31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0133 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_0133  hypothetical protein  100 
 
 
250 aa  509  1e-143  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03591  hypothetical protein  28.68 
 
 
251 aa  99.4  5e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.459128  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4040  hypothetical protein  29.44 
 
 
252 aa  88.6  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1630  hypothetical protein  27.86 
 
 
273 aa  87.4  2e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.000000000000164262  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2088  hypothetical protein  26.47 
 
 
256 aa  80.1  0.00000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.100249  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1688  hypothetical protein  30.26 
 
 
246 aa  75.5  0.0000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.136062  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4757  hypothetical protein  26.41 
 
 
238 aa  74.7  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1690  hypothetical protein  22.69 
 
 
231 aa  70.5  0.00000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3564  hypothetical protein  26.04 
 
 
245 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000019199  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1874  hypothetical protein  28.94 
 
 
227 aa  67.4  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.550374  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0767  hypothetical protein  26.86 
 
 
231 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000836076  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3905  hypothetical protein  27.27 
 
 
231 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0543  hypothetical protein  25.86 
 
 
252 aa  65.9  0.0000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000718066  normal  0.604176 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3333  hypothetical protein  26.25 
 
 
244 aa  65.9  0.0000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0150205  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0780  hypothetical protein  26.56 
 
 
245 aa  65.1  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000762567  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0812  hypothetical protein  26.56 
 
 
245 aa  64.7  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000586351  normal  0.244718 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3579  hypothetical protein  26.56 
 
 
245 aa  65.1  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000110891  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0805  hypothetical protein  26.45 
 
 
231 aa  62.4  0.000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000415651  hitchhiker  0.000000000063684 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0752  hypothetical protein  26.34 
 
 
231 aa  60.5  0.00000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000104845  normal  0.017498 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3237  hypothetical protein  26.03 
 
 
231 aa  60.1  0.00000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000795933  hitchhiker  0.0000110881 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3608  hypothetical protein  25.37 
 
 
199 aa  60.1  0.00000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000290926  normal  0.0278483 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0724  hypothetical protein  26.45 
 
 
231 aa  59.3  0.00000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000015789  hitchhiker  0.00185842 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3049  hypothetical protein  27.07 
 
 
246 aa  58.2  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00345897  normal  0.661514 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0773  hypothetical protein  23.75 
 
 
254 aa  57.4  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0548647  unclonable  0.0000000000796342 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4196  hypothetical protein  22.48 
 
 
249 aa  55.1  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000215538  hitchhiker  0.000358046 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3226  hypothetical protein  21.92 
 
 
247 aa  53.5  0.000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000725415  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0400  hypothetical protein  24.35 
 
 
232 aa  52.4  0.000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.458276  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0027  hypothetical protein  25.21 
 
 
256 aa  49.3  0.00006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000116236  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3433  hypothetical protein  23.81 
 
 
209 aa  46.2  0.0004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00305533 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00007  hypothetical protein  22.91 
 
 
221 aa  45.4  0.0008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002348  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system component  24.34 
 
 
219 aa  42  0.009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>