39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_0600 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_0600  nitric-oxide reductase, C subunit  100 
 
 		 148 aa  310  4.999999999999999e-84  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3114  nitric-oxide reductase  70.47 
 
 		 149 aa  231  3e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.848793  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0624  nitric-oxide reductase subunit C  66.89 
 
 		 146 aa  220  6e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.7522  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06810  nitric-oxide reductase subunit C  66.22 
 
 		 146 aa  218  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1981  nitric-oxide reductase  68.92 
 
 		 148 aa  209  7.999999999999999e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0562  nitric-oxide reductase subunit C  59.46 
 
 		 141 aa  197  3.9999999999999996e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00000000244582  normal  0.667506 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1469  putative nitric-oxide reductase subunit C  56.95 
 
 		 144 aa  187  5e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0490072 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0121  nitric-oxide reductase  57.43 
 
 		 146 aa  186  1e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.281519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0224  nitric-oxide reductase, small subunit  57.33 
 
 		 150 aa  179  1e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.501338  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0248  nitric-oxide reductase, small subunit  56.67 
 
 		 150 aa  177  4e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4386  cytochrome c class I  56 
 
 		 150 aa  176  8e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2088  nitric-oxide reductase subunit C  53.33 
 
 		 150 aa  174  4e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.601343  normal  0.740001 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2597  cytochrome c class I  62.84 
 
 		 141 aa  172  9.999999999999999e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.570262  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6289  cytochrome c class I  54.67 
 
 		 150 aa  171  2.9999999999999996e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1641  nitric-oxide reductase, small subunit  56.67 
 
 		 150 aa  164  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1850  nitric-oxide reductase  52 
 
 		 173 aa  162  1.0000000000000001e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2484  nitric-oxide reductase  53.64 
 
 		 150 aa  162  2.0000000000000002e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.595154 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1515  nitric-oxide reductase  49.33 
 
 		 150 aa  157  4e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2117  nitric-oxide reductase  48 
 
 		 150 aa  155  2e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.916968 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3183  nitric-oxide reductase subunit C  50.99 
 
 		 150 aa  155  2e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0696448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1969  nitric-oxide reductase  48.67 
 
 		 150 aa  149  2e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0324  nitric oxide reductase subunit C, cytochrome c  48.67 
 
 		 150 aa  148  3e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.115359  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0970  hypothetical protein  48.37 
 
 		 147 aa  147  5e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3190  cytochrome c, class I  55.03 
 
 		 142 aa  143  7.0000000000000006e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0822  nitric oxide reductase, cytochrome c-containing subunit  35 
 
 		 277 aa  97.8  4e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.198002  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3436  cytochrome c, class I  41.94 
 
 		 290 aa  96.7  1e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.441606  normal  0.713637 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2768  cytochrome c class I  41.94 
 
 		 290 aa  96.7  1e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.712603  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1256  cytochrome c, class I  34.29 
 
 		 272 aa  95.5  2e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2759  cytochrome c class I  32.17 
 
 		 253 aa  85.1  3e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1249  cytochrome c class I  30.77 
 
 		 238 aa  84.3  6e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3033  cytochrome c class I  29.37 
 
 		 238 aa  78.6  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2401  hypothetical protein  33.01 
 
 		 200 aa  62  0.000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1983  nitric-oxide reductase subunit NorC  30.56 
 
 		 228 aa  52  0.000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000092612  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2254  hypothetical protein  26.73 
 
 		 133 aa  52  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3540  cytochrome c oxidase, subunit II  29.41 
 
 		 311 aa  41.2  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0430  hypothetical protein  30.85 
 
 		 122 aa  41.2  0.005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  6.67584e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1449  cytochrome c oxidase, subunit II  25.23 
 
 		 346 aa  40.8  0.006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.015711 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4806  cytochrome c class I  29.31 
 
 		 136 aa  40.8  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.167135  normal  0.0495406 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0440  nitrous-oxide reductase  28.57 
 
 		 864 aa  40.4  0.007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.136119  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>