267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_4505 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_4505  dihydrofolate reductase  100 
 
 
170 aa  352  2e-96  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.13858  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001668  dihydrofolate reductase  61.21 
 
 
159 aa  213  8e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00805  hypothetical protein  58.18 
 
 
159 aa  206  2e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2858  dihydrofolate reductase  58.18 
 
 
165 aa  200  6e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000404405  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1045  dihydrofolate reductase  56.29 
 
 
163 aa  194  5e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.46602  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3735  dihydrofolate reductase  52.05 
 
 
171 aa  189  2e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0124901  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3741  dihydrofolate reductase  53.57 
 
 
169 aa  188  3e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.674026  hitchhiker  0.000322893 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0874  dihydrofolate reductase  57.62 
 
 
160 aa  188  4e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0789491  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0366  dihydrofolate reductase type 3  51.69 
 
 
173 aa  184  4e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2824  dihydrofolate reductase  56.29 
 
 
160 aa  179  1e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.545858 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1582  Dihydrofolate reductase  52.12 
 
 
162 aa  177  6e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  2.74022e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1793  dihydrofolate reductase  52.1 
 
 
174 aa  177  7e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.928797  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2431  dihydrofolate reductase  48.5 
 
 
171 aa  177  7e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3578  dihydrofolate reductase  53.33 
 
 
160 aa  177  9e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0778  dihydrofolate reductase  53.33 
 
 
160 aa  177  9e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.143949  normal  0.0713752 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3449  dihydrofolate reductase  53.33 
 
 
160 aa  177  9e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3646  dihydrofolate reductase  57.93 
 
 
160 aa  176  9e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1398  dihydrofolate reductase  48.81 
 
 
172 aa  174  4e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0782  dihydrofolate reductase  48.82 
 
 
166 aa  173  9e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.039834 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2748  Dihydrofolate reductase  51.83 
 
 
162 aa  173  1e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1310  dihydrofolate reductase region  49.4 
 
 
161 aa  173  1e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  8.86123e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2964  Dihydrofolate reductase  48.5 
 
 
166 aa  172  2e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.159706  normal  0.451516 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03728  dihydrofolate reductase type I, trimethoprim resistance  52.73 
 
 
167 aa  172  2e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.794995  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0720  dihydrofolate reductase  52.44 
 
 
160 aa  172  3e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.919586 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3214  dihydrofolate reductase  56.55 
 
 
160 aa  171  4e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.871101  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1354  dihydrofolate reductase  48.21 
 
 
172 aa  171  4e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.340933  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0959  dihydrofolate reductase  54.3 
 
 
160 aa  171  5e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0597  dihydrofolate reductase  51.52 
 
 
159 aa  171  6e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.235828  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6452  Dihydrofolate reductase  48.78 
 
 
164 aa  170  8e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.816768  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1020  dihydrofolate reductase  47.31 
 
 
166 aa  169  1e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.831665  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3318  Dihydrofolate reductase  54.86 
 
 
160 aa  169  2e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2569  dihydrofolate reductase  49.41 
 
 
166 aa  169  2e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.858438  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0972  dihydrofolate reductase  54.86 
 
 
160 aa  168  3e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.415398  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3084  dihydrofolate reductase  52.32 
 
 
160 aa  168  3e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3120  dihydrofolate reductase  55.86 
 
 
160 aa  168  3e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2842  dihydrofolate reductase  48.5 
 
 
167 aa  168  3e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.551792  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0093  dihydrofolate reductase  50.91 
 
 
159 aa  168  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0092  dihydrofolate reductase  50.91 
 
 
159 aa  168  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.197159 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0387  dihydrofolate reductase  48.5 
 
 
167 aa  168  4e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2902  dihydrofolate reductase  48.5 
 
 
167 aa  168  4e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.95504  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1750  dihydrofolate reductase  49.39 
 
 
167 aa  168  4e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.175283  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0096  dihydrofolate reductase  50.91 
 
 
159 aa  168  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0098  dihydrofolate reductase  50.91 
 
 
159 aa  168  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.653551 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0091  dihydrofolate reductase  50.91 
 
 
159 aa  168  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.895795 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1074  dihydrofolate reductase  54.17 
 
 
160 aa  168  4e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0303057  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1041  dihydrofolate reductase  54.17 
 
 
160 aa  168  4e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0691593  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2530  dihydrofolate reductase  48.5 
 
 
167 aa  168  4e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0244  dihydrofolate reductase  48.5 
 
 
167 aa  168  4e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0903  dihydrofolate reductase  48.5 
 
 
167 aa  168  4e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1009  dihydrofolate reductase  52.32 
 
