32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2088 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_2088  hypothetical protein  100 
 
 		 256 aa  515  1.0000000000000001e-145  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.100249  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03591  hypothetical protein  37.31 
 
 		 251 aa  160  1e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.459128  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4757  hypothetical protein  36.89 
 
 		 238 aa  151  1e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4040  hypothetical protein  34.11 
 
 		 252 aa  149  5e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1688  hypothetical protein  34.6 
 
 		 246 aa  125  5e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.136062  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3564  hypothetical protein  32.82 
 
 		 245 aa  125  6e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000019199  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0543  hypothetical protein  33.59 
 
 		 252 aa  123  2e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000718066  normal  0.604176 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4196  hypothetical protein  33.2 
 
 		 249 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000215538  hitchhiker  0.000358046 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0773  hypothetical protein  30.89 
 
 		 254 aa  113  3e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0548647  unclonable  0.0000000000796342 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0752  hypothetical protein  29.63 
 
 		 231 aa  107  2e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000104845  normal  0.017498 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0780  hypothetical protein  28.96 
 
 		 245 aa  105  6e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000762567  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3579  hypothetical protein  28.96 
 
 		 245 aa  105  6e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000110891  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0812  hypothetical protein  28.96 
 
 		 245 aa  105  8e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000586351  normal  0.244718 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3333  hypothetical protein  30.5 
 
 		 244 aa  105  9e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0150205  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3237  hypothetical protein  28.81 
 
 		 231 aa  101  1e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000795933  hitchhiker  0.0000110881 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0767  hypothetical protein  29.05 
 
 		 231 aa  100  2e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000836076  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0724  hypothetical protein  28.4 
 
 		 231 aa  100  2e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000015789  hitchhiker  0.00185842 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3905  hypothetical protein  29.1 
 
 		 231 aa  99.8  4e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0805  hypothetical protein  28.63 
 
 		 231 aa  99  7e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000415651  hitchhiker  0.000000000063684 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3226  hypothetical protein  27.91 
 
 		 247 aa  98.2  1e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000725415  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3049  hypothetical protein  30.38 
 
 		 246 aa  89.7  4e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00345897  normal  0.661514 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0133  hypothetical protein  26.04 
 
 		 250 aa  83.2  0.000000000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1690  hypothetical protein  24.24 
 
 		 231 aa  78.6  0.0000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1874  hypothetical protein  29.63 
 
 		 227 aa  74.7  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.550374  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3608  hypothetical protein  29.5 
 
 		 199 aa  71.2  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000290926  normal  0.0278483 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0027  hypothetical protein  25.65 
 
 		 256 aa  63.9  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000116236  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1630  hypothetical protein  23.18 
 
 		 273 aa  59.3  0.00000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.000000000000164262  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0400  hypothetical protein  26.52 
 
 		 232 aa  55.8  0.0000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.458276  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002348  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system component  24.19 
 
 		 219 aa  51.6  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00007  hypothetical protein  22.4 
 
 		 221 aa  46.6  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2792  hypothetical protein  22.4 
 
 		 221 aa  45.1  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.17249  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3433  hypothetical protein  23.66 
 
 		 209 aa  43.1  0.004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00305533 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>