More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1059 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_1247  ExsB family protein  100 
 
 		 244 aa  503  9.999999999999999e-143  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.400272  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1059  PP-loop family protein  100 
 
 		 244 aa  503  9.999999999999999e-143  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2599  PP-loop domain protein  52.65 
 
 		 235 aa  265  5.999999999999999e-70  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000526821  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3405  PP-loop domain protein  50.64 
 
 		 239 aa  255  5e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2259  PP-loop domain-containing protein  49.16 
 
 		 242 aa  249  4e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000140384  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2181  ATPase  52.4 
 
 		 237 aa  247  1e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000263465  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1810  PP-loop domain-containing protein  48.67 
 
 		 235 aa  243  1.9999999999999999e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000657331  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1321  PP-loop domain-containing protein  48.54 
 
 		 252 aa  229  3e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.32014  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2367  PP-loop domain protein  42.92 
 
 		 247 aa  208  8e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0882  PP-loop domain-containing protein  40.17 
 
 		 307 aa  196  2.0000000000000003e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.175206  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1709  PP-loop domain protein  39.83 
 
 		 244 aa  191  7e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1011  PP family ATPase  41.63 
 
 		 240 aa  189  4e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0407194  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0799  PP-loop domain protein  40.17 
 
 		 247 aa  188  5.999999999999999e-47  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2544  PP-loop domain protein  36.07 
 
 		 292 aa  174  8e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.203919  normal  0.870169 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0127  C32 tRNA thiolase  37.7 
 
 		 282 aa  171  6.999999999999999e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20940  PP-loop domain protein  40.37 
 
 		 260 aa  171  6.999999999999999e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000433533  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0671  C32 tRNA thiolase  38.37 
 
 		 259 aa  166  4e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.51504e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0942  PP-loop domain-containing protein  37.9 
 
 		 294 aa  165  5e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.907512  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2975  C32 tRNA thiolase  39.32 
 
 		 331 aa  161  1e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2892  C32 tRNA thiolase  37.3 
 
 		 336 aa  161  1e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00588342 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1247  C32 tRNA thiolase  36.73 
 
 		 313 aa  160  2e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0206  C32 tRNA thiolase  37.3 
 
 		 336 aa  160  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0290  C32 tRNA thiolase  38.93 
 
 		 331 aa  159  3e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.583518  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2890  C32 tRNA thiolase  38.89 
 
 		 340 aa  159  4e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.735906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3730  C32 tRNA thiolase  36.89 
 
 		 336 aa  159  4e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0526035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3027  C32 tRNA thiolase  38.89 
 
 		 334 aa  159  4e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1391  hypothetical protein  38.52 
 
 		 260 aa  158  7e-38  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.738362  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0875  PP-loop  37.13 
 
 		 284 aa  158  7e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00139883  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1773  C32 tRNA thiolase  37.82 
 
 		 313 aa  158  8e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2245  C32 tRNA thiolase  38.52 
 
 		 331 aa  157  1e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.705781  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0340  C32 tRNA thiolase  38.52 
 
 		 331 aa  157  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.576069  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3054  C32 tRNA thiolase  38.52 
 
 		 331 aa  157  1e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.31194  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3381  C32 tRNA thiolase  38.52 
 
 		 331 aa  157  1e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000151455  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0327  C32 tRNA thiolase  38.52 
 
 		 331 aa  157  1e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0519  C32 tRNA thiolase  38.52 
 
 		 331 aa  157  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.339453  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2039  C32 tRNA thiolase  38.52 
 
 		 331 aa  157  1e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.605016  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2366  C32 tRNA thiolase  38.36 
 
 		 326 aa  157  1e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.53458  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0952  PP-loop domain protein  32.38 
 
 		 291 aa  157  2e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3000  C32 tRNA thiolase  38.36 
 
 		 331 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3336  C32 tRNA thiolase  37.25 
 
 		 264 aa  157  2e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.167025  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0954  PP-loop domain protein  32.38 
 
 		 291 aa  156  2e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2980  C32 tRNA thiolase  38.36 
 
 		 331 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1043  C32 tRNA thiolase  36.91 
 
 		 310 aa  156  2e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00286005  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2160  C32 tRNA thiolase  36.99 
 
 		 322 aa  156  3e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00960533  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2210  C32 tRNA thiolase  35.95 
 
 		 322 aa  156  3e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000285606  normal  0.272334 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1801  C32 tRNA thiolase  35.54 
 
 		 319 aa  156  3e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.313433 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2224  C32 tRNA thiolase  36.99 
 
 		 322 aa  156  3e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000167986  normal  0.0826377 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6329  C32 tRNA thiolase  37.93 
 
 		 331 aa  156  4e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.577363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0903  C32 tRNA thiolase  32.79 
 
 		 290 aa  155  4e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4497  C32 tRNA thiolase  35.95 
 
 		 310 aa  155  5.0000000000000005e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2211  C32 tRNA thiolase  35.95 
 