 
160 aa  167  8e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.415728  hitchhiker  2.43395e-05 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1674  dihydrofolate reductase  48.5 
 
 
219 aa  167  9e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.69831  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2952  dihydrofolate reductase  47.9 
 
 
167 aa  166  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.700087  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0900  dihydrofolate reductase  54.86 
 
 
160 aa  166  1e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.131279  normal  0.732147 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3836  dihydrofolate reductase  50.6 
 
 
160 aa  166  1e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4737  dihydrofolate reductase  47.59 
 
 
170 aa  166  2e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.153856 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3551  Dihydrofolate reductase  49.1 
 
 
196 aa  166  2e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0050  dihydrofolate reductase  49.1 
 
 
196 aa  166  2e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.450338 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0054  dihydrofolate reductase  49.7 
 
 
159 aa  165  3e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0857  dihydrofolate reductase  50.33 
 
 
160 aa  165  3e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.535024  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2449  dihydrofolate reductase  47.88 
 
 
169 aa  165  3e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.110989 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3607  dihydrofolate reductase  49.7 
 
 
159 aa  165  3e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00332333 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3641  dihydrofolate reductase  51.2 
 
 
160 aa  165  3e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0042  dihydrofolate reductase  49.7 
 
 
159 aa  165  3e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00052  dihydrofolate reductase  49.7 
 
 
159 aa  165  3e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00051  hypothetical protein  49.7 
 
 
159 aa  165  3e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2220  dihydrofolate reductase  47.27 
 
 
162 aa  165  3e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.151366  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2221  dihydrofolate reductase  49.7 
 
 
209 aa  164  4e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0052  dihydrofolate reductase  49.7 
 
 
159 aa  164  5e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.264396  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2349  dihydrofolate reductase  47.27 
 
 
162 aa  164  6e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  1.30652e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3104  dihydrofolate reductase  46.67 
 
 
162 aa  164  6e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.172131  hitchhiker  1.00648e-11 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2021  dihydrofolate reductase  47.27 
 
 
162 aa  164  6e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0888  Dihydrofolate reductase  47.65 
 
 
167 aa  164  6e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.733276  normal  0.450678 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2021  dihydrofolate reductase  47.27 
 
 
162 aa  164  6e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.981299  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2083  dihydrofolate reductase  47.27 
 
 
162 aa  164  6e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.25981  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0052  dihydrofolate reductase  49.1 
 
 
196 aa  164  6e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2062  dihydrofolate reductase  47.27 
 
 
162 aa  164  6e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000278641  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2237  dihydrofolate reductase  47.27 
 
 
162 aa  164  6e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.044685  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0817  Dihydrofolate reductase  47.65 
 
 
167 aa  164  6e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0599  dihydrofolate reductase  49.7 
 
 
165 aa  164  7e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2264  dihydrofolate reductase  47.27 
 
 
162 aa  164  7e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.24191e-31 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1640  dihydrofolate reductase  47.27 
 
 
162 aa  164  8e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00601598  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0958  dihydrofolate reductase  50.9 
 
 
195 aa  163  9e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0189  dihydrofolate reductase  48.78 
 
 
161 aa  163  1e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0946  dihydrofolate reductase oxidoreductase protein  47.06 
 
 
167 aa  162  1e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0266319 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2019  dihydrofolate reductase  46.34 
 
 
187 aa  162  1e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4196  dihydrofolate reductase  50.3 
 
 
166 aa  162  1e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0437  dihydrofolate reductase  46.99 
 
 
170 aa  162  2e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0962  dihydrofolate reductase  50.9 
 
 
166 aa  162  2e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.505116  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0914  dihydrofolate reductase  47.06 
 
 
166 aa  162  2e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4209  dihydrofolate reductase  49.09 
 
 
176 aa  161  3e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0559  dihydrofolate reductase  50.91 
 
 
160 aa  161  3e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0573  dihydrofolate reductase  45.24 
 
 
175 aa  161  4e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5184  dihydrofolate reductase  45.51 
 
 
171 aa  161  4e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.128106  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1082  dihydrofolate reductase  50.3 
 
 
166 aa  161  4e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1041  dihydrofolate reductase  50.3 
 
 
166 aa  161  5e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2922  dihydrofolate reductase  51.03 
 
 
160 aa  160  7e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  3.8363e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2588  Dihydrofolate reductase  46.67 
 
 
164 aa  160  8e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0899  Dihydrofolate reductase  48.19 
 
 
177 aa  160  9e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2267  dihydrofolate reductase  46.06 
 
 
162 aa  160  1e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00982117  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0603  dihydrofolate reductase  49.7 
 
 
186 aa  159  2e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>