35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_0699 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_0699  hypothetical protein  100 
 
 		 146 aa  300  3.0000000000000004e-81  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0996  hemerythrin HHE cation binding region  57.25 
 
 		 148 aa  153  8e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1838  hemerythrin HHE cation binding region  53.79 
 
 		 145 aa  147  6e-35  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.49812  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1891  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  51.11 
 
 		 152 aa  140  4e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2172  hypothetical protein  53.44 
 
 		 146 aa  135  2e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0485385  hitchhiker  0.00000439184 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0493  hemerythrin HHE cation binding region  51.08 
 
 		 146 aa  135  2e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1648  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  44.53 
 
 		 224 aa  118  1.9999999999999998e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.371191  normal  0.835393 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5064  hemerythrin HHE cation binding region  36.5 
 
 		 141 aa  105  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.650384  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2085  hemerythrin HHE cation binding region  37.24 
 
 		 148 aa  102  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.297499 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3600  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  39.16 
 
 		 240 aa  94.4  5e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3669  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  39.16 
 
 		 240 aa  94.4  5e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3512  hemerythrin HHE cation binding protein  42.02 
 
 		 240 aa  92  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0549925  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2868  hypothetical protein  31.34 
 
 		 153 aa  66.2  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2489  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  31.34 
 
 		 153 aa  66.2  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1527  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  34.75 
 
 		 177 aa  58.2  0.00000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000541236  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03879  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  30.85 
 
 		 146 aa  55.5  0.0000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0776  hypothetical protein  31.52 
 
 		 270 aa  53.5  0.0000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000379179  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0752  hypothetical protein  31.52 
 
 		 270 aa  53.5  0.0000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00690211  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2034  hemerythrin hhE cation binding domain-containing protein  28.57 
 
 		 216 aa  52.4  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.568645 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3145  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  30 
 
 		 316 aa  52  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1402  hemerythrin HHE cation binding protein  32.38 
 
 		 201 aa  50.1  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2455  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  32.38 
 
 		 202 aa  50.1  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.704463  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2551  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  32.38 
 
 		 202 aa  48.9  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4302  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  30.08 
 
 		 168 aa  48.1  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2614  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  34.07 
 
 		 176 aa  45.8  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.587772  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1509  hypothetical protein  30.11 
 
 		 411 aa  43.9  0.0008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1931  hypothetical protein  25.98 
 
 		 407 aa  43.9  0.0008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000706509  hitchhiker  0.00330228 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1777  putative PAS/PAC sensor protein  34.09 
 
 		 432 aa  42.4  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00046622  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0494  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  33.73 
 
 		 168 aa  42.4  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.235058  normal  0.242573 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1165  protein of unknown function DUF438  26.13 
 
 		 491 aa  41.6  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.310279  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2428  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  33.02 
 
 		 202 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0824334 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2937  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  31.76 
 
 		 184 aa  40.8  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02289  iron-sulfur cluster repair di-iron protein  37.97 
 
 		 223 aa  40.8  0.006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.104095 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1436  hypothetical protein  23.66 
 
 		 154 aa  40.8  0.007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31370  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  28.67 
 
 		 164 aa  40.4  0.008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>