29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_3905 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_3905  hypothetical protein  100 
 
 
231 aa  470  1e-132  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0724  hypothetical protein  95.24 
 
 
231 aa  451  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000015789  hitchhiker  0.00185842 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3237  hypothetical protein  94.37 
 
 
231 aa  449  1e-125  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000795933  hitchhiker  0.0000110881 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0752  hypothetical protein  93.51 
 
 
231 aa  444  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000104845  normal  0.017498 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0767  hypothetical protein  90.04 
 
 
231 aa  431  1e-120  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000836076  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3579  hypothetical protein  88.74 
 
 
245 aa  430  1e-119  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000110891  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0805  hypothetical protein  88.74 
 
 
231 aa  428  1e-119  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000415651  hitchhiker  0.000000000063684 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0812  hypothetical protein  88.31 
 
 
245 aa  429  1e-119  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000586351  normal  0.244718 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0780  hypothetical protein  88.74 
 
 
245 aa  430  1e-119  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000762567  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3564  hypothetical protein  68.12 
 
 
245 aa  344  6e-94  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000019199  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3333  hypothetical protein  69.57 
 
 
244 aa  329  2e-89  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0150205  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4196  hypothetical protein  63.98 
 
 
249 aa  315  3e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000215538  hitchhiker  0.000358046 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0543  hypothetical protein  63.56 
 
 
252 aa  305  4.0000000000000004e-82  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000718066  normal  0.604176 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0773  hypothetical protein  61.34 
 
 
254 aa  305  6e-82  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0548647  unclonable  0.0000000000796342 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3226  hypothetical protein  61.14 
 
 
247 aa  296  2e-79  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000725415  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3049  hypothetical protein  62.05 
 
 
246 aa  282  3.0000000000000004e-75  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00345897  normal  0.661514 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4757  hypothetical protein  35.29 
 
 
238 aa  146  3e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03591  hypothetical protein  34.89 
 
 
251 aa  143  2e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.459128  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4040  hypothetical protein  33.05 
 
 
252 aa  137  1e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2088  hypothetical protein  29.1 
 
 
256 aa  99.8  3e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.100249  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1688  hypothetical protein  27.18 
 
 
246 aa  68.9  0.00000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.136062  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0133  hypothetical protein  27.27 
 
 
250 aa  66.6  0.0000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1690  hypothetical protein  22.46 
 
 
231 aa  62.8  0.000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3608  hypothetical protein  28.49 
 
 
199 aa  61.6  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000290926  normal  0.0278483 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3433  hypothetical protein  27.51 
 
 
209 aa  61.2  0.00000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00305533 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00007  hypothetical protein  23.08 
 
 
221 aa  60.8  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002348  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system component  22.17 
 
 
219 aa  55.8  0.0000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2792  hypothetical protein  25 
 
 
221 aa  49.7  0.00004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.17249  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0400  hypothetical protein  24.75 
 
 
232 aa  49.3  0.00005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.458276  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>