142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0649 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_0649  50S ribosomal protein L33  100 
 
 		 60 aa  120  5e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2140  ribosomal protein L33  80 
 
 		 60 aa  103  9e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00792155  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3088  ribosomal protein L33  76.67 
 
 		 60 aa  100  7e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.174245  normal  0.0267836 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4982  50S ribosomal protein L33  75 
 
 		 60 aa  100  7e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3609  ribosomal protein L33  73.33 
 
 		 60 aa  98.6  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.570356 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13558  50S ribosomal protein L33  75 
 
 		 60 aa  98.6  2e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3522  ribosomal protein L33  75 
 
 		 60 aa  97.8  5e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5352  ribosomal protein L33  77.05 
 
 		 61 aa  91.7  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1959  50S ribosomal protein L33  70.97 
 
 		 62 aa  91.3  4e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0571  hypothetical protein  72.13 
 
 		 61 aa  89  2e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0020  ribosomal protein L33  61.29 
 
 		 57 aa  77  0.00000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29405  predicted protein  56.9 
 
 		 97 aa  75.1  0.0000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0687421  normal  0.212032 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1500  50S ribosomal protein L33  61.67 
 
 		 59 aa  68.9  0.00000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.000000000133307  normal  0.765862 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10121  50S ribosomal protein L33  56.92 
 
 		 65 aa  67  0.00000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.146054  hitchhiker  0.000929045 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0339  50S ribosomal protein L33  56.92 
 
 		 65 aa  66.2  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0383685  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0931  50S ribosomal protein L33  56.25 
 
 		 64 aa  66.6  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.479255  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09921  50S ribosomal protein L33  56.25 
 
 		 64 aa  66.6  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09511  50S ribosomal protein L33  56.25 
 
 		 64 aa  65.9  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08941  50S ribosomal protein L33  55.38 
 
 		 65 aa  65.5  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.330509  decreased coverage  0.000000158972 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2956  ribosomal protein L33  57.41 
 
 		 49 aa  62  0.000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000537261  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0518  ribosomal protein L33  55.56 
 
 		 49 aa  60.8  0.000000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1349  50S ribosomal protein L33  59.02 
 
 		 60 aa  60.5  0.000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.000000000321816  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1554  50S ribosomal protein L33  59.02 
 
 		 60 aa  60.1  0.000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000411088  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1136  50S ribosomal protein L33  51.52 
 
 		 66 aa  57.4  0.00000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0863139  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3097  50S ribosomal protein L33  50 
 
 		 64 aa  57.8  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1320  50S ribosomal protein L33  53.12 
 
 		 64 aa  57  0.00000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000127873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1587  50S ribosomal protein L33  51.52 
 
 		 66 aa  56.6  0.0000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.198749  hitchhiker  0.00724458 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5172  50S ribosomal protein L33  53.12 
 
 		 64 aa  56.2  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.566722  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1338  50S ribosomal protein L33  53.12 
 
 		 64 aa  55.8  0.0000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.161899 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1122  50S ribosomal protein L33  53.12 
 
 		 64 aa  55.5  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.529669  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1396  50S ribosomal protein L33  51.85 
 
 		 49 aa  55.1  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000827111  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1423  50S ribosomal protein L33  51.85 
 
 		 49 aa  55.1  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000766493  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09901  50S ribosomal protein L33  52.73 
 
 		 55 aa  54.3  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0904  50S ribosomal protein L33  50 
 
 		 49 aa  54.3  0.0000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1671  50S ribosomal protein L33  50 
 
 		 56 aa  53.5  0.0000008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00190063  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1688  50S ribosomal protein L33  50 
 
 		 64 aa  53.9  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1670  50S ribosomal protein L33  50 
 
 		 64 aa  53.9  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3728  50S ribosomal protein L33  48.33 
 
 		 62 aa  53.5  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0638325 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4590  ribosomal protein L33  56.86 
 
 		 54 aa  53.1  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0095  50S ribosomal protein L33  52.83 
 
 		 57 aa  53.1  0.000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0975  50S ribosomal protein L33  63.33 
 
 		 59 aa  52  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.262128  normal  0.195912 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1534  50S ribosomal protein L33  46.67 
 
 		 54 aa  51.6  0.000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000000298593  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14791  50S ribosomal protein L33  48.48 
 
 		 66 aa  51.2  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.117879 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1116  50S ribosomal protein L33  46.3 
 
 		 49 aa  50.4  0.000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1008  50S ribosomal protein L33  44.07 
 
 		 54 aa  49.7  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0013488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3067  50S ribosomal protein L33  48.15 
 
 		 49 aa  50.1  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.212936  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4424  50S ribosomal protein L33  46.3 
 
 		 49 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4240  50S ribosomal protein L33  46.3 
 
 		 49 aa  49.3  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4570  50S ribosomal protein L33  46.3 
 
 		 49 aa  49.3  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2475  50S ribosomal protein L33P  48.15 
 
