More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0020 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0020  ribosomal protein L33  100 
 
 		 57 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3609  ribosomal protein L33  69.35 
 
 		 60 aa  85.1  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.570356 
 
 
-
 
NC_002950  PG1959  50S ribosomal protein L33  69.35 
 
 		 62 aa  84.3  5e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13558  50S ribosomal protein L33  64.52 
 
 		 60 aa  83.6  9e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4982  50S ribosomal protein L33  62.9 
 
 		 60 aa  82  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3088  ribosomal protein L33  66.13 
 
 		 60 aa  82  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.174245  normal  0.0267836 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2140  ribosomal protein L33  62.9 
 
 		 60 aa  81.6  0.000000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00792155  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5352  ribosomal protein L33  62.9 
 
 		 61 aa  79  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3522  ribosomal protein L33  64.52 
 
 		 60 aa  77.4  0.00000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0649  50S ribosomal protein L33  61.29 
 
 		 60 aa  77  0.00000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29405  predicted protein  62.3 
 
 		 97 aa  75.9  0.0000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0687421  normal  0.212032 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0571  hypothetical protein  59.68 
 
 		 61 aa  72.4  0.000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1349  50S ribosomal protein L33  60.34 
 
 		 60 aa  70.5  0.000000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.000000000321816  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2956  ribosomal protein L33  68 
 
 		 49 aa  66.2  0.0000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000537261  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1554  50S ribosomal protein L33  56.9 
 
 		 60 aa  66.2  0.0000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000411088  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0931  50S ribosomal protein L33  57.58 
 
 		 64 aa  65.5  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.479255  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5172  50S ribosomal protein L33  53.23 
 
 		 64 aa  65.1  0.0000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.566722  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0518  ribosomal protein L33  67.35 
 
 		 49 aa  65.1  0.0000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09921  50S ribosomal protein L33  57.58 
 
 		 64 aa  65.5  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1500  50S ribosomal protein L33  57.38 
 
 		 59 aa  64.3  0.0000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.000000000133307  normal  0.765862 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1688  50S ribosomal protein L33  50 
 
 		 64 aa  63.9  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1670  50S ribosomal protein L33  50 
 
 		 64 aa  63.9  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08941  50S ribosomal protein L33  53.73 
 
 		 65 aa  63.2  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.330509  decreased coverage  0.000000158972 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09511  50S ribosomal protein L33  54.55 
 
 		 64 aa  63.2  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1320  50S ribosomal protein L33  51.61 
 
 		 64 aa  62.8  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000127873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1587  50S ribosomal protein L33  54.69 
 
 		 66 aa  62.8  0.000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.198749  hitchhiker  0.00724458 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1122  50S ribosomal protein L33  50 
 
 		 64 aa  62.4  0.000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.529669  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0339  50S ribosomal protein L33  52.24 
 
 		 65 aa  61.2  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0383685  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10121  50S ribosomal protein L33  52.24 
 
 		 65 aa  61.2  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.146054  hitchhiker  0.000929045 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1932  ribosomal protein L33  65.31 
 
 		 49 aa  60.8  0.000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000219423  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1136  50S ribosomal protein L33  50 
 
 		 66 aa  59.7  0.00000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0863139  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0095  50S ribosomal protein L33  61.54 
 
 		 57 aa  59.3  0.00000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3097  50S ribosomal protein L33  49.23 
 
 		 64 aa  58.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2689  ribosomal protein L33  50.94 
 
 		 54 aa  58.5  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00155848  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1534  50S ribosomal protein L33  54.39 
 
 		 54 aa  57.8  0.00000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000000298593  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0239  ribosomal protein L33  50.88 
 
 		 56 aa  57.8  0.00000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1338  50S ribosomal protein L33  46.77 
 
 		 64 aa  57.8  0.00000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.161899 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1396  50S ribosomal protein L33  57.14 
 
 		 49 aa  57.4  0.00000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000827111  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1423  50S ribosomal protein L33  57.14 
 
 		 49 aa  57.4  0.00000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000766493  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3241  50S ribosomal protein L33  56.14 
 
 		 54 aa  57.8  0.00000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.373384  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3728  50S ribosomal protein L33  47.54 
 
 		 62 aa  57.4  0.00000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0638325 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3334  50S ribosomal protein L33  53.57 
 
 		 54 aa  57  0.00000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.178171  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0904  50S ribosomal protein L33  55.1 
 
 		 49 aa  57  0.00000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09901  50S ribosomal protein L33  54.55 
 
 		 55 aa  56.6  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1008  50S ribosomal protein L33  53.57 
 
 		 54 aa  56.6  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0013488  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1826  ribosomal protein L33  59.62 
 
 		 54 aa  56.6  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2694  ribosomal protein L33  45.61 
 
 		 56 aa  55.1  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3067  50S ribosomal protein L33  57.14 
 
 		 49 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.212936  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4421  50S ribosomal protein L33  55.1 
 
 		 49 aa  54.3  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4424  50S ribosomal protein L33  55.1 
 
 		 49 aa  54.3  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4240  50S ribosomal protein L33  55.1 
 
