
 
 		 256 aa  218  5e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000116236  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1630  hypothetical protein  32.67 
 
 		 273 aa  123  3e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.000000000000164262  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2088  hypothetical protein  29.63 
 
 		 256 aa  74.7  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.100249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4040  hypothetical protein  29.11 
 
 		 252 aa  74.3  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03591  hypothetical protein  26.81 
 
 		 251 aa  69.3  0.00000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.459128  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0133  hypothetical protein  28.94 
 
 		 250 aa  67.4  0.0000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1688  hypothetical protein  28.33 
 
 		 246 aa  64.3  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.136062  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4757  hypothetical protein  24.89 
 
 		 238 aa  61.6  0.000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1690  hypothetical protein  29.73 
 
 		 231 aa  51.2  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3564  hypothetical protein  29.25 
 
 		 245 aa  47  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000019199  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0543  hypothetical protein  28.76 
 
 		 252 aa  44.7  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000718066  normal  0.604176 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4196  hypothetical protein  28.48 
 
 		 249 aa  42.7  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000215538  hitchhiker  0.000358046 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>