32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_03591 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011138  MADE_03591  hypothetical protein  100 
 
 
251 aa  501  1e-141  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.459128  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4040  hypothetical protein  55.95 
 
 
252 aa  302  3.0000000000000004e-81  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4757  hypothetical protein  42.13 
 
 
238 aa  218  7.999999999999999e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4196  hypothetical protein  41.57 
 
 
249 aa  179  4e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000215538  hitchhiker  0.000358046 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3564  hypothetical protein  37.3 
 
 
245 aa  165  8e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000019199  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0543  hypothetical protein  36.72 
 
 
252 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000718066  normal  0.604176 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3333  hypothetical protein  41.67 
 
 
244 aa  162  3e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0150205  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0773  hypothetical protein  37.84 
 
 
254 aa  162  7e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0548647  unclonable  0.0000000000796342 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0812  hypothetical protein  37.3 
 
 
245 aa  160  2e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000586351  normal  0.244718 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0780  hypothetical protein  37.3 
 
 
245 aa  160  2e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000762567  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3579  hypothetical protein  37.3 
 
 
245 aa  160  2e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000110891  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2088  hypothetical protein  36.36 
 
 
256 aa  155  7e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.100249  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0767  hypothetical protein  38.82 
 
 
231 aa  155  8e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000836076  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0752  hypothetical protein  37.55 
 
 
231 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000104845  normal  0.017498 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3237  hypothetical protein  37.13 
 
 
231 aa  152  7e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000795933  hitchhiker  0.0000110881 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0805  hypothetical protein  37.13 
 
 
231 aa  150  1e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000415651  hitchhiker  0.000000000063684 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0724  hypothetical protein  36.29 
 
 
231 aa  149  5e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000015789  hitchhiker  0.00185842 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3905  hypothetical protein  34.89 
 
 
231 aa  143  2e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3226  hypothetical protein  36.47 
 
 
247 aa  137  1e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000725415  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3049  hypothetical protein  34.92 
 
 
246 aa  133  3e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00345897  normal  0.661514 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1688  hypothetical protein  31.03 
 
 
246 aa  111  1.0000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.136062  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0133  hypothetical protein  28.68 
 
 
250 aa  99.4  5e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1690  hypothetical protein  29.44 
 
 
231 aa  97.8  2e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3433  hypothetical protein  29.48 
 
 
209 aa  77  0.0000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00305533 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1630  hypothetical protein  25.47 
 
 
273 aa  75.1  0.0000000000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.000000000000164262  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1874  hypothetical protein  26.81 
 
 
227 aa  69.3  0.00000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.550374  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0400  hypothetical protein  26.32 
 
 
232 aa  63.2  0.000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.458276  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3608  hypothetical protein  27.19 
 
 
199 aa  62  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000290926  normal  0.0278483 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00007  hypothetical protein  24.03 
 
 
221 aa  58.2  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2792  hypothetical protein  24.41 
 
 
221 aa  57.8  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.17249  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002348  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system component  22.97 
 
 
219 aa  57  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0027  hypothetical protein  23.38 
 
 
256 aa  55.1  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000116236  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>