 		 49 aa  54.3  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6366  50S ribosomal protein L33  43.86 
 
 		 56 aa  54.3  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.747023  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4462  50S ribosomal protein L33  55.1 
 
 		 49 aa  54.3  0.0000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.228819  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4570  50S ribosomal protein L33  55.1 
 
 		 49 aa  54.3  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4590  ribosomal protein L33  54 
 
 		 54 aa  54.3  0.0000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0775  50S ribosomal protein L33  55.1 
 
 		 49 aa  54.3  0.0000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.089249 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4475  50S ribosomal protein L33  55.1 
 
 		 49 aa  54.3  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0187  50S ribosomal protein L33  57.14 
 
 		 49 aa  54.3  0.0000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0668  50S ribosomal protein L33  45.61 
 
 		 56 aa  53.9  0.0000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0319237  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0398  50S ribosomal protein L33  50.88 
 
 		 59 aa  53.5  0.0000008  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.0000285093  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1377  ribosomal protein L33  55.1 
 
 		 49 aa  53.5  0.0000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000000360963  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1116  50S ribosomal protein L33  53.06 
 
 		 49 aa  52.8  0.000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1110  50S ribosomal protein L33  60.34 
 
 		 60 aa  53.1  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21410  LSU ribosomal protein L33P  43.86 
 
 		 56 aa  53.1  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00000944878  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1649  50S ribosomal protein L33  58.62 
 
 		 60 aa  52.8  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000248156  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1671  50S ribosomal protein L33  45.61 
 
 		 56 aa  52.8  0.000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00190063  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001819  LSU ribosomal protein L33p  39.66 
 
 		 56 aa  52.8  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000000810994  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0521  50S ribosomal protein L33  53.06 
 
 		 52 aa  52  0.000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.265161  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2110  50S ribosomal protein L33  53.06 
 
 		 49 aa  52  0.000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.341576  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00655  50S ribosomal protein L33  39.66 
 
 		 56 aa  52.8  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0645  50S ribosomal protein L33  50.88 
 
 		 55 aa  52.4  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.221759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2642  50S ribosomal protein L33P  53.33 
 
 		 51 aa  52.4  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1954  50S ribosomal protein L33  53.06 
 
 		 49 aa  52.8  0.000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000217795  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1725  50S ribosomal protein L33  58.62 
 
 		 60 aa  52.8  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1448  50S ribosomal protein L33  51.02 
 
 		 49 aa  52.8  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0446  50S ribosomal protein L33  53.06 
 
 		 49 aa  52.8  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0500  50S ribosomal protein L33  53.06 
 
 		 52 aa  52  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00000000100015  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2313  ribosomal protein L33  47.17 
 
 		 56 aa  52.4  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2385  ribosomal protein L33  53.06 
 
 		 49 aa  51.6  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.60269  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21200  LSU ribosomal protein L33P  43.86 
 
 		 56 aa  51.6  0.000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0383  ribosomal protein L33  50.88 
 
 		 54 aa  51.6  0.000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.192931  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1183  50S ribosomal protein L33  45.28 
 
 		 54 aa  51.2  0.000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00129055  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4531  ribosomal protein L33  47.06 
 
 		 54 aa  51.2  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0441  50S ribosomal protein L33  51.02 
 
 		 52 aa  51.6  0.000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000206141  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36490  LSU ribosomal protein L33P  52.73 
 
 		 56 aa  51.6  0.000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.598182 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0630  ribosomal protein L33  39.66 
 
 		 56 aa  51.2  0.000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000311792 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1680  50S ribosomal protein L33  48.15 
 
 		 55 aa  51.2  0.000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1464  50S ribosomal protein L33  51.02 
 
 		 52 aa  51.2  0.000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000282952  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2079  50S ribosomal protein L33  44.9 
 
 		 49 aa  50.8  0.000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.958613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1386  50S ribosomal protein L33  55.32 
 
 		 49 aa  50.8  0.000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  2.61709e-16  hitchhiker  2.76351e-16 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1629  50S ribosomal protein L33  48.98 
 
 		 49 aa  50.8  0.000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1252  50S ribosomal protein L33  47.17 
 
 		 55 aa  50.8  0.000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0598  ribosomal protein L33  43.86 
 
 		 56 aa  50.8  0.000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.761553  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1951  ribosomal protein L33  46.81 
 
 		 58 aa  50.4  0.000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.000000159206  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03239  50S ribosomal protein L33  38.89 
 
 		 55 aa  50.4  0.000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0076  50S ribosomal protein L33  51.02 
 
 		 49 aa  50.4  0.000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000000689148  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0190  50S ribosomal protein L33  43.4 
 
 		 55 aa  50.1  0.000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.00000760061  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07670  LSU ribosomal protein L33P  43.86 
 
 		 56 aa  50.1  0.000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.797929  normal  0.041948 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00056  50S ribosomal protein L33  42.22 
 
 		 51 aa  50.1  0.000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000125174  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2729  50S ribosomal protein L33  48.98 
 
 		 49 aa  49.7  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000000221707  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>