28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_0805 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009997  Sbal195_0812  hypothetical protein  99.57 
 
 
245 aa  473  1e-133  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000586351  normal  0.244718 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0780  hypothetical protein  100 
 
 
245 aa  474  1e-133  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000762567  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3579  hypothetical protein  100 
 
 
245 aa  474  1e-133  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000110891  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0805  hypothetical protein  100 
 
 
231 aa  472  1e-132  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000415651  hitchhiker  0.000000000063684 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0767  hypothetical protein  90.04 
 
 
231 aa  436  1e-121  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000836076  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3237  hypothetical protein  89.18 
 
 
231 aa  432  1e-120  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000795933  hitchhiker  0.0000110881 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0724  hypothetical protein  89.18 
 
 
231 aa  432  1e-120  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000015789  hitchhiker  0.00185842 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3905  hypothetical protein  88.74 
 
 
231 aa  428  1e-119  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0752  hypothetical protein  88.31 
 
 
231 aa  427  1e-119  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000104845  normal  0.017498 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3564  hypothetical protein  72.73 
 
 
245 aa  364  1e-100  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000019199  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3333  hypothetical protein  69.87 
 
 
244 aa  330  1e-89  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0150205  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4196  hypothetical protein  66.67 
 
 
249 aa  327  1.0000000000000001e-88  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000215538  hitchhiker  0.000358046 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0543  hypothetical protein  66.39 
 
 
252 aa  319  1.9999999999999998e-86  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000718066  normal  0.604176 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0773  hypothetical protein  64.02 
 
 
254 aa  319  1.9999999999999998e-86  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0548647  unclonable  0.0000000000796342 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3226  hypothetical protein  60.17 
 
 
247 aa  298  7e-80  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000725415  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3049  hypothetical protein  60.27 
 
 
246 aa  278  6e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00345897  normal  0.661514 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4757  hypothetical protein  36.55 
 
 
238 aa  150  1e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03591  hypothetical protein  37.13 
 
 
251 aa  150  1e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.459128  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4040  hypothetical protein  32.49 
 
 
252 aa  137  2e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2088  hypothetical protein  28.63 
 
 
256 aa  99  5e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.100249  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1688  hypothetical protein  27.09 
 
 
246 aa  71.2  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.136062  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1690  hypothetical protein  24.79 
 
 
231 aa  64.7  0.000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0133  hypothetical protein  26.45 
 
 
250 aa  62.4  0.000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3433  hypothetical protein  27.52 
 
 
209 aa  62.4  0.000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00305533 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3608  hypothetical protein  27.51 
 
 
199 aa  61.2  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000290926  normal  0.0278483 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00007  hypothetical protein  23.18 
 
 
221 aa  53.5  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002348  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system component  22.3 
 
 
219 aa  49.3  0.00006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0400  hypothetical protein  21.83 
 
 
232 aa  42.4  0.006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.458276  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>