 		 310 aa  155  5.0000000000000005e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000587998  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2316  C32 tRNA thiolase  36.05 
 
 		 311 aa  154  1e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.415676  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2225  C32 tRNA thiolase  33.74 
 
 		 310 aa  154  1e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.28353 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2016  C32 tRNA thiolase  35.37 
 
 		 322 aa  154  1e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000499451 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1959  C32 tRNA thiolase  35.37 
 
 		 322 aa  154  1e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00791076 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2117  C32 tRNA thiolase  35.37 
 
 		 322 aa  154  1e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0387293 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4231  PP-loop domain-containing protein  36.64 
 
 		 310 aa  154  2e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.92927  normal  0.191142 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2224  C32 tRNA thiolase  35.54 
 
 		 311 aa  153  2e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00242897  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1573  C32 tRNA thiolase  36.48 
 
 		 307 aa  153  2e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.539766  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2142  C32 tRNA thiolase  35.8 
 
 		 311 aa  153  2e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.614557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2607  C32 tRNA thiolase  36.05 
 
 		 310 aa  153  2e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.560057 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2230  PP-loop domain-containing protein  36.05 
 
 		 279 aa  154  2e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.259403  normal  0.653141 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0509  C32 tRNA thiolase  35.8 
 
 		 298 aa  153  2e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.252102  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1949  C32 tRNA thiolase  35.62 
 
 		 310 aa  153  2e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2598  C32 tRNA thiolase  36.05 
 
 		 311 aa  153  2e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1596  ATPase  35.66 
 
 		 302 aa  153  2.9999999999999998e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.612685  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1738  C32 tRNA thiolase  36.97 
 
 		 313 aa  152  2.9999999999999998e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1746  PP-loop family protein  35.08 
 
 		 345 aa  152  2.9999999999999998e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0604543  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1477  PP-loop family protein  35.08 
 
 		 345 aa  152  2.9999999999999998e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.170101  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1793  C32 tRNA thiolase  34.98 
 
 		 302 aa  152  2.9999999999999998e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2354  C32 tRNA thiolase  34.3 
 
 		 310 aa  152  4e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1896  C32 tRNA thiolase  35.12 
 
 		 289 aa  152  4e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.318261 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2064  PP-loop superfamily ATPase  38.36 
 
 		 318 aa  152  4e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1993  C32 tRNA thiolase  36.21 
 
 		 302 aa  152  5e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1463  PP-loop domain-containing protein  36.44 
 
 		 316 aa  151  8e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2221  C32 tRNA thiolase  35.12 
 
 		 316 aa  151  1e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4143  C32 tRNA thiolase  34.55 
 
 		 287 aa  151  1e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003477  tRNA(Cytosine32)-2-thiocytidine synthetase  34.16 
 
 		 297 aa  151  1e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0168289  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1995  C32 tRNA thiolase  36.05 
 
 		 317 aa  151  1e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0619881  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0228  C32 tRNA thiolase  34.68 
 
 		 303 aa  151  1e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.608428 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1778  C32 tRNA thiolase  36.55 
 
 		 311 aa  150  1e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.446502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3479  C32 tRNA thiolase  33.33 
 
 		 258 aa  150  2e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.101099  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2223  PP-loop domain-containing protein  36.94 
 
 		 264 aa  150  2e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2020  C32 tRNA thiolase  36.18 
 
 		 312 aa  150  2e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01321  predicted C32 tRNA thiolase  35.62 
 
 		 311 aa  150  3e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2299  PP-loop domain protein  35.62 
 
 		 311 aa  149  3e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00162169  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1461  C32 tRNA thiolase  35.62 
 
 		 311 aa  149  3e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2281  C32 tRNA thiolase  35.62 
 
 		 311 aa  149  3e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.787518  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1993  C32 tRNA thiolase  35.62 
 
 		 311 aa  149  3e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.800343 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1558  C32 tRNA thiolase  35.62 
 
 		 311 aa  149  3e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01331  hypothetical protein  35.62 
 
 		 311 aa  150  3e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3499  C32 tRNA thiolase  33.61 
 
 		 269 aa  149  3e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00810912  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2415  C32 tRNA thiolase  36.29 
 
 		 319 aa  149  4e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.170221  decreased coverage  0.000000170238 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4186  C32 tRNA thiolase  35.19 
 
 		 274 aa  149  5e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.610238  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1589  C32 tRNA thiolase  36.55 
 
 		 311 aa  149  5e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1238  PP-loop domain protein  39.66 
 
 		 283 aa  149  5e-35  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33230  C32 tRNA thiolase  33.33 
 
 		 274 aa  149  5e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.259091  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02293  C32 tRNA thiolase  33.74 
 
 		 297 aa  149  5e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48870  C32 tRNA thiolase  35.19 
 
 		 274 aa  149  5e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000116894  hitchhiker  0.0000000652379 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1708  PP-loop domain protein  36.21 
 
 		 302 aa  149  6e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>