 		 49 aa  49.7  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000110121  decreased coverage  0.000947094 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1609  50S ribosomal protein L33  46.3 
 
 		 49 aa  49.3  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.353079  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1643  50S ribosomal protein L33  46.3 
 
 		 49 aa  49.3  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.274003  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4475  50S ribosomal protein L33  46.3 
 
 		 49 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4462  50S ribosomal protein L33  46.3 
 
 		 49 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.228819  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0775  50S ribosomal protein L33  46.3 
 
 		 49 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.089249 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4421  50S ribosomal protein L33  46.3 
 
 		 49 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3334  50S ribosomal protein L33  40.68 
 
 		 54 aa  48.1  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.178171  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0208  ribosomal protein L33  48.15 
 
 		 78 aa  47.4  0.00006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000103911  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1680  50S ribosomal protein L33  44.26 
 
 		 55 aa  47.4  0.00006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0187  50S ribosomal protein L33  44.44 
 
 		 49 aa  47.4  0.00007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1725  50S ribosomal protein L33  62.3 
 
 		 60 aa  47  0.00008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1110  50S ribosomal protein L33  60.66 
 
 		 60 aa  46.6  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0441  50S ribosomal protein L33  51.85 
 
 		 52 aa  46.6  0.0001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000206141  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3241  50S ribosomal protein L33  38.98 
 
 		 54 aa  46.2  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.373384  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2385  ribosomal protein L33  44.44 
 
 		 49 aa  46.2  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.60269  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0521  50S ribosomal protein L33  50 
 
 		 52 aa  45.4  0.0002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.265161  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0645  50S ribosomal protein L33  47.46 
 
 		 55 aa  46.2  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.221759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1826  ribosomal protein L33  38.33 
 
 		 54 aa  46.2  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1951  ribosomal protein L33  50 
 
 		 58 aa  46.2  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.000000159206  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0500  50S ribosomal protein L33  50 
 
 		 52 aa  45.4  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00000000100015  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2689  ribosomal protein L33  46.3 
 
 		 54 aa  45.4  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00155848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1464  50S ribosomal protein L33  50 
 
 		 52 aa  45.4  0.0003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000282952  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1649  50S ribosomal protein L33  59.02 
 
 		 60 aa  45.1  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000248156  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0383  ribosomal protein L33  38.33 
 
 		 54 aa  45.1  0.0003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.192931  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1361  50S ribosomal protein L33  46.3 
 
 		 49 aa  44.7  0.0005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00000386724  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4531  ribosomal protein L33  40 
 
 		 54 aa  44.3  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0239  ribosomal protein L33  40.32 
 
 		 56 aa  44.3  0.0006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0752  ribosomal protein L33  40.98 
 
 		 56 aa  43.9  0.0007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.525101 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4346  50S ribosomal protein L33  44.44 
 
 		 49 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4168  50S ribosomal protein L33  44.44 
 
 		 49 aa  43.9  0.0008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4490  50S ribosomal protein L33  44.44 
 
 		 49 aa  43.9  0.0008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4119  50S ribosomal protein L33  44.44 
 
 		 49 aa  43.9  0.0008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4399  50S ribosomal protein L33  44.44 
 
 		 49 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4380  50S ribosomal protein L33  44.44 
 
 		 49 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1448  50S ribosomal protein L33  48.15 
 
 		 49 aa  43.9  0.0008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0854  50S ribosomal protein L33  44.44 
 
 		 49 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4286  50S ribosomal protein L33  44.44 
 
 		 49 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.664529 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2729  50S ribosomal protein L33  44.44 
 
 		 49 aa  43.5  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000000221707  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2415  50S ribosomal protein L33  44.44 
 
 		 52 aa  43.1  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.0000000000282582  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0076  50S ribosomal protein L33  40.74 
 
 		 49 aa  43.1  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000000689148  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1029  50S ribosomal protein L33  43.33 
 
 		 54 aa  43.5  0.001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000770423  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1386  50S ribosomal protein L33  42.31 
 
 		 49 aa  43.1  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  2.61709e-16  hitchhiker  2.76351e-16 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2994  50S ribosomal protein L33  42.59 
 
 		 49 aa  43.1  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21410  LSU ribosomal protein L33P  38.71 
 
 		 56 aa  42.7  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00000944878  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1377  ribosomal protein L33  40.74 
 
 		 49 aa  43.5  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000000360963  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0305  ribosomal protein L33  40.74 
 
 		 49 aa  43.5  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000123978  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1932  ribosomal protein L33  40.74 
 
 		 49 aa  42.4  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000219423  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1954  50S ribosomal protein L33  38.89 
 
 		 49 aa  42.7  0.002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000217795  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0630  ribosomal protein L33  37.7 
 
 		 56 aa  42.4  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000311792 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0403  50S ribosomal protein L33  42.59 
 
 		 49 aa  42.4  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  1.1461e-16